BACT000035 (rplF) allele sequence: id-368
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
GTCGACGCCG AAGGGCGTGA TGACCGACCG CAAGGCGCGC GCAACGGGCG TCGGCGGCGA AGTCATCTGC TACGTCGCTT AAAGCCGAGG AGAGAGAAAC ATGTCTCGAG TAGGTAAGAG CCCGATCGCG CTGCAAGGCG CGGAAGTCAA GCTGGCCGAC GGCGTCATCA CCGTCAAGGG CCCGCTGGGC ACGATCACGC AAGCGGTGAA CCCGCTCGTG AAGGTGGCGA ACAACGACGG CACGCTGAAC CTGGCGCCGG CCGACGAAAG CCGCGAAGCA AATGCACTGT CGGGCACGAT GCGCGCGATC ATCGCGAATG CCGTGCACGG CGTGACCAAG GGTTTCGAGC GCAAGCTGAC GCTGGTTGGC GTCGGCTACC GTGCGCAAGC GCAAGGCGAC AAGCTGAACC TGTCGCTGGG TTTCTCGCAC CCGGTGGTGC ACCAGATGCC GGAAGGCGTC AAGGCTGAAA CCCCGACGCA AACCGAAATC GTGATCAAGG GGATCGACAA GCAGAAAGTC GGCCAAGTGG CTGCGGAAGT CCGCGGCTAC CGTCCGCCGG AGCCCTACAA GGGCAAGGGC GTGCGCTATG CCGACGAGGT TGTGATCCTC AAAGAAACGA AGAAGAAGTA AGGGTGCGCA ATCATGGATA AGACTCAATC TCGCCTGCGC CGCGCTCGCC AGACGCGTAT CAAGATCGCT GAGCTGCAGG TCGCGCGTCT CGCCGTGCAT C
Translation
V D A E G R D D R P Q G A R N G R R R R S H L L R R L K P R R E K H F1
S T P K G V M T D R K A R A T G V G G E V I C Y V A * S R G E R N F2
R R R R A * * P T A R R A Q R A S A A K S S A T S L K A E E R E T F3
1 GTCGACGCCGAAGGGCGTGATGACCGACCGCAAGGCGCGCGCAACGGGCGTCGGCGGCGAAGTCATCTGCTACGTCGCTTAAAGCCGAGGAGAGAGAAAC 100
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V S S R * E P D R A A R R G S Q A G R R R H H R Q G P A G H D H A F1
M S R V G K S P I A L Q G A E V K L A D G V I T V K G P L G T I T Q F2
C L E * V R A R S R C K A R K S S W P T A S S P S R A R W A R S R F3
101 ATGTCTCGAGTAGGTAAGAGCCCGATCGCGCTGCAAGGCGCGGAAGTCAAGCTGGCCGACGGCGTCATCACCGTCAAGGGCCCGCTGGGCACGATCACGC 200
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S G E P A R E G G E Q R R H A E P G A G R R K P R S K C T V G H D F1
A V N P L V K V A N N D G T L N L A P A D E S R E A N A L S G T M F2
K R * T R S * R W R T T T A R * T W R R P T K A A K Q M H C R A R C F3
201 AAGCGGTGAACCCGCTCGTGAAGGTGGCGAACAACGACGGCACGCTGAACCTGGCGCCGGCCGACGAAAGCCGCGAAGCAAATGCACTGTCGGGCACGAT 300
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A R D H R E C R A R R D Q G F R A Q A D A G W R R L P C A S A R R Q F1
R A I I A N A V H G V T K G F E R K L T L V G V G Y R A Q A Q G D F2
A R S S R M P C T A * P R V S S A S * R W L A S A T V R K R K A T F3
301 GCGCGCGATCATCGCGAATGCCGTGCACGGCGTGACCAAGGGTTTCGAGCGCAAGCTGACGCTGGTTGGCGTCGGCTACCGTGCGCAAGCGCAAGGCGAC 400
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A E P V A G F L A P G G A P D A G R R Q G * N P D A N R N R D Q G F1
K L N L S L G F S H P V V H Q M P E G V K A E T P T Q T E I V I K G F2
S * T C R W V S R T R W C T R C R K A S R L K P R R K P K S * S R F3
401 AAGCTGAACCTGTCGCTGGGTTTCTCGCACCCGGTGGTGCACCAGATGCCGGAAGGCGTCAAGGCTGAAACCCCGACGCAAACCGAAATCGTGATCAAGG 500
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D R Q A E S R P S G C G S P R L P S A G A L Q G Q G R A L C R R G F1
I D K Q K V G Q V A A E V R G Y R P P E P Y K G K G V R Y A D E V F2
G S T S R K S A K W L R K S A A T V R R S P T R A R A C A M P T R L F3
501 GGATCGACAAGCAGAAAGTCGGCCAAGTGGCTGCGGAAGTCCGCGGCTACCGTCCGCCGGAGCCCTACAAGGGCAAGGGCGTGCGCTATGCCGACGAGGT 600
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C D P Q R N E E E V R V R N H G * D S I S P A P R S P D A Y Q D R * F1
V I L K E T K K K * G C A I M D K T Q S R L R R A R Q T R I K I A F2
* S S K K R R R S K G A Q S W I R L N L A C A A L A R R V S R S L F3
601 TGTGATCCTCAAAGAAACGAAGAAGAAGTAAGGGTGCGCAATCATGGATAAGACTCAATCTCGCCTGCGCCGCGCTCGCCAGACGCGTATCAAGATCGCT 700
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A A G R A S R R A S F1
E L Q V A R L A V H X F2
S C R S R V S P C I F3
701 GAGCTGCAGGTCGCGCGTCTCGCCGTGCATC 731
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