BACT000038 (rplI) allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3703
contig length
955088
start
529472
end
529924
length
453
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCAGCTGGAC ACGGCAATCA AGCGCGCACG CTTCCTCGCG CTGCTGCCGT ACACCGATCA GCACAAGGCG TAATCAGGCG ACGCAATAAG GAGAATTCGA ATGCAAATCA TTCTGTTGGA AAAAGTCGCC AATCTGGGCA ACCTCGGCGA TATCGTCAAG GTCAAGGACG GTTACGCTCG CAACTTCCTG ATCCCGAACC GCAAGGCTCG CCGTGCGACG AAGGAAGCGA TCGCCGAATT CGAAGTGCGC CGTGCAGAGC TCGAGAAGAT CGCCGCTGAA AAGCTGGCGG CTTCGCAGGC TGTCGGCGAG AAGCTGAACG GCCAGTCGTT CGAAATCACG CAGAAGTCGG GCGTGGACGG CCGTCTGTTC GGCTCGGTCA CGAACGCGGA CGTCGCGGAA CTGCTGAAGA AGGCCGGCTT CGATGTCGAG AAGTCGCAGG TTCGCATGCC GGAAGGCCCG CTGAAGATGA TCGGCGAGCA CGGCGTTCAG GTCGCGCTGC ATACGGACGT CGTCGTCGAC GTCACGATCA ACGTGATCGG CGACCACGCG TAAGCGTACG CAATACTTGC CGGGCGGCAC ACGCCGCCCG GACAGGGGCA GGCGCCCGGG CAACCGGGGC CTGCCTTTTT TGTTGGCCGA TCGCCGGCGA CGA

Translation


          S  A  G  H  G  N  Q  A  R  T  L  P  R  A  A  A  V  H  R  S  A  Q  G  V  I  R  R  R  N  K  E  N  S  N   F1
           Q  L  D  T  A  I  K  R  A  R  F  L  A  L  L  P  Y  T  D  Q  H  K  A  *  S  G  D  A  I  R  R  I  R     F2
            S  W  T  R  Q  S  S  A  H  A  S  S  R  C  C  R  T  P  I  S  T  R  R  N  Q  A  T  Q  *  G  E  F  E    F3
        1 TCAGCTGGACACGGCAATCAAGCGCGCACGCTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATTCGA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  H  S  V  G  K  S  R  Q  S  G  Q  P  R  R  Y  R  Q  G  Q  G  R  L  R  S  Q  L  P  D  P  E  P    F1
          M  Q  I  I  L  L  E  K  V  A  N  L  G  N  L  G  D  I  V  K  V  K  D  G  Y  A  R  N  F  L  I  P  N  R   F2
           C  K  S  F  C  W  K  K  S  P  I  W  A  T  S  A  I  S  S  R  S  R  T  V  T  L  A  T  S  *  S  R  T     F3
      101 ATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTTACGCTCGCAACTTCCTGATCCCGAACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  S  P  C  D  E  G  S  D  R  R  I  R  S  A  P  C  R  A  R  E  D  R  R  *  K  A  G  G  F  A  G     F1
            K  A  R  R  A  T  K  E  A  I  A  E  F  E  V  R  R  A  E  L  E  K  I  A  A  E  K  L  A  A  S  Q  A    F2
          A  R  L  A  V  R  R  R  K  R  S  P  N  S  K  C  A  V  Q  S  S  R  R  S  P  L  K  S  W  R  L  R  R  L   F3
      201 GCAAGGCTCGCCGTGCGACGAAGGAAGCGATCGCCGAATTCGAAGTGCGCCGTGCAGAGCTCGAGAAGATCGCCGCTGAAAAGCTGGCGGCTTCGCAGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          C  R  R  E  A  E  R  P  V  V  R  N  H  A  E  V  G  R  G  R  P  S  V  R  L  G  H  E  R  G  R  R  G  T   F1
           V  G  E  K  L  N  G  Q  S  F  E  I  T  Q  K  S  G  V  D  G  R  L  F  G  S  V  T  N  A  D  V  A  E     F2
            S  A  R  S  *  T  A  S  R  S  K  S  R  R  S  R  A  W  T  A  V  C  S  A  R  S  R  T  R  T  S  R  N    F3
      301 TGTCGGCGAGAAGCTGAACGGCCAGTCGTTCGAAATCACGCAGAAGTCGGGCGTGGACGGCCGTCTGTTCGGCTCGGTCACGAACGCGGACGTCGCGGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  E  E  G  R  L  R  C  R  E  V  A  G  S  H  A  G  R  P  A  E  D  D  R  R  A  R  R  S  G  R  A  A    F1
          L  L  K  K  A  G  F  D  V  E  K  S  Q  V  R  M  P  E  G  P  L  K  M  I  G  E  H  G  V  Q  V  A  L  H   F2
           C  *  R  R  P  A  S  M  S  R  S  R  R  F  A  C  R  K  A  R  *  R  *  S  A  S  T  A  F  R  S  R  C     F3
      401 CTGCTGAAGAAGGCCGGCTTCGATGTCGAGAAGTCGCAGGTTCGCATGCCGGAAGGCCCGCTGAAGATGATCGGCGAGCACGGCGTTCAGGTCGCGCTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Y  G  R  R  R  R  R  H  D  Q  R  D  R  R  P  R  V  S  V  R  N  T  C  R  A  A  H  A  A  R  T  G  A     F1
            T  D  V  V  V  D  V  T  I  N  V  I  G  D  H  A  *  A  Y  A  I  L  A  G  R  H  T  P  P  G  Q  G  Q    F2
          I  R  T  S  S  S  T  S  R  S  T  *  S  A  T  T  R  K  R  T  Q  Y  L  P  G  G  T  R  R  P  D  R  G  R   F3
      501 ATACGGACGTCGTCGTCGACGTCACGATCAACGTGATCGGCGACCACGCGTAAGCGTACGCAATACTTGCCGGGCGGCACACGCCGCCCGGACAGGGGCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  A  R  A  T  G  A  C  L  F  C  W  P  I  A  G  D  X                                                   F1
           A  P  G  Q  P  G  P  A  F  F  V  G  R  S  P  A  T  X                                                  F2
            R  P  G  N  R  G  L  P  F  L  L  A  D  R  R  R  R                                                    F3
      601 GGCGCCCGGGCAACCGGGGCCTGCCTTTTTTGTTGGCCGATCGCCGGCGACGA 653
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