BACT000042 (rplM) allele sequence: id-368
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCCCACGGAA AAAGAACAGG GAGAGCCTGC ACCGCGCCTC GAAGCGCACA CAGACAAGCA GGAAGAACAC ATCGGGCAAA GCAATTTTTT TGGATCGATC ATGAAGACGT TTTCCGCAAA AGCCCATGAG GTGACGCGCG AATGGTACGT GATTGACGCG ACGGATAAGG TTCTCGGCCG TGTCGCCAGC GAAGTGGCAC GCCGTCTGCG CGGCAAGCAC AAGCCTGAGT TCACCCCGCA CGTCGACACC GGTGATTTCA TCATCGTCAT CAACGCGAGC AAGTTGAAGG TCACGGGCAA CAAGACTCTG GACAAGAAGT ACTACCGTCA CTCGGGCTAC CCGGGCGGTA TCTATGAAAC GACGTTCGGC AAGATGCAGG AACGCTTCCC GGGCCGTGCG CTCGAGAAGG CGGTCAAGGG CATGCTGCCG AAGGGCCCGC TCGGCTACGC GATGATCAAG AAGCTGAAGG TCTACGCAGA AGCGACGCAT CCGCACTCGG CTCAACAGCC GAAGGCGCTC GAGATCTAAG GGGAGCCCAC ATGATCGGTA ACTGGAACTA CGGTACGGGC CGCCGCAAGA GCGCAGTCGC TCGTGTCTTC ATCAAGGCTG GCAAGGGCGA CATCATCGT
Translation
A H G K R T G R A C T A P R S A H R Q A G R T H R A K Q F F W I D H F1
P T E K E Q G E P A P R L E A H T D K Q E E H I G Q S N F F G S I F2
P R K K N R E S L H R A S K R T Q T S R K N T S G K A I F L D R S F3
1 GCCCACGGAAAAAGAACAGGGAGAGCCTGCACCGCGCCTCGAAGCGCACACAGACAAGCAGGAAGAACACATCGGGCAAAGCAATTTTTTTGGATCGATC 100
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E D V F R K S P * G D A R M V R D * R D G * G S R P C R Q R S G T F1
M K T F S A K A H E V T R E W Y V I D A T D K V L G R V A S E V A R F2
* R R F P Q K P M R * R A N G T * L T R R I R F S A V S P A K W H F3
101 ATGAAGACGTTTTCCGCAAAAGCCCATGAGGTGACGCGCGAATGGTACGTGATTGACGCGACGGATAAGGTTCTCGGCCGTGTCGCCAGCGAAGTGGCAC 200
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P S A R Q A Q A * V H P A R R H R * F H H R H Q R E Q V E G H G Q F1
R L R G K H K P E F T P H V D T G D F I I V I N A S K L K V T G N F2
A V C A A S T S L S S P R T S T P V I S S S S S T R A S * R S R A T F3
201 GCCGTCTGCGCGGCAAGCACAAGCCTGAGTTCACCCCGCACGTCGACACCGGTGATTTCATCATCGTCATCAACGCGAGCAAGTTGAAGGTCACGGGCAA 300
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Q D S G Q E V L P S L G L P G R Y L * N D V R Q D A G T L P G P C A F1
K T L D K K Y Y R H S G Y P G G I Y E T T F G K M Q E R F P G R A F2
R L W T R S T T V T R A T R A V S M K R R S A R C R N A S R A V R F3
301 CAAGACTCTGGACAAGAAGTACTACCGTCACTCGGGCTACCCGGGCGGTATCTATGAAACGACGTTCGGCAAGATGCAGGAACGCTTCCCGGGCCGTGCG 400
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R E G G Q G H A A E G P A R L R D D Q E A E G L R R S D A S A L G F1
L E K A V K G M L P K G P L G Y A M I K K L K V Y A E A T H P H S A F2
S R R R S R A C C R R A R S A T R * S R S * R S T Q K R R I R T R F3
401 CTCGAGAAGGCGGTCAAGGGCATGCTGCCGAAGGGCCCGCTCGGCTACGCGATGATCAAGAAGCTGAAGGTCTACGCAGAAGCGACGCATCCGCACTCGG 500
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S T A E G A R D L R G A H M I G N W N Y G T G R R K S A V A R V F F1
Q Q P K A L E I * G E P T * S V T G T T V R A A A R A Q S L V S S F2
L N S R R R S R S K G S P H D R * L E L R Y G P P Q E R S R S C L H F3
501 CTCAACAGCCGAAGGCGCTCGAGATCTAAGGGGAGCCCACATGATCGGTAACTGGAACTACGGTACGGGCCGCCGCAAGAGCGCAGTCGCTCGTGTCTTC 600
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I K A G K G D I I V F1
S R L A R A T S S X F2
Q G W Q G R H H R F3
601 ATCAAGGCTGGCAAGGGCGACATCATCGT 629
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