BACT000034 (rplE) allele sequence: id-368
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
AAGGCGTCGC GTGTCGGCAT CAAGGTCGAG GAAGGCAAGA AGGTTCGCTT CCTGAAGACG ACCGGTGCCG TACTGAGCGC CTGACGCAGC GGAGTAAAAA ATGGCTCGTT TGCAAGAGTT TTACAAAGAA AAGGTTGTGC CCGGCCTGAT CGAGAAGTTC GGTTACAAGT CGGTCATGGA AGTGCCGCGC ATCACCAAGA TCACGCTGAA CATGGGTCTT GGCGAAGCCG TCGCGGACAA GAAGATCATC GAGAACGCCG TTGGCGACCT CACGAAGATC GCCGGCCAGA AGCCGGTCGT CACGAAGGCT CGCAAGGCAA TCGCAGGTTT CAAGATCCGC CAGGGTTACC CGATCGGCGC GATGGTGACG CTGCGTGGCC GTGCGATGTA CGAATTCCTC GACCGTCTGG TGACGGTTGC GCTGCCGCGC GTGCGTGACT TCCGCGGCGT GTCGGGTCGT GCATTCGATG GCCGTGGCAA CTACAACATC GGTGTGAAAG AGCAGATCAT TTTCCCCGAA ATCGATTACG ACAAGATCGA CGCGCTGCGT GGGCTGAACA TCAGCATCAC GACGACCGCG AAGACCGACG ACGAAGCAAA GGCGCTGCTC GCCAGCTTCA AGTTCCCGTT CAGAAACTGA GGTTACCGTG GCTAAACTGG CACTGATCGA ACGTGAAAAG AAGCGCGCCC GCCTGGTCGC GAAGTTCGCA GCAAAGCGCG AAGCGCTGAA GGCGATCATC
Translation
K A S R V G I K V E E G K K V R F L K T T G A V L S A * R S G V K N F1
R R R V S A S R S R K A R R F A S * R R P V P Y * A P D A A E * K F2
G V A C R H Q G R G R Q E G S L P E D D R C R T E R L T Q R S K K F3
1 AAGGCGTCGCGTGTCGGCATCAAGGTCGAGGAAGGCAAGAAGGTTCGCTTCCTGAAGACGACCGGTGCCGTACTGAGCGCCTGACGCAGCGGAGTAAAAA 100
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G S F A R V L Q R K G C A R P D R E V R L Q V G H G S A A H H Q D F1
M A R L Q E F Y K E K V V P G L I E K F G Y K S V M E V P R I T K I F2
W L V C K S F T K K R L C P A * S R S S V T S R S W K C R A S P R F3
101 ATGGCTCGTTTGCAAGAGTTTTACAAAGAAAAGGTTGTGCCCGGCCTGATCGAGAAGTTCGGTTACAAGTCGGTCATGGAAGTGCCGCGCATCACCAAGA 200
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H A E H G S W R S R R G Q E D H R E R R W R P H E D R R P E A G R F1
T L N M G L G E A V A D K K I I E N A V G D L T K I A G Q K P V V F2
S R * T W V L A K P S R T R R S S R T P L A T S R R S P A R S R S S F3
201 TCACGCTGAACATGGGTCTTGGCGAAGCCGTCGCGGACAAGAAGATCATCGAGAACGCCGTTGGCGACCTCACGAAGATCGCCGGCCAGAAGCCGGTCGT 300
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H E G S Q G N R R F Q D P P G L P D R R D G D A A W P C D V R I P R F1
T K A R K A I A G F K I R Q G Y P I G A M V T L R G R A M Y E F L F2
R R L A R Q S Q V S R S A R V T R S A R W * R C V A V R C T N S S F3
301 CACGAAGGCTCGCAAGGCAATCGCAGGTTTCAAGATCCGCCAGGGTTACCCGATCGGCGCGATGGTGACGCTGCGTGGCCGTGCGATGTACGAATTCCTC 400
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P S G D G C A A A R A * L P R R V G S C I R W P W Q L Q H R C E R F1
D R L V T V A L P R V R D F R G V S G R A F D G R G N Y N I G V K E F2
T V W * R L R C R A C V T S A A C R V V H S M A V A T T T S V * K F3
401 GACCGTCTGGTGACGGTTGCGCTGCCGCGCGTGCGTGACTTCCGCGGCGTGTCGGGTCGTGCATTCGATGGCCGTGGCAACTACAACATCGGTGTGAAAG 500
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A D H F P R N R L R Q D R R A A W A E H Q H H D D R E D R R R S K F1
Q I I F P E I D Y D K I D A L R G L N I S I T T T A K T D D E A K F2
S R S F S P K S I T T R S T R C V G * T S A S R R P R R P T T K Q R F3
501 AGCAGATCATTTTCCCCGAAATCGATTACGACAAGATCGACGCGCTGCGTGGGCTGAACATCAGCATCACGACGACCGCGAAGACCGACGACGAAGCAAA 600
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G A A R Q L Q V P V Q K L R L P W L N W H * S N V K R S A P A W S R F1
A L L A S F K F P F R N * G Y R G * T G T D R T * K E A R P P G R F2
R C S P A S S S R S E T E V T V A K L A L I E R E K K R A R L V A F3
601 GGCGCTGCTCGCCAGCTTCAAGTTCCCGTTCAGAAACTGAGGTTACCGTGGCTAAACTGGCACTGATCGAACGTGAAAAGAAGCGCGCCCGCCTGGTCGC 700
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S S Q Q S A K R * R R S S F1
E V R S K A R S A E G D H X F2
K F A A K R E A L K A I I F3
701 GAAGTTCGCAGCAAAGCGCGAAGCGCTGAAGGCGATCATC 740
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