BACT000008 (rpsH) allele sequence: id-368
Contig position
- sequence bin id
- 3702
- contig length
- 204182
- start
- 7501
- end
- 7896
- length
- 396
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCCGCAAATT CGGCCTCGCG CGCAACAAGA TTCGTGAAAT CGCATTCCGT GGCGAGATTC CTGGCCTGAC CAAGGCGAGC TGGTAATAGG AGAAACGTAA ATGAGCATGA GTGATCCTAT CGCCGATATG CTGACTCGCA TCCGCAACGC GCAGATGGTC GAGAAGGTAT CGGTCGCGAT GCCCTCGTCG AAGGTCAAGG TTGCAATCGC ACAAGTCCTG AAGGACGAAG GTTATATCGA CGATTTCGCG GTGAAGACCG AAGGCGCGAA GGCTGAGCTG AACATCGCGC TGAAGTACTA CGCGGGCCGT CCGGTGATCG AGCGCCTCGA GCGCGTGTCG AAGCCGGGTC TGCGCGTGTA CCGCGGCCGT AACGAGATTC CGCAGGTCAT GAATGGCCTC GGTGTGGCTA TCGTGTCGAC GCCGAAGGGC GTGATGACCG ACCGCAAGGC GCGCGCAACG GGCGTCGGCG GCGAAGTCAT CTGCTACGTC GCTTAAAGCC GAGGAGAGAG AAACATGTCT CGAGTAGGTA AGAGCCCGAT CGCGCTGCAA GGCGCGGAAG TCAAGCTGGC CGACGGCGTC ATCACCGTCA AGGGCC
Translation
S A N S A S R A T R F V K S H S V A R F L A * P R R A G N R R N V N F1
P Q I R P R A Q Q D S * N R I P W R D S W P D Q G E L V I G E T * F2
R K F G L A R N K I R E I A F R G E I P G L T K A S W * * E K R K F3
1 TCCGCAAATTCGGCCTCGCGCGCAACAAGATTCGTGAAATCGCATTCCGTGGCGAGATTCCTGGCCTGACCAAGGCGAGCTGGTAATAGGAGAAACGTAA 100
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E H E * S Y R R Y A D S H P Q R A D G R E G I G R D A L V E G Q G F1
M S M S D P I A D M L T R I R N A Q M V E K V S V A M P S S K V K V F2
* A * V I L S P I C * L A S A T R R W S R R Y R S R C P R R R S R F3
101 ATGAGCATGAGTGATCCTATCGCCGATATGCTGACTCGCATCCGCAACGCGCAGATGGTCGAGAAGGTATCGGTCGCGATGCCCTCGTCGAAGGTCAAGG 200
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C N R T S P E G R R L Y R R F R G E D R R R E G * A E H R A E V L F1
A I A Q V L K D E G Y I D D F A V K T E G A K A E L N I A L K Y Y F2
L Q S H K S * R T K V I S T I S R * R P K A R R L S * T S R * S T T F3
201 TTGCAATCGCACAAGTCCTGAAGGACGAAGGTTATATCGACGATTTCGCGGTGAAGACCGAAGGCGCGAAGGCTGAGCTGAACATCGCGCTGAAGTACTA 300
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R G P S G D R A P R A R V E A G S A R V P R P * R D S A G H E W P R F1
A G R P V I E R L E R V S K P G L R V Y R G R N E I P Q V M N G L F2
R A V R * S S A S S A C R S R V C A C T A A V T R F R R S * M A S F3
301 CGCGGGCCGTCCGGTGATCGAGCGCCTCGAGCGCGTGTCGAAGCCGGGTCTGCGCGTGTACCGCGGCCGTAACGAGATTCCGCAGGTCATGAATGGCCTC 400
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C G Y R V D A E G R D D R P Q G A R N G R R R R S H L L R R L K P F1
G V A I V S T P K G V M T D R K A R A T G V G G E V I C Y V A * S R F2
V W L S C R R R R A * * P T A R R A Q R A S A A K S S A T S L K A F3
401 GGTGTGGCTATCGTGTCGACGCCGAAGGGCGTGATGACCGACCGCAAGGCGCGCGCAACGGGCGTCGGCGGCGAAGTCATCTGCTACGTCGCTTAAAGCC 500
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R R E K H V S S R * E P D R A A R R G S Q A G R R R H H R Q G P F1
G E R N M S R V G K S P I A L Q G A E V K L A D G V I T V K G X F2
E E R E T C L E * V R A R S R C K A R K S S W P T A S S P S R A F3
501 GAGGAGAGAGAAACATGTCTCGAGTAGGTAAGAGCCCGATCGCGCTGCAAGGCGCGGAAGTCAAGCTGGCCGACGGCGTCATCACCGTCAAGGGCC 596
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