BACT000040 (rplK) allele sequence: id-368
Contig position
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- 3676
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- 4506
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- 432
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- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TTACGGCCCG CGTCATGGTC GTTGAGGAGC GTCAGTAGCC AGCGGCGAAC GCGCGTTATC ACTCACCGAA CGCCGCTTGG CGTTCCAACG AGGTTTTCAA ATGGCAAAGA AGATTGTCGG CTTTATCAAG CTGCAGATTC CTGCAGGTAA AGCCAACCCG TCGCCGCCGG TCGGTCCGGC ACTGGGCCAG CGCGGCCTGA ACATCATGGA GTTCTGCAAG GCGTTCAACG CGCAGACTCA AGGTATGGAG CCGGGTCTGC CGGTGCCGGT CGTCATCACG GCATACGCTG ACAAGAGCTT CACGTTCGTG ATGAAGACGC CGCCGGCGAC CGTCCTGATC AAGAAGGCGG CGAAGGTGGA CAAGGGCTCG AGCAAGCCGC ACACCGACAA GGTCGGTTCG ATCACGCGCG CTCAAGCCGA AGAAATCGCA AAGACGAAGA TGCCGGACCT CACGGCAGCT GATCTGGACG CAGCCGTTCG CACCATCGCT GGTAGCGCAC GCTCGATGGG CATCACTGTG GAGGGCGTGT AAATGGCTAA GATCTCCAAG CGCCGTCAGG CATTTGCCGC CAAGGTCGAC CGTCAGAAGC TGTACGCGAT CGACGACGCA CTGGCACTCG TGAAGGAATG CG
Translation
L R P A S W S L R S V S S Q R R T R V I T H R T P L G V P T R F S N F1
Y G P R H G R * G A S V A S G E R A L S L T E R R L A F Q R G F Q F2
T A R V M V V E E R Q * P A A N A R Y H S P N A A W R S N E V F K F3
1 TTACGGCCCGCGTCATGGTCGTTGAGGAGCGTCAGTAGCCAGCGGCGAACGCGCGTTATCACTCACCGAACGCCGCTTGGCGTTCCAACGAGGTTTTCAA 100
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G K E D C R L Y Q A A D S C R * S Q P V A A G R S G T G P A R P E F1
M A K K I V G F I K L Q I P A G K A N P S P P V G P A L G Q R G L N F2
W Q R R L S A L S S C R F L Q V K P T R R R R S V R H W A S A A * F3
101 ATGGCAAAGAAGATTGTCGGCTTTATCAAGCTGCAGATTCCTGCAGGTAAAGCCAACCCGTCGCCGCCGGTCGGTCCGGCACTGGGCCAGCGCGGCCTGA 200
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H H G V L Q G V Q R A D S R Y G A G S A G A G R H H G I R * Q E L F1
I M E F C K A F N A Q T Q G M E P G L P V P V V I T A Y A D K S F F2
T S W S S A R R S T R R L K V W S R V C R C R S S S R H T L T R A S F3
201 ACATCATGGAGTTCTGCAAGGCGTTCAACGCGCAGACTCAAGGTATGGAGCCGGGTCTGCCGGTGCCGGTCGTCATCACGGCATACGCTGACAAGAGCTT 300
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H V R D E D A A G D R P D Q E G G E G G Q G L E Q A A H R Q G R F D F1
T F V M K T P P A T V L I K K A A K V D K G S S K P H T D K V G S F2
R S * * R R R R R P S * S R R R R R W T R A R A S R T P T R S V R F3
301 CACGTTCGTGATGAAGACGCCGCCGGCGACCGTCCTGATCAAGAAGGCGGCGAAGGTGGACAAGGGCTCGAGCAAGCCGCACACCGACAAGGTCGGTTCG 400
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H A R S S R R N R K D E D A G P H G S * S G R S R S H H R W * R T F1
I T R A Q A E E I A K T K M P D L T A A D L D A A V R T I A G S A R F2
S R A L K P K K S Q R R R C R T S R Q L I W T Q P F A P S L V A H F3
401 ATCACGCGCGCTCAAGCCGAAGAAATCGCAAAGACGAAGATGCCGGACCTCACGGCAGCTGATCTGGACGCAGCCGTTCGCACCATCGCTGGTAGCGCAC 500
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L D G H H C G G R V N G * D L Q A P S G I C R Q G R P S E A V R D F1
S M G I T V E G V * M A K I S K R R Q A F A A K V D R Q K L Y A I F2
A R W A S L W R A C K W L R S P S A V R H L P P R S T V R S C T R S F3
501 GCTCGATGGGCATCACTGTGGAGGGCGTGTAAATGGCTAAGATCTCCAAGCGCCGTCAGGCATTTGCCGCCAAGGTCGACCGTCAGAAGCTGTACGCGAT 600
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R R R T G T R E G M R F1
D D A L A L V K E C X F2
T T H W H S * R N A F3
601 CGACGACGCACTGGCACTCGTGAAGGAATGCG 632
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