BACT000015 (rpsO) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3681
- contig length
- 43060
- start
- 36120
- end
- 36389
- length
- 270
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCTTAGGCGC GACGCGGAGT TGTGCTACAA TGCGCGCCGG TTGTAAGTCA CGGCACGGCC ATTCTTCCGT GTCCGCCTGT TTAGTTTGAA AGGAAATCAC ATGTCTGTTG CAGATATCAA GAAGTCGGAA GTCGTTGCTC AGTTCGCCCG CGGTACCAAC GACACGGGTT CGCCCGAAGT CCAGGTCGCA CTGCTGACCG CACGTATCGT CGAACTGACG GGTCACTTCA AGACCCACGC GAAGGATCAC CACAGCCGCC GCGGCCTGCT GCGCATGGTG AGCCGTCGCC GCAAGCTGCT CGACTACCTC AAGGGCAAGG ATGCCGACCG TTACCGCGCG CTGATCGAGA AGCTGGGTCT GCGTAAGTAA TCGCGGGGCG ATTGCCGCCA GCAAGATGCC TGTGTCAGTC CGCTGATGCA GGCATTTTGT TTTTGCGCGG TGCGTAGCGT CACGCGCACC GCAGGCAGTC
Translation
A * A R R G V V L Q C A P V V S H G T A I L P C P P V * F E R K S H F1
L R R D A E L C Y N A R R L * V T A R P F F R V R L F S L K G N H F2
L G A T R S C A T M R A G C K S R H G H S S V S A C L V * K E I T F3
1 GCTTAGGCGCGACGCGGAGTTGTGCTACAATGCGCGCCGGTTGTAAGTCACGGCACGGCCATTCTTCCGTGTCCGCCTGTTTAGTTTGAAAGGAAATCAC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V C C R Y Q E V G S R C S V R P R Y Q R H G F A R S P G R T A D R F1
M S V A D I K K S E V V A Q F A R G T N D T G S P E V Q V A L L T A F2
C L L Q I S R S R K S L L S S P A V P T T R V R P K S R S H C * P F3
101 ATGTCTGTTGCAGATATCAAGAAGTCGGAAGTCGTTGCTCAGTTCGCCCGCGGTACCAACGACACGGGTTCGCCCGAAGTCCAGGTCGCACTGCTGACCG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
T Y R R T D G S L Q D P R E G S P Q P P R P A A H G E P S P Q A A F1
R I V E L T G H F K T H A K D H H S R R G L L R M V S R R R K L L F2
H V S S N * R V T S R P T R R I T T A A A A C C A W * A V A A S C S F3
201 CACGTATCGTCGAACTGACGGGTCACTTCAAGACCCACGCGAAGGATCACCACAGCCGCCGCGGCCTGCTGCGCATGGTGAGCCGTCGCCGCAAGCTGCT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R L P Q G Q G C R P L P R A D R E A G S A * V I A G R L P P A R C L F1
D Y L K G K D A D R Y R A L I E K L G L R K * S R G D C R Q Q D A F2
T T S R A R M P T V T A R * S R S W V C V S N R G A I A A S K M P F3
301 CGACTACCTCAAGGGCAAGGATGCCGACCGTTACCGCGCGCTGATCGAGAAGCTGGGTCTGCGTAAGTAATCGCGGGGCGATTGCCGCCAGCAAGATGCC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C Q S A D A G I L F L R G A * R H A H R R Q S F1
C V S P L M Q A F C F C A V R S V T R T A G S X F2
V S V R * C R H F V F A R C V A S R A P Q A V F3
401 TGTGTCAGTCCGCTGATGCAGGCATTTTGTTTTTGCGCGGTGCGTAGCGTCACGCGCACCGCAGGCAGTC 470
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|