BACT000009 (rpsI) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3703
- contig length
- 955088
- start
- 144607
- end
- 144999
- length
- 393
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGGCTACGC GATGATCAAG AAGCTGAAGG TCTACGCAGA AGCGACGCAT CCGCACTCGG CTCAACAGCC GAAGGCGCTC GAGATCTAAG GGGAGCCCAC ATGATCGGTA ACTGGAACTA CGGTACGGGC CGCCGCAAGA GCGCAGTCGC TCGTGTCTTC ATCAAGGCTG GCAAGGGCGA CATCATCGTC AACGGCAAGC CCATCGCTGA CTACTTCGCA CGTGAAACGT CGCTGATGAT CGTGCGTCAG CCGCTGGAAC TGACGAACCA CGCTCAAACG TTCGACATCA AGGTGAACGT GTCGGGCGGC GGCGAAACGG GTCAGGCAGG CGCAGTGCGT CACGGCATCA CGCGCGCGCT GATCGACTAC GACGCGACGC TGAAGCCGGC CCTGTCGAAC GCAGGCTTCG TCACGCGTGA CGCGCGTGAA GTCGAGCGTA AGAAGGTCGG TCTGCACAAG GCACGCCGCG CCAAGCAGTT CTCGAAGCGT TAATTCCGCT TCATGGCCGC GCCGCTTGCG GGCGGCGCCC GCCGGAAAAA CCGCCAGCTT TCGCGCTGGC GGTTTTTTTA TGCGCGCGTG CCGGACGGGC CGG
Translation
S A T R * S R S * R S T Q K R R I R T R L N S R R R S R S K G S P H F1
R L R D D Q E A E G L R R S D A S A L G S T A E G A R D L R G A H F2
G Y A M I K K L K V Y A E A T H P H S A Q Q P K A L E I * G E P T F3
1 TCGGCTACGCGATGATCAAGAAGCTGAAGGTCTACGCAGAAGCGACGCATCCGCACTCGGCTCAACAGCCGAAGGCGCTCGAGATCTAAGGGGAGCCCAC 100
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D R * L E L R Y G P P Q E R S R S C L H Q G W Q G R H H R Q R Q A F1
M I G N W N Y G T G R R K S A V A R V F I K A G K G D I I V N G K P F2
* S V T G T T V R A A A R A Q S L V S S S R L A R A T S S S T A S F3
101 ATGATCGGTAACTGGAACTACGGTACGGGCCGCCGCAAGAGCGCAGTCGCTCGTGTCTTCATCAAGGCTGGCAAGGGCGACATCATCGTCAACGGCAAGC 200
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H R * L L R T * N V A D D R A S A A G T D E P R S N V R H Q G E R F1
I A D Y F A R E T S L M I V R Q P L E L T N H A Q T F D I K V N V F2
P S L T T S H V K R R * * S C V S R W N * R T T L K R S T S R * T C F3
201 CCATCGCTGACTACTTCGCACGTGAAACGTCGCTGATGATCGTGCGTCAGCCGCTGGAACTGACGAACCACGCTCAAACGTTCGACATCAAGGTGAACGT 300
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V G R R R N G S G R R S A S R H H A R A D R L R R D A E A G P V E R F1
S G G G E T G Q A G A V R H G I T R A L I D Y D A T L K P A L S N F2
R A A A K R V R Q A Q C V T A S R A R * S T T T R R * S R P C R T F3
301 GTCGGGCGGCGGCGAAACGGGTCAGGCAGGCGCAGTGCGTCACGGCATCACGCGCGCGCTGATCGACTACGACGCGACGCTGAAGCCGGCCCTGTCGAAC 400
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R L R H A * R A * S R A * E G R S A Q G T P R Q A V L E A L I P L F1
A G F V T R D A R E V E R K K V G L H K A R R A K Q F S K R * F R F F2
Q A S S R V T R V K S S V R R S V C T R H A A P S S S R S V N S A F3
401 GCAGGCTTCGTCACGCGTGACGCGCGTGAAGTCGAGCGTAAGAAGGTCGGTCTGCACAAGGCACGCCGCGCCAAGCAGTTCTCGAAGCGTTAATTCCGCT 500
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H G R A A C G R R P P E K P P A F A L A V F L C A R A G R A G F1
M A A P L A G G A R R K N R Q L S R W R F F Y A R V P D G P X F2
S W P R R L R A A P A G K T A S F R A G G F F M R A C R T G R F3
501 TCATGGCCGCGCCGCTTGCGGGCGGCGCCCGCCGGAAAAACCGCCAGCTTTCGCGCTGGCGGTTTTTTTATGCGCGCGTGCCGGACGGGCCGG 593
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