BACT000031 (rplB) allele sequence: id-368

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Illumina
Options

Sequence

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Translation


          A  S  A  V  R  W  A  A  A  R  T  *  R  R  H  T  C  A  *  S  P  A  R  K  S  T  S  K  R  R  P  S  N  H   F1
           L  R  P  F  D  G  P  P  Q  G  R  E  E  G  I  R  V  P  E  A  R  P  G  N  Q  L  R  S  G  G  Q  V  I     F2
            F  G  R  S  M  G  R  R  K  D  V  K  K  A  Y  V  C  L  K  P  G  Q  E  I  N  F  E  A  E  A  K  *  S    F3
        1 GCTTCGGCCGTTCGATGGGCCGCCGCAAGGACGTGAAGAAGGCATACGTGTGCCTGAAGCCCGGCCAGGAAATCAACTTCGAAGCGGAGGCCAAGTAATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  N  R  E  S  *  T  D  L  A  G  P  P  R  D  G  Q  G  G  Q  Q  G  P  A  Q  G  Q  A  A  R  G  A  A    F1
          M  A  I  V  K  V  K  P  T  S  P  G  R  R  A  M  V  K  V  V  N  K  D  L  H  K  G  K  P  H  A  A  L  L   F2
           W  Q  S  *  K  L  N  R  P  R  R  A  A  A  R  W  S  R  W  S  T  R  T  C  T  R  A  S  R  T  R  R  C     F3
      101 ATGGCAATCGTGAAAGTTAAACCGACCTCGCCGGGCCGCCGCGCGATGGTCAAGGTGGTCAACAAGGACCTGCACAAGGGCAAGCCGCACGCGGCGCTGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  A  E  L  Q  G  W  P  Q  Q  Q  R  S  H  H  D  A  S  P  G  R  W  S  Q  A  P  L  P  R  D  R  F     F1
            D  T  Q  S  S  K  A  G  R  N  N  N  G  R  I  T  T  R  H  Q  G  G  G  H  K  H  H  Y  R  V  I  D  F    F2
          S  T  R  R  A  P  R  L  A  A  T  T  T  V  A  S  R  R  V  T  R  A  V  V  T  S  T  T  T  A  *  S  I  S   F3
      201 TCGACACGCAGAGCTCCAAGGCTGGCCGCAACAACAACGGTCGCATCACGACGCGTCACCAGGGCGGTGGTCACAAGCACCACTACCGCGTGATCGATTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  S  Y  E  G  R  H  S  G  E  G  R  A  S  R  V  R  P  E  P  Q  R  E  H  R  A  G  A  V  R  R  R  *  A   F1
           R  R  T  K  D  G  I  P  A  K  V  E  R  L  E  Y  D  P  N  R  S  A  N  I  A  L  V  L  Y  A  D  G  E     F2
            V  V  R  R  T  A  F  R  R  R  S  S  V  S  S  T  T  R  T  A  A  R  T  S  R  W  C  C  T  P  T  V  S    F3
      301 CCGTCGTACGAAGGACGGCATTCCGGCGAAGGTCGAGCGTCTCGAGTACGACCCGAACCGCAGCGCGAACATCGCGCTGGTGCTGTACGCCGACGGTGAG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  L  H  H  R  A  E  G  R  D  G  W  P  A  A  H  V  G  F  G  S  A  D  P  C  R  Q  H  A  A  D  P  Q    F1
          R  R  Y  I  I  A  P  K  G  V  T  V  G  Q  Q  L  M  S  G  S  E  A  P  I  R  A  G  N  T  L  P  I  R  N   F2
           A  A  T  S  S  R  R  R  A  *  R  L  A  S  S  S  C  R  V  R  K  R  R  S  V  Q  A  T  R  C  R  S  A     F3
      401 CGCCGCTACATCATCGCGCCGAAGGGCGTGACGGTTGGCCAGCAGCTCATGTCGGGTTCGGAAGCGCCGATCCGTGCAGGCAACACGCTGCCGATCCGCA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  S  G  R  Y  D  D  P  L  H  R  D  A  A  G  Q  G  R  A  N  G  A  F  G  R  Y  V  G  H  A  A  R  T     F1
