BACT000011 (rpsK) allele sequence: id-368
Contig position
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- 3702
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- 204182
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- end
- 12605
- length
- 402
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGTCAGCGTA CGCGTACGAA CGCACGTACC CGCAAGGGTC CGCGTCGTGC AGCGCAAGCG CTGAAGAAGT AAGCGGAACT GACAGTTACA GGAAAACGTA ATGGCTAAGG CTTCGAACAC CGCGGCGCAA CGCGTTCGCA AGAAGGTTAA GAAGAACGTC GCTGAAGGCG TGGTTCACGT TCACGCGTCG TTCAACAACA CGATCATCAC GATCACCGAT CGCCAAGGCA ACGCACTGGC ATGGGCGACG TCGGGCGGTC AGGGCTTCAA GGGCTCGCGC AAATCGACGC CGTTCGCTGC TCAGGTCGCA GCCGAGTCGG CTGGCCGCGT CGCGATGGAA TACGGCGTGA AGAATCTGGA AGTGCGGATC AAGGGCCCGG GCCCGGGTCG CGAGTCGGCA GTGCGCGCAC TGCACGGCCT CGGCATCAAG ATCACCGCGA TTTCGGACGT CACCCCGATT CCGCACAACG GCTGCCGTCC GCCGAAGCGT CGTCGTATCT AAGGATGTGC TGGCACGTTC GTGCTGGCGC ATTGCCTGTC GCCGCGTCGC GTCGACGGGC GTTGCTTTTT TGATTGACTA AGCCCACCGT TCGCCCCAAA GG
Translation
G Q R T R T N A R T R K G P R R A A Q A L K K * A E L T V T G K R N F1
V S V R V R T H V P A R V R V V Q R K R * R S K R N * Q L Q E N V F2
S A Y A Y E R T Y P Q G S A S C S A S A E E V S G T D S Y R K T * F3
1 GGTCAGCGTACGCGTACGAACGCACGTACCCGCAAGGGTCCGCGTCGTGCAGCGCAAGCGCTGAAGAAGTAAGCGGAACTGACAGTTACAGGAAAACGTA 100
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G * G F E H R G A T R S Q E G * E E R R * R R G S R S R V V Q Q H F1
M A K A S N T A A Q R V R K K V K K N V A E G V V H V H A S F N N T F2
W L R L R T P R R N A F A R R L R R T S L K A W F T F T R R S T T F3
101 ATGGCTAAGGCTTCGAACACCGCGGCGCAACGCGTTCGCAAGAAGGTTAAGAAGAACGTCGCTGAAGGCGTGGTTCACGTTCACGCGTCGTTCAACAACA 200
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D H H D H R S P R Q R T G M G D V G R S G L Q G L A Q I D A V R C F1
I I T I T D R Q G N A L A W A T S G G Q G F K G S R K S T P F A A F2
R S S R S P I A K A T H W H G R R R A V R A S R A R A N R R R S L L F3
201 CGATCATCACGATCACCGATCGCCAAGGCAACGCACTGGCATGGGCGACGTCGGGCGGTCAGGGCTTCAAGGGCTCGCGCAAATCGACGCCGTTCGCTGC 300
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S G R S R V G W P R R D G I R R E E S G S A D Q G P G P G S R V G S F1
Q V A A E S A G R V A M E Y G V K N L E V R I K G P G P G R E S A F2
R S Q P S R L A A S R W N T A * R I W K C G S R A R A R V A S R Q F3
301 TCAGGTCGCAGCCGAGTCGGCTGGCCGCGTCGCGATGGAATACGGCGTGAAGAATCTGGAAGTGCGGATCAAGGGCCCGGGCCCGGGTCGCGAGTCGGCA 400
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A R T A R P R H Q D H R D F G R H P D S A Q R L P S A E A S S Y L F1
V R A L H G L G I K I T A I S D V T P I P H N G C R P P K R R R I * F2
C A H C T A S A S R S P R F R T S P R F R T T A A V R R S V V V S F3
401 GTGCGCGCACTGCACGGCCTCGGCATCAAGATCACCGCGATTTCGGACGTCACCCCGATTCCGCACAACGGCTGCCGTCCGCCGAAGCGTCGTCGTATCT 500
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R M C W H V R A G A L P V A A S R R R A L L F * L T K P T V R P K F1
G C A G T F V L A H C L S P R R V D G R C F F D * L S P P F A P K F2
K D V L A R S C W R I A C R R V A S T G V A F L I D * A H R S P Q R F3
501 AAGGATGTGCTGGCACGTTCGTGCTGGCGCATTGCCTGTCGCCGCGTCGCGTCGACGGGCGTTGCTTTTTTGATTGACTAAGCCCACCGTTCGCCCCAAA 600
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G F1
X F2
F3
601 GG 602
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