BACT000016 (rpsP) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3699
- contig length
- 169758
- start
- 3280
- end
- 3534
- length
- 255
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGTGGATTT TTTGCGCGTA AGTGTTTGTT GTACCTCCAG TTTCCGGCTA TAATCGCGTG TTTCAGTAGT TTCGAACCCG GTTTTCCCGA AGGATTTCAT ATGGTTATCA TCCGTCTGGC TCGCGGCGGC TCGAAGAAGC GCCCGTTCTA CAACATCGTT GCTACCGATT CGCGCAACCG TCGTGACGGC CGCTTCATCG AGCGCGTCGG CTTCTACAAC CCGGTCGCGA CGAAGGGCGA AGCGCTGCGT ATCGCTCAGG ATCGTCTGAC GTACTGGCAA GGCGTTGGCG CGCAACTGTC GCCGACCGTC CAGCGTCTCG TGAAGGAAGC GCAAAAGGCG CAGCCGGCTG CCTGAATGGC GCGGTGTGCC GGTCGTGCCG GCTGTGAGGT GTATTGATGT CGGATCACGA TTCCGGTAAT GCAAGGCGCG GGCGGGCGTC GTTCGGCGCA TTCGT
Translation
P W I F C A * V F V V P P V S G Y N R V F Q * F R T R F S R R I S Y F1
R G F F A R K C L L Y L Q F P A I I A C F S S F E P G F P E G F H F2
V D F L R V S V C C T S S F R L * S R V S V V S N P V F P K D F I F3
1 CCGTGGATTTTTTGCGCGTAAGTGTTTGTTGTACCTCCAGTTTCCGGCTATAATCGCGTGTTTCAGTAGTTTCGAACCCGGTTTTCCCGAAGGATTTCAT 100
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G Y H P S G S R R L E E A P V L Q H R C Y R F A Q P S * R P L H R F1
M V I I R L A R G G S K K R P F Y N I V A T D S R N R R D G R F I E F2
W L S S V W L A A A R R S A R S T T S L L P I R A T V V T A A S S F3
101 ATGGTTATCATCCGTCTGGCTCGCGGCGGCTCGAAGAAGCGCCCGTTCTACAACATCGTTGCTACCGATTCGCGCAACCGTCGTGACGGCCGCTTCATCG 200
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A R R L L Q P G R D E G R S A A Y R S G S S D V L A R R W R A T V F1
R V G F Y N P V A T K G E A L R I A Q D R L T Y W Q G V G A Q L S F2
S A S A S T T R S R R R A K R C V S L R I V * R T G K A L A R N C R F3
201 AGCGCGTCGGCTTCTACAACCCGGTCGCGACGAAGGGCGAAGCGCTGCGTATCGCTCAGGATCGTCTGACGTACTGGCAAGGCGTTGGCGCGCAACTGTC 300
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A D R P A S R E G S A K G A A G C L N G A V C R S C R L * G V L M S F1
P T V Q R L V K E A Q K A Q P A A * M A R C A G R A G C E V Y * C F2
R P S S V S * R K R K R R S R L P E W R G V P V V P A V R C I D V F3
301 GCCGACCGTCCAGCGTCTCGTGAAGGAAGCGCAAAAGGCGCAGCCGGCTGCCTGAATGGCGCGGTGTGCCGGTCGTGCCGGCTGTGAGGTGTATTGATGT 400
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D H D S G N A R R G R A S F G A F V F1
R I T I P V M Q G A G G R R S A H S X F2
G S R F R * C K A R A G V V R R I R F3
401 CGGATCACGATTCCGGTAATGCAAGGCGCGGGCGGGCGTCGTTCGGCGCATTCGT 455
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