BACT000032 (rplC) allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3702
contig length
204182
start
875
end
1525
length
651
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TGCTAGGCTT TTCGCGCATT CGCGTAAAAA AGTCGGGTCT TGCGTACCCG GCATTTTGTA AATCAGCCCC GACCAATCGC AGTCGGGAAT GGAGAAAACG ATGAGCCTTG GACTCGTAGG TCGCAAGGTT GGCATGACCC GTATCTTCAC GGCTGAAGGG GATTCGATTC CCGTCACCGT GGTGGACGTG TCGGACAACC GCGTGACGCA GATCAAGACT GTTGAAACCG ACGGCTACAC GGCCGTTCAG GTTGCATTCG GCTCCCGCCG CGCATCGCGC GTGACGAAGC CGCTGGCAGG TCATCTCGCC AAAGCCGGCG TTGAAGCCGG TGAAATCCTC AAGGAATTCC GCATCGATGC GGCCAAGGCA GCCGAGCTGT CGAATGGCGC CATCGTTGGC CCGGATCTGT TCGAAGTGGG CCAGAAGGTC GACGTGCAAG GCGTGTCGAT CGGTAAGGGC TACGCCGGTA CCATCAAGCG TTACAACTTC GGTTCGGGCC GTGCTTCCCA CGGTAACTCG CGCTCGCACA ACGTGCCGGG CTCGATCGGT ATGGCGCAGG ATCCGGGTCG CGTGTTCCCG GGTAAGCGCA TGACGGGTCA CATGGGTGAC GTGACGGTGA CGGTGCAAAA CCTCGAAATC GCTCGTATCG ACGCAGAGCG CAAGCTGCTG CTCGTCAAGG GCGCGATTCC GGGTGCGAAG GGCGGCAAGG TTTTCGTGAC GCCGGCCGTG AAGACCAAGG GGGCGAAATA ATGGAACTCA AGCTCCTGAA CGAAAATGGT CAGGAAGGTG CAGTGGTCAA CGCATCGGAC GTCGTGTTCG GTCGTGACTA CAACGAAGCG CTGATCCACC A

Translation


          C  *  A  F  R  A  F  A  *  K  S  R  V  L  R  T  R  H  F  V  N  Q  P  R  P  I  A  V  G  N  G  E  N  D   F1
           A  R  L  F  A  H  S  R  K  K  V  G  S  C  V  P  G  I  L  *  I  S  P  D  Q  S  Q  S  G  M  E  K  T     F2
            L  G  F  S  R  I  R  V  K  K  S  G  L  A  Y  P  A  F  C  K  S  A  P  T  N  R  S  R  E  W  R  K  R    F3
        1 TGCTAGGCTTTTCGCGCATTCGCGTAAAAAAGTCGGGTCTTGCGTACCCGGCATTTTGTAAATCAGCCCCGACCAATCGCAGTCGGGAATGGAGAAAACG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            E  P  W  T  R  R  S  Q  G  W  H  D  P  Y  L  H  G  *  R  G  F  D  S  R  H  R  G  G  R  V  G  Q  P    F1
          M  S  L  G  L  V  G  R  K  V  G  M  T  R  I  F  T  A  E  G  D  S  I  P  V  T  V  V  D  V  S  D  N  R   F2
           *  A  L  D  S  *  V  A  R  L  A  *  P  V  S  S  R  L  K  G  I  R  F  P  S  P  W  W  T  C  R  T  T     F3
      101 ATGAGCCTTGGACTCGTAGGTCGCAAGGTTGGCATGACCCGTATCTTCACGGCTGAAGGGGATTCGATTCCCGTCACCGTGGTGGACGTGTCGGACAACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  D  A  D  Q  D  C  *  N  R  R  L  H  G  R  S  G  C  I  R  L  P  P  R  I  A  R  D  E  A  A  G  R     F1
            V  T  Q  I  K  T  V  E  T  D  G  Y  T  A  V  Q  V  A  F  G  S  R  R  A  S  R  V  T  K  P  L  A  G    F2
          A  *  R  R  S  R  L  L  K  P  T  A  T  R  P  F  R  L  H  S  A  P  A  A  H  R  A  *  R  S  R  W  Q  V   F3
      201 GCGTGACGCAGATCAAGACTGTTGAAACCGACGGCTACACGGCCGTTCAGGTTGCATTCGGCTCCCGCCGCGCATCGCGCGTGACGAAGCCGCTGGCAGG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  S  R  Q  S  R  R  *  S  R  *  N  P  Q  G  I  P  H  R  C  G  Q  G  S  R  A  V  E  W  R  H  R  W  P   F1
