BACT000018 (rpsR) allele sequence: id-368

Contig position

sequence bin id
3703
contig length
955088
start
529952
end
530227
length
276
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCGAGACGCT GTTCACGGGC TTCCTGGCAA AGAAAAGCCG CAACGCGCGA ACCTTGGTGT TTCACATCAC AGCATTGCAG GACATTGGAA AGGACTGAAC ATGGCCCGCC CCACTGGTAA GAAATTCGAC AAGCGTCGTC AGCAACAAAA CCCGCTCTTC AAGCGCAAGA AGTTCTGCCG CTTCACGGCA GCCGGCGTCG AGCAGATCGA CTACAAGGAC ACGGAAACGC TGAAGGACTT CATCGGCGAA AACGGCAAGA TCACGCCGGC ACGTCTGACG GGTACGAAGG CGCACTATCA GCGTCAGCTG GACACGGCAA TCAAGCGCGC ACGCTTCCTC GCGCTGCTGC CGTACACCGA TCAGCACAAG GCGTAATCAG GCGACGCAAT AAGGAGAATT CGAATGCAAA TCATTCTGTT GGAAAAAGTC GCCAATCTGG GCAACCTCGG CGATATCGTC AAGGTCAAGG ACGGTT

Translation


          S  R  R  C  S  R  A  S  W  Q  R  K  A  A  T  R  E  P  W  C  F  T  S  Q  H  C  R  T  L  E  R  T  E  H   F1
           R  D  A  V  H  G  L  P  G  K  E  K  P  Q  R  A  N  L  G  V  S  H  H  S  I  A  G  H  W  K  G  L  N     F2
            E  T  L  F  T  G  F  L  A  K  K  S  R  N  A  R  T  L  V  F  H  I  T  A  L  Q  D  I  G  K  D  *  T    F3
        1 TCGAGACGCTGTTCACGGGCTTCCTGGCAAAGAAAAGCCGCAACGCGCGAACCTTGGTGTTTCACATCACAGCATTGCAGGACATTGGAAAGGACTGAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  P  P  H  W  *  E  I  R  Q  A  S  S  A  T  K  P  A  L  Q  A  Q  E  V  L  P  L  H  G  S  R  R  R    F1
          M  A  R  P  T  G  K  K  F  D  K  R  R  Q  Q  Q  N  P  L  F  K  R  K  K  F  C  R  F  T  A  A  G  V  E   F2
           W  P  A  P  L  V  R  N  S  T  S  V  V  S  N  K  T  R  S  S  S  A  R  S  S  A  A  S  R  Q  P  A  S     F3
      101 ATGGCCCGCCCCACTGGTAAGAAATTCGACAAGCGTCGTCAGCAACAAAACCCGCTCTTCAAGCGCAAGAAGTTCTGCCGCTTCACGGCAGCCGGCGTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  D  R  L  Q  G  H  G  N  A  E  G  L  H  R  R  K  R  Q  D  H  A  G  T  S  D  G  Y  E  G  A  L  S     F1
            Q  I  D  Y  K  D  T  E  T  L  K  D  F  I  G  E  N  G  K  I  T  P  A  R  L  T  G  T  K  A  H  Y  Q    F2
          S  R  S  T  T  R  T  R  K  R  *  R  T  S  S  A  K  T  A  R  S  R  R  H  V  *  R  V  R  R  R  T  I  S   F3
      201 AGCAGATCGACTACAAGGACACGGAAACGCTGAAGGACTTCATCGGCGAAAACGGCAAGATCACGCCGGCACGTCTGACGGGTACGAAGGCGCACTATCA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  S  A  G  H  G  N  Q  A  R  T  L  P  R  A  A  A  V  H  R  S  A  Q  G  V  I  R  R  R  N  K  E  N  S   F1
           R  Q  L  D  T  A  I  K  R  A  R  F  L  A  L  L  P  Y  T  D  Q  H  K  A  *  S  G  D  A  I  R  R  I     F2
            V  S  W  T  R  Q  S  S  A  H  A  S  S  R  C  C  R  T  P  I  S  T  R  R  N  Q  A  T  Q  *  G  E  F    F3
      301 GCGTCAGCTGGACACGGCAATCAAGCGCGCACGCTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            N  A  N  H  S  V  G  K  S  R  Q  S  G  Q  P  R  R  Y  R  Q  G  Q  G  R  X                            F1
          R  M  Q  I  I  L  L  E  K  V  A  N  L  G  N  L  G  D  I  V  K  V  K  D  G  X                           F2
           E  C  K  S  F  C  W  K  K  S  P  I  W  A  T  S  A  I  S  S  R  S  R  T  V                             F3
      401 CGAATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTT 476
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