BACT000033 (rplD) allele sequence: id-368
Contig position
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- forward
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
ACGCAGAGCG CAAGCTGCTG CTCGTCAAGG GCGCGATTCC GGGTGCGAAG GGCGGCAAGG TTTTCGTGAC GCCGGCCGTG AAGACCAAGG GGGCGAAATA ATGGAACTCA AGCTCCTGAA CGAAAATGGT CAGGAAGGTG CAGTGGTCAA CGCATCGGAC GTCGTGTTCG GTCGTGACTA CAACGAAGCG CTGATCCACC AGATCGTCGT CGCTTACCAG GCGAACGCTC GCCAGGGTAA CCGCGCGCAG AAGGACCGCG AGCAGGTCAA GCACACGACC AAGAAGCCGT GGCGTCAGAA GGGTACGGGC CGCGCTCGTG CCGGTATGTC GTCGAGCCCG CTGTGGCGTG GCGGTGGTCG TATCTTCCCG AACTCGCCGG AAGAAAACTT CTCGCACAAG GTCAACAAGA AGATGCATCG CGCAGGTCTC TGCTCGATCT TCTCGCAGCT GGCCCGCGAA GGCCGTCTGT CGGTCGTCGA GGACATCGTT CTCGAAGCGC CGAAGACCAA GCTGCTGGCC GACAAGTTCA AGGCCATGGG TCTCGATTCC GTGTTGATCA TCACCGACAC GGTCGACGAA AACCTGTACC TGGCTTCGCG CAACCTGCCG CACGTGGCAG TTGTCGAGCC GCGCTACGCT GACCCGCTGT CGCTGATCTA CTTCAAGAAA GTGCTGGTCA CGAAGGCTGC GGTCGCCCAG ATCGAGGAGT TGCTGTCATG AGCGAGATTC GCAAGAACGA TCATCGTTTG ATGCAGGTCC TGCTCGCACC GGTGATTTCC GAAAAGGCGA CGCTGGTTGC CGACAAGAAC GAGCAAGTCG T
Translation
T Q S A S C C S S R A R F R V R R A A R F S * R R P * R P R G R N N F1
R R A Q A A A R Q G R D S G C E G R Q G F R D A G R E D Q G G E I F2
A E R K L L L V K G A I P G A K G G K V F V T P A V K T K G A K * F3
1 ACGCAGAGCGCAAGCTGCTGCTCGTCAAGGGCGCGATTCCGGGTGCGAAGGGCGGCAAGGTTTTCGTGACGCCGGCCGTGAAGACCAAGGGGGCGAAATA 100
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G T Q A P E R K W S G R C S G Q R I G R R V R S * L Q R S A D P P F1
M E L K L L N E N G Q E G A V V N A S D V V F G R D Y N E A L I H Q F2
W N S S S * T K M V R K V Q W S T H R T S C S V V T T T K R * S T F3
101 ATGGAACTCAAGCTCCTGAACGAAAATGGTCAGGAAGGTGCAGTGGTCAACGCATCGGACGTCGTGTTCGGTCGTGACTACAACGAAGCGCTGATCCACC 200
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D R R R L P G E R S P G * P R A E G P R A G Q A H D Q E A V A S E F1
I V V A Y Q A N A R Q G N R A Q K D R E Q V K H T T K K P W R Q K F2
R S S S L T R R T L A R V T A R R R T A S R S S T R P R S R G V R R F3
201 AGATCGTCGTCGCTTACCAGGCGAACGCTCGCCAGGGTAACCGCGCGCAGAAGGACCGCGAGCAGGTCAAGCACACGACCAAGAAGCCGTGGCGTCAGAA 300
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G Y G P R S C R Y V V E P A V A W R W S Y L P E L A G R K L L A Q G F1
G T G R A R A G M S S S P L W R G G G R I F P N S P E E N F S H K F2
V R A A L V P V C R R A R C G V A V V V S S R T R R K K T S R T R F3
301 GGGTACGGGCCGCGCTCGTGCCGGTATGTCGTCGAGCCCGCTGTGGCGTGGCGGTGGTCGTATCTTCCCGAACTCGCCGGAAGAAAACTTCTCGCACAAG 400
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Q Q E D A S R R S L L D L L A A G P R R P S V G R R G H R S R S A F1
V N K K M H R A G L C S I F S Q L A R E G R L S V V E D I V L E A P F2
S T R R C I A Q V S A R S S R S W P A K A V C R S S R T S F S K R F3
401 GTCAACAAGAAGATGCATCGCGCAGGTCTCTGCTCGATCTTCTCGCAGCTGGCCCGCGAAGGCCGTCTGTCGGTCGTCGAGGACATCGTTCTCGAAGCGC 500
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E D Q A A G R Q V Q G H G S R F R V D H H R H G R R K P V P G F A F1
K T K L L A D K F K A M G L D S V L I I T D T V D E N L Y L A S R F2
R R P S C W P T S S R P W V S I P C * S S P T R S T K T C T W L R A F3
501 CGAAGACCAAGCTGCTGGCCGACAAGTTCAAGGCCATGGGTCTCGATTCCGTGTTGATCATCACCGACACGGTCGACGAAAACCTGTACCTGGCTTCGCG 600
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Q P A A R G S C R A A L R * P A V A D L L Q E S A G H E G C G R P D F1
N L P H V A V V E P R Y A D P L S L I Y F K K V L V T K A A V A Q F2
T C R T W Q L S S R A T L T R C R * S T S R K C W S R R L R S P R F3
601 CAACCTGCCGCACGTGGCAGTTGTCGAGCCGCGCTACGCTGACCCGCTGTCGCTGATCTACTTCAAGAAAGTGCTGGTCACGAAGGCTGCGGTCGCCCAG 700
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R G V A V M S E I R K N D H R L M Q V L L A P V I S E K A T L V A F1
I E E L L S * A R F A R T I I V * C R S C S H R * F P K R R R W L P F2
S R S C C H E R D S Q E R S S F D A G P A R T G D F R K G D A G C F3
701 ATCGAGGAGTTGCTGTCATGAGCGAGATTCGCAAGAACGATCATCGTTTGATGCAGGTCCTGCTCGCACCGGTGATTTCCGAAAAGGCGACGCTGGTTGC 800
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D K N E Q V V F1
T R T S K S X F2
R Q E R A S R F3
801 CGACAAGAACGAGCAAGTCGT 821
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