           H  L  A  K  A  G  V  E  A  G  E  I  L  K  E  F  R  I  D  A  A  K  A  A  E  L  S  N  G  A  I  V  G     F2
            I  S  P  K  P  A  L  K  P  V  K  S  S  R  N  S  A  S  M  R  P  R  Q  P  S  C  R  M  A  P  S  L  A    F3
      301 TCATCTCGCCAAAGCCGGCGTTGAAGCCGGTGAAATCCTCAAGGAATTCCGCATCGATGCGGCCAAGGCAGCCGAGCTGTCGAATGGCGCCATCGTTGGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  S  V  R  S  G  P  E  G  R  R  A  R  R  V  D  R  *  G  L  R  R  Y  H  Q  A  L  Q  L  R  F  G  P    F1
          P  D  L  F  E  V  G  Q  K  V  D  V  Q  G  V  S  I  G  K  G  Y  A  G  T  I  K  R  Y  N  F  G  S  G  R   F2
           R  I  C  S  K  W  A  R  R  S  T  C  K  A  C  R  S  V  R  A  T  P  V  P  S  S  V  T  T  S  V  R  A     F3
      401 CCGGATCTGTTCGAAGTGGGCCAGAAGGTCGACGTGCAAGGCGTGTCGATCGGTAAGGGCTACGCCGGTACCATCAAGCGTTACAACTTCGGTTCGGGCC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  F  P  R  *  L  A  L  A  Q  R  A  G  L  D  R  Y  G  A  G  S  G  S  R  V  P  G  *  A  H  D  G  S     F1
            A  S  H  G  N  S  R  S  H  N  V  P  G  S  I  G  M  A  Q  D  P  G  R  V  F  P  G  K  R  M  T  G  H    F2
          V  L  P  T  V  T  R  A  R  T  T  C  R  A  R  S  V  W  R  R  I  R  V  A  C  S  R  V  S  A  *  R  V  T   F3
      501 GTGCTTCCCACGGTAACTCGCGCTCGCACAACGTGCCGGGCTCGATCGGTATGGCGCAGGATCCGGGTCGCGTGTTCCCGGGTAAGCGCATGACGGGTCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  G  *  R  D  G  D  G  A  K  P  R  N  R  S  Y  R  R  R  A  Q  A  A  A  R  Q  G  R  D  S  G  C  E  G   F1
           M  G  D  V  T  V  T  V  Q  N  L  E  I  A  R  I  D  A  E  R  K  L  L  L  V  K  G  A  I  P  G  A  K     F2
            W  V  T  *  R  *  R  C  K  T  S  K  S  L  V  S  T  Q  S  A  S  C  C  S  S  R  A  R  F  R  V  R  R    F3
      601 CATGGGTGACGTGACGGTGACGGTGCAAAACCTCGAAATCGCTCGTATCGACGCAGAGCGCAAGCTGCTGCTCGTCAAGGGCGCGATTCCGGGTGCGAAG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  Q  G  F  R  D  A  G  R  E  D  Q  G  G  E  I  M  E  L  K  L  L  N  E  N  G  Q  E  G  A  V  V  N    F1
          G  G  K  V  F  V  T  P  A  V  K  T  K  G  A  K  *  W  N  S  S  S  *  T  K  M  V  R  K  V  Q  W  S  T   F2
           A  A  R  F  S  *  R  R  P  *  R  P  R  G  R  N  N  G  T  Q  A  P  E  R  K  W  S  G  R  C  S  G  Q     F3
      701 GGCGGCAAGGTTTTCGTGACGCCGGCCGTGAAGACCAAGGGGGCGAAATAATGGAACTCAAGCTCCTGAACGAAAATGGTCAGGAAGGTGCAGTGGTCAA 800
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  S  D  V  V  F  G  R  D  Y  N  E  A  L  I  H  X                                                     F1
            H  R  T  S  C  S  V  V  T  T  T  K  R  *  S  T  X                                                    F2
          R  I  G  R  R  V  R  S  *  L  Q  R  S  A  D  P  P                                                      F3
      801 CGCATCGGACGTCGTGTTCGGTCGTGACTACAACGAAGCGCTGATCCACCA 851
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|-