            I  P  V  G  T  T  I  H  C  I  E  M  L  P  G  K  G  A  Q  M  A  R  S  A  G  T  S  A  M  L  L  A  R    F2
          T  F  R  S  V  R  R  S  T  A  S  R  C  C  R  A  R  A  R  K  W  R  V  R  P  V  R  R  P  C  C  S  H  A   F3
      501 ACATTCCGGTCGGTACGACGATCCACTGCATCGAGATGCTGCCGGGCAAGGGCGCGCAAATGGCGCGTTCGGCCGGTACGTCGGCCATGCTGCTCGCACG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  R  R  V  R  A  G  P  S  A  F  G  R  N  P  P  R  A  H  R  V  P  C  D  D  R  *  S  R  Q  R  R  A  Q   F1
           E  G  V  Y  A  Q  V  R  L  R  S  G  E  I  R  R  V  H  I  E  C  R  A  T  I  G  E  V  G  N  E  E  H     F2
            K  A  C  T  R  R  S  V  C  V  R  A  K  S  A  A  C  T  S  S  A  V  R  R  S  V  K  S  A  T  K  S  T    F3
      601 CGAAGGCGTGTACGCGCAGGTCCGTCTGCGTTCGGGCGAAATCCGCCGCGTGCACATCGAGTGCCGTGCGACGATCGGTGAAGTCGGCAACGAAGAGCAC 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            P  A  P  D  R  Q  G  R  C  E  P  L  A  R  Y  P  P  D  G  A  W  R  G  N  E  P  D  R  P  P  A  R  W    F1
          S  L  R  Q  I  G  K  A  G  A  N  R  W  R  G  I  R  P  T  V  R  G  V  A  M  N  P  I  D  H  P  H  G  G   F2
           A  C  A  R  S  A  R  P  V  R  T  A  G  A  V  S  A  R  R  C  V  A  W  Q  *  T  R  S  T  T  R  T  V     F3
      701 AGCCTGCGCCAGATCGGCAAGGCCGGTGCGAACCGCTGGCGCGGTATCCGCCCGACGGTGCGTGGCGTGGCAATGAACCCGATCGACCACCCGCACGGTG 800
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           W  *  R  P  Y  R  C  G  P  R  P  G  E  P  V  G  H  A  D  E  G  L  P  Y  A  S  Q  Q  A  H  D  D  D     F1
            G  E  G  R  T  A  A  G  R  D  P  V  S  P  W  G  T  P  T  K  G  F  R  T  R  R  N  K  R  T  T  T  M    F2
          V  V  K  A  V  P  L  R  A  A  T  R  *  A  R  G  A  R  R  R  R  A  S  V  R  V  A  T  S  A  R  R  R  *   F3
      801 GTGGTGAAGGCCGTACCGCTGCGGGCCGCGACCCGGTGAGCCCGTGGGGCACGCCGACGAAGGGCTTCCGTACGCGTCGCAACAAGCGCACGACGACGAT 900
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  R  P  A  P  S  Q  A  L  R  S  R  Q  W  H  V  L  L  K  K  V  R  S  A  T  P  I  C  *  R  K  L  R  R   F1
           I  V  Q  R  R  H  K  R  *  G  V  G  N  G  T  F  C  *  K  R  S  V  L  R  R  P  F  A  E  E  S  *  G     F2
            S  S  S  A  V  T  S  V  K  E  *  A  M  A  R  S  V  K  K  G  P  F  C  D  A  H  L  L  K  K  V  E  A    F3
      901 GATCGTCCAGCGCCGTCACAAGCGTTAAGGAGTAGGCAATGGCACGTTCTGTTAAAAAAGGTCCGTTCTGCGACGCCCATTTGCTGAAGAAAGTTGAGGC 1000
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            L  Q  L  R  A  T  R  S  R                                                                            F1
          G  C  S  F  A  R  Q  E  A  X                                                                           F2
           A  A  A  S  R  D  K  K  P                                                                             F3
     1001 GGCTGCAGCTTCGCGCGACAAGAAGCCG 1028
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