BACT000005 (rpsE) allele sequence: id-368
Contig position
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- 3702
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- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGCCTTCGA CCGCTCGGGC TTCCGCTACC ACGGCCGCGT GAAGGCGCTG GCTGAGGCAG CTCGTGAAGC TGGGCTCAAG TTCTAAGGAA GGAATTCGTC ATGGCAAAGA TGCAAGCGAA AGTTCAGGCT GACGAGCGCG ACGACGGCCT TCGCGAAAAG ATGATTTCGG TCAACCGCGT GACCAAGGTC GTGAAGGGTG GCCGTATTCT CGGCTTCGCC GCACTGACCG TGGTCGGCGA CGGTGATGGC CGCGTCGGTA TGGGCAAGGG CAAGGCGAAG GAAGTGCCGG TCGCTGTCCA GAAGGCGATG GAGCAGGCTC GCCGCAACAT GTTCAAGGTG CCGCTGAAGA ACGGCACGCT GCAGCACGAA GTGCACGGCA AGCACGGCGC ATCGACGGTT CTCCTCGCTC CGGCGAAGGA CGGTACCGGC GTGATCGCCG GCGGCCCGAT GCGCGCCGTG TTCGACGTGA TGGGCGTTCA GAACGTCGTG GCCAAGAGCC ACGGTTCGAC GAACCCGTAC AACCTCGTGC GTGCGACGCT GGACGGCCTG CGCAAGCAGT CGACCCCGGC AGACATCGCG GCGAAGCGCG GCAAGTCCGT CGAAGAAATT TTGGGCTAAG CCCGGGTGGT CACCATGTCT GAAAAAACTG TCAAGGTTCA GCTCGTCAAG AGCCTGATCG GGACCCGCGA ATCGCACCGC GCGACCGTGC GTGGCCTGG
Translation
S P S T A R A S A T T A A * R R W L R Q L V K L G S S S K E G I R H F1
R L R P L G L P L P R P R E G A G * G S S * S W A Q V L R K E F V F2
A F D R S G F R Y H G R V K A L A E A A R E A G L K F * G R N S S F3
1 TCGCCTTCGACCGCTCGGGCTTCCGCTACCACGGCCGCGTGAAGGCGCTGGCTGAGGCAGCTCGTGAAGCTGGGCTCAAGTTCTAAGGAAGGAATTCGTC 100
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G K D A S E S S G * R A R R R P S R K D D F G Q P R D Q G R E G W F1
M A K M Q A K V Q A D E R D D G L R E K M I S V N R V T K V V K G G F2
W Q R C K R K F R L T S A T T A F A K R * F R S T A * P R S * R V F3
101 ATGGCAAAGATGCAAGCGAAAGTTCAGGCTGACGAGCGCGACGACGGCCTTCGCGAAAAGATGATTTCGGTCAACCGCGTGACCAAGGTCGTGAAGGGTG 200
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P Y S R L R R T D R G R R R * W P R R Y G Q G Q G E G S A G R C P F1
R I L G F A A L T V V G D G D G R V G M G K G K A K E V P V A V Q F2
A V F S A S P H * P W S A T V M A A S V W A R A R R R K C R S L S R F3
201 GCCGTATTCTCGGCTTCGCCGCACTGACCGTGGTCGGCGACGGTGATGGCCGCGTCGGTATGGGCAAGGGCAAGGCGAAGGAAGTGCCGGTCGCTGTCCA 300
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E G D G A G S P Q H V Q G A A E E R H A A A R S A R Q A R R I D G S F1
K A M E Q A R R N M F K V P L K N G T L Q H E V H G K H G A S T V F2
R R W S R L A A T C S R C R * R T A R C S T K C T A S T A H R R F F3
301 GAAGGCGATGGAGCAGGCTCGCCGCAACATGTTCAAGGTGCCGCTGAAGAACGGCACGCTGCAGCACGAAGTGCACGGCAAGCACGGCGCATCGACGGTT 400
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P R S G E G R Y R R D R R R P D A R R V R R D G R S E R R G Q E P F1
L L A P A K D G T G V I A G G P M R A V F D V M G V Q N V V A K S H F2
S S L R R R T V P A * S P A A R C A P C S T * W A F R T S W P R A F3
401 CTCCTCGCTCCGGCGAAGGACGGTACCGGCGTGATCGCCGGCGGCCCGATGCGCGCCGTGTTCGACGTGATGGGCGTTCAGAACGTCGTGGCCAAGAGCC 500
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R F D E P V Q P R A C D A G R P A Q A V D P G R H R G E A R Q V R F1
G S T N P Y N L V R A T L D G L R K Q S T P A D I A A K R G K S V F2
T V R R T R T T S C V R R W T A C A S S R P R Q T S R R S A A S P S F3
501 ACGGTTCGACGAACCCGTACAACCTCGTGCGTGCGACGCTGGACGGCCTGCGCAAGCAGTCGACCCCGGCAGACATCGCGGCGAAGCGCGGCAAGTCCGT 600
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R R N F G L S P G G H H V * K N C Q G S A R Q E P D R D P R I A P R F1
E E I L G * A R V V T M S E K T V K V Q L V K S L I G T R E S H R F2
K K F W A K P G W S P C L K K L S R F S S S R A * S G P A N R T A F3
601 CGAAGAAATTTTGGGCTAAGCCCGGGTGGTCACCATGTCTGAAAAAACTGTCAAGGTTCAGCTCGTCAAGAGCCTGATCGGGACCCGCGAATCGCACCGC 700
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D R A W P G F1
A T V R G L X F2
R P C V A W F3
701 GCGACCGTGCGTGGCCTGG 719
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