BACT000012 (rpsL) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3676
- contig length
- 20916
- start
- 17499
- end
- 17879
- length
- 381
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AGGTTCGTGC CCGATTCGCC GCGCCGGGAG TCAACTGTGC GTCGATTTTC GCTTTGCCCG AAATCGATGT GCGGATTTTG TTCAATTTCA GGAATAAACA ATGCCAACCA TCAACCAACT GGTTCGCAAA GGCCGTCAGT CGGAAACGAC GAAGAGCAAG AGCCCGGCCC TGCAGGACTG CCCCCAGCGT CGCGGCGTGT GCACCCGTGT GTACACGACG ACGCCGAAGA AGCCGAACTC GGCACTCCGT AAGGTCGCCA AGGTTCGTCT GACGAACGGC TTCGAAGTGA TTTCGTACAT CGGCGGTGAA GGCCACAACC TGCAGGAACA CTCGGTTGTG CTGATCCGCG GCGGCCGTGT GAAGGACTTG CCGGGTGTGC GTTACCACAT GGTTCGCGGC TCGCTGGATA CCCAGGGCGT CAAGGACCGT AAGCAAGCGC GCTCGAAGTA CGGCGCGAAG CGTGCAAAGG CTGCCAAGTA AGCAGTGTTT GATCAGGGAT CGCCCCAGGG CGGTCAAGGC GGTGGTGCCG GATTGCCGGT GCTGTCGAGT AAGTGGTCAC CCGGCCAAGC TGGTTAGTCG T
Translation
R F V P D S P R R E S T V R R F S L C P K S M C G F C S I S G I N N F1
G S C P I R R A G S Q L C V D F R F A R N R C A D F V Q F Q E * T F2
V R A R F A A P G V N C A S I F A L P E I D V R I L F N F R N K Q F3
1 AGGTTCGTGCCCGATTCGCCGCGCCGGGAGTCAACTGTGCGTCGATTTTCGCTTTGCCCGAAATCGATGTGCGGATTTTGTTCAATTTCAGGAATAAACA 100
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A N H Q P T G S Q R P S V G N D E E Q E P G P A G L P P A S R R V F1
M P T I N Q L V R K G R Q S E T T K S K S P A L Q D C P Q R R G V C F2
C Q P S T N W F A K A V S R K R R R A R A R P C R T A P S V A A C F3
101 ATGCCAACCATCAACCAACTGGTTCGCAAAGGCCGTCAGTCGGAAACGACGAAGAGCAAGAGCCCGGCCCTGCAGGACTGCCCCCAGCGTCGCGGCGTGT 200
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H P C V H D D A E E A E L G T P * G R Q G S S D E R L R S D F V H F1
T R V Y T T T P K K P N S A L R K V A K V R L T N G F E V I S Y I F2
A P V C T R R R R R S R T R H S V R S P R F V * R T A S K * F R T S F3
201 GCACCCGTGTGTACACGACGACGCCGAAGAAGCCGAACTCGGCACTCCGTAAGGTCGCCAAGGTTCGTCTGACGAACGGCTTCGAAGTGATTTCGTACAT 300
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R R * R P Q P A G T L G C A D P R R P C E G L A G C A L P H G S R L F1
G G E G H N L Q E H S V V L I R G G R V K D L P G V R Y H M V R G F2
A V K A T T C R N T R L C * S A A A V * R T C R V C V T T W F A A F3
301 CGGCGGTGAAGGCCACAACCTGCAGGAACACTCGGTTGTGCTGATCCGCGGCGGCCGTGTGAAGGACTTGCCGGGTGTGCGTTACCACATGGTTCGCGGC 400
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A G Y P G R Q G P * A S A L E V R R E A C K G C Q V S S V * S G I F1
S L D T Q G V K D R K Q A R S K Y G A K R A K A A K * A V F D Q G S F2
R W I P R A S R T V S K R A R S T A R S V Q R L P S K Q C L I R D F3
401 TCGCTGGATACCCAGGGCGTCAAGGACCGTAAGCAAGCGCGCTCGAAGTACGGCGCGAAGCGTGCAAAGGCTGCCAAGTAAGCAGTGTTTGATCAGGGAT 500
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A P G R S R R W C R I A G A V E * V V T R P S W L V V F1
P Q G G Q G G G A G L P V L S S K W S P G Q A G * S X F2
R P R A V K A V V P D C R C C R V S G H P A K L V S R F3
501 CGCCCCAGGGCGGTCAAGGCGGTGGTGCCGGATTGCCGGTGCTGTCGAGTAAGTGGTCACCCGGCCAAGCTGGTTAGTCGT 581
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