BACT000021 (rpsU) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3677
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- 231795
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- 3560
- end
- 3772
- length
- 213
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGTATTTCCG CTCGTTTCGC CTGTTGTGGG AACGCCCGGA TGGCCGGTGC GTGGCGCTTG GCCGCTACGT TTTTGACCGT TTAAGCAATT TAGGAACGAC ATGACGACGA TTCTTCTGAA AGAAAACGAG CCGTTCGAAG TGGCGATTCG CCGCTTTCGT CGCGCTATCG AAAAAAATGG CCTGATCGCT GAACTGCGCG AGCGCCAGTC CTACGAAAAG CCGACCGCAG TCCGCAAGCG CAAGAAGGCA GCAGCCGTCA AGCGCCTGCA CAAGCGTCTG CGCAGCCAGA TGCTGCCGAA GAAGCTCCAC TAAGAGCGTC TGAGGGTTCG CCGCGAAACG GCGGAGCGTG CTTCGAAAGA AGCCGCTCCG CCGTTTTGCA TTTGAGGCGC GGAAAGCGTC TGCTCGATCG GCC
Translation
R I S A R F A C C G N A R M A G A W R L A A T F L T V * A I * E R H F1
V F P L V S P V V G T P G W P V R G A W P L R F * P F K Q F R N D F2
Y F R S F R L L W E R P D G R C V A L G R Y V F D R L S N L G T T F3
1 CGTATTTCCGCTCGTTTCGCCTGTTGTGGGAACGCCCGGATGGCCGGTGCGTGGCGCTTGGCCGCTACGTTTTTGACCGTTTAAGCAATTTAGGAACGAC 100
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D D D S S E R K R A V R S G D S P L S S R Y R K K W P D R * T A R F1
M T T I L L K E N E P F E V A I R R F R R A I E K N G L I A E L R E F2
* R R F F * K K T S R S K W R F A A F V A L S K K M A * S L N C A F3
101 ATGACGACGATTCTTCTGAAAGAAAACGAGCCGTTCGAAGTGGCGATTCGCCGCTTTCGTCGCGCTATCGAAAAAAATGGCCTGATCGCTGAACTGCGCG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A P V L R K A D R S P Q A Q E G S S R Q A P A Q A S A Q P D A A E F1
R Q S Y E K P T A V R K R K K A A A V K R L H K R L R S Q M L P K F2
S A S P T K S R P Q S A S A R R Q Q P S S A C T S V C A A R C C R R F3
201 AGCGCCAGTCCTACGAAAAGCCGACCGCAGTCCGCAAGCGCAAGAAGGCAGCAGCCGTCAAGCGCCTGCACAAGCGTCTGCGCAGCCAGATGCTGCCGAA 300
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E A P L R A S E G S P R N G G A C F E R S R S A V L H L R R G K R L F1
K L H * E R L R V R R E T A E R A S K E A A P P F C I * G A E S V F2
S S T K S V * G F A A K R R S V L R K K P L R R F A F E A R K A S F3
301 GAAGCTCCACTAAGAGCGTCTGAGGGTTCGCCGCGAAACGGCGGAGCGTGCTTCGAAAGAAGCCGCTCCGCCGTTTTGCATTTGAGGCGCGGAAAGCGTC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
L D R P F1
C S I G X F2
A R S A F3
401 TGCTCGATCGGCC 413
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Contig position
- sequence bin id
- 3688
- contig length
- 430077
- start
- 94299
- end
- 94511
- length
- 213
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGCGGAGTTC GCTCGCGGTG CTTGACGTCG TAGTGCCTTT GTGCAAAGCC TCTGCTATAC TCGTTAATCT TTCCCTGCAA ACCTTTATTC GTGTCGGATC ATGACGATCA TTCGCGTTAA AGAAAACGAG CCGTTCGAAG TTGCCATGCG TCGCTTCAAG CGCACGATCG AGAAGAACGG TCTGCTGACC GAGCTTCGTG CGCGCGAGTT CTACGAGAAG CCGACGGCCG AGCGCAAGCG CAAGAAGGCT GCGGCGGTGA AGCGTCACTA CAAGCGGATC CGCAGCCAGA TGCTGCCGAA AAAGCTGTAC TGAACGATTG GGCGCCGCGC GGTTGGCCGA GCGGCGCACC GGCGAAACCC GCGCGACCGG GCAGCGAGTC GCCGATGCCG GATTCGAGCA ACCCGCTTGA GAC
Translation
R G V R S R C L T S * C L C A K P L L Y S L I F P C K P L F V S D H F1
A E F A R G A * R R S A F V Q S L C Y T R * S F P A N L Y S C R I F2
R S S L A V L D V V V P L C K A S A I L V N L S L Q T F I R V G S F3
1 CGCGGAGTTCGCTCGCGGTGCTTGACGTCGTAGTGCCTTTGTGCAAAGCCTCTGCTATACTCGTTAATCTTTCCCTGCAAACCTTTATTCGTGTCGGATC 100
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D D H S R * R K R A V R S C H A S L Q A H D R E E R S A D R A S C F1
M T I I R V K E N E P F E V A M R R F K R T I E K N G L L T E L R A F2
* R S F A L K K T S R S K L P C V A S S A R S R R T V C * P S F V F3
101 ATGACGATCATTCGCGTTAAAGAAAACGAGCCGTTCGAAGTTGCCATGCGTCGCTTCAAGCGCACGATCGAGAAGAACGGTCTGCTGACCGAGCTTCGTG 200
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A R V L R E A D G R A Q A Q E G C G G E A S L Q A D P Q P D A A E F1
R E F Y E K P T A E R K R K K A A A V K R H Y K R I R S Q M L P K F2
R A S S T R S R R P S A S A R R L R R * S V T T S G S A A R C C R K F3
201 CGCGCGAGTTCTACGAGAAGCCGACGGCCGAGCGCAAGCGCAAGAAGGCTGCGGCGGTGAAGCGTCACTACAAGCGGATCCGCAGCCAGATGCTGCCGAA 300
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K A V L N D W A P R G W P S G A P A K P A R P G S E S P M P D S S N F1
K L Y * T I G R R A V G R A A H R R N P R D R A A S R R C R I R A F2
S C T E R L G A A R L A E R R T G E T R A T G Q R V A D A G F E Q F3
301 AAAGCTGTACTGAACGATTGGGCGCCGCGCGGTTGGCCGAGCGGCGCACCGGCGAAACCCGCGCGACCGGGCAGCGAGTCGCCGATGCCGGATTCGAGCA 400
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P L E T F1
T R L R X F2
P A * D F3
401 ACCCGCTTGAGAC 413
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