BACT000003 (rpsC) allele sequence: id-368

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Illumina
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Sequence

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Translation


          R  S  S  V  S  P  R  A  P  R  A  A  V  T  A  S  R  S  N  P  V  T  S  L  *  R  S  G  I  K  E  P  Y  D   F1
           A  Q  A  F  H  R  A  R  Q  G  P  R  *  P  H  R  E  A  I  L  S  H  H  C  D  G  R  E  L  R  S  H  T     F2
            L  K  R  F  T  A  R  A  K  G  R  G  N  R  I  E  K  Q  S  C  H  I  T  V  T  V  G  N  *  G  A  I  R    F3
        1 CGCTCAAGCGTTTCACCGCGCGCGCCAAGGGCCGCGGTAACCGCATCGAGAAGCAATCCTGTCACATCACTGTGACGGTCGGGAATTAAGGAGCCATACG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  T  E  N  S  S  D  W  L  P  P  G  C  Q  P  Q  L  G  F  A  L  V  R  E  Q  Q  Q  F  R  G  D  A  A    F1
          M  G  Q  K  I  H  P  T  G  F  R  L  A  V  S  R  N  W  A  S  R  W  Y  A  N  N  N  N  F  A  A  M  L  Q   F2
           W  D  R  K  F  I  R  L  A  S  A  W  L  S  A  A  I  G  L  R  V  G  T  R  T  T  T  I  S  R  R  C  C     F3
      101 ATGGGACAGAAAATTCATCCGACTGGCTTCCGCCTGGCTGTCAGCCGCAATTGGGCTTCGCGTTGGTACGCGAACAACAACAATTTCGCGGCGATGCTGC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  R  H  R  C  S  *  V  S  E  E  E  A  E  E  R  F  G  R  S  R  R  H  R  A  S  G  E  E  R  A  H  H     F1
            E  D  I  G  V  R  E  Y  L  K  K  K  L  K  N  A  S  V  G  R  V  V  I  E  R  P  A  K  N  A  R  I  T    F2
          R  K  T  S  V  F  V  S  I  *  R  R  S  *  R  T  L  R  S  V  A  S  S  S  S  V  R  R  R  T  R  A  S  R   F3
      201 AGGAAGACATCGGTGTTCGTGAGTATCTGAAGAAGAAGCTGAAGAACGCTTCGGTCGGTCGCGTCGTCATCGAGCGTCCGGCGAAGAACGCGCGCATCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          D  F  Q  L  A  S  G  R  R  H  R  Q  E  G  *  G  Y  R  T  A  E  D  G  T  A  T  P  H  G  R  S  G  S  R   F1
           I  F  S  S  R  P  G  V  V  I  G  K  K  G  E  D  I  E  L  L  K  T  E  L  Q  R  R  M  G  V  P  V  H     F2
            F  S  A  R  V  R  A  S  S  S  A  R  R  V  R  I  S  N  C  *  R  R  N  C  N  A  A  W  A  F  R  F  T    F3
      301 GATTTTCAGCTCGCGTCCGGGCGTCGTCATCGGCAAGAAGGGTGAGGATATCGAACTGCTGAAGACGGAACTGCAACGCCGCATGGGCGTTCCGGTTCAC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Q  H  R  R  D  P  Q  A  G  N  R  C  A  A  D  R  R  L  H  H  A  A  A  R  A  P  D  H  V  P  S  R  D    F1
          V  N  I  E  E  I  R  K  P  E  T  D  A  Q  L  I  A  D  S  I  T  Q  Q  L  E  R  R  I  M  F  R  R  A  M   F2
           S  T  S  K  R  S  A  S  R  K  P  M  R  S  *  S  P  T  P  S  R  S  S  S  S  A  G  S  C  S  V  A  R     F3
      401 GTCAACATCGAAGAGATCCGCAAGCCGGAAACCGATGCGCAGCTGATCGCCGACTCCATCACGCAGCAGCTCGAGCGCCGGATCATGTTCCGTCGCGCGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           E  A  C  D  A  E  R  D  A  S  G  C  P  G  H  Q  D  H  E  R  R  P  S  E  R  Y  R  N  R  A  Y  G  V     F1
            K  R  A  M  Q  N  A  M  R  L  G  A  Q  G  I  K  I  M  S  A  G  R  L  N  G  I  E  I  A  R  T  E  W    F2
          *  S  V  R  C  R  T  R  C  V  W  V  P  R  A  S  R  S  *  A  Q  A  V  *  T  V  S  K  S  R  V  R  S  G   F3
      501 TGAAGCGTGCGATGCAGAACGCGATGCGTCTGGGTGCCCAGGGCATCAAGATCATGAGCGCAGGCCGTCTGAACGGTATCGAAATCGCGCGTACGGAGTG 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  S  R  R  S  R  A  A  A  Y  A  A  C  R  Y  R  L  R  D  F  G  S  E  D  D  L  R  D  H  R  R  Q  G  V   F1
           Y  R  E  G  R  V  P  L  H  T  L  R  A  D  I  D  Y  A  T  S  E  A  K  T  T  Y  G  I  I  G  V  K  V     F2
            I  A  K  V  A  C  R  C  I  R  C  V  P  I  S  T  T  R  L  R  K  R  R  R  P  T  G  S  S  A  S  R  C    F3
      601 GTATCGCGAAGGTCGCGTGCCGCTGCATACGCTGCGTGCCGATATCGACTACGCGACTTCGGAAGCGAAGACGACCTACGGGATCATCGGCGTCAAGGTG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  V  Q  G  R  Y  P  W  P  Q  R  R  A  G  G  G  R  S  S  R  R  Q  A  S  A  S  Q  C  A  S  G  R  P    F1
          W  V  Y  K  G  D  T  L  G  R  N  D  A  P  V  V  E  E  V  A  E  D  K  R  P  R  R  N  A  R  P  G  D  R   F2
           G  C  T  R  A  I  P  L  A  A  T  T  R  R  W  W  K  K  *  P  K  T  S  V  R  V  A  M  R  V  R  A  T     F3
      701 TGGGTGTACAAGGGCGATACCCTTGGCCGCAACGACGCGCCGGTGGTGGAAGAAGTAGCCGAAGACAAGCGTCCGCGTCGCAATGCGCGTCCGGGCGACC 800
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           S  S  A  P  *  R  R  R  R  R  S  G  C  S  S  W  R  T  A  P  W  R  R  Q  A  G  R  R  Q  D  W  R  I     F1
            R  P  R  R  D  G  E  G  G  A  P  G  A  R  R  G  A  P  R  R  G  A  G  K  P  E  D  G  K  T  G  E  *    F2
          V  V  R  A  V  T  A  K  A  A  L  R  V  L  V  V  A  H  R  A  V  A  P  A  S  R  K  T  A  R  L  E  N  N   F3
      801 GTCGTCCGCGCCGTGACGGCGAAGGCGGCGCTCCGGGTGCTCGTCGTGGCGCACCGCGCCGTGGCGCCGGCAAGCCGGAAGACGGCAAGACTGGAGAATA 900
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          T  M  L  Q  P  K  R  R  K  Y  R  K  E  Q  K  G  R  N  T  G  K  A  T  R  G  N  A  V  S  F  G  E  F  G   F1
           R  C  C  N  R  N  A  G  S  I  A  K  S  R  R  V  V  T  P  A  R  R  R  A  A  T  R  C  R  S  V  N  S     F2
            D  A  A  T  E  T  Q  E  V  S  Q  R  A  E  G  S  *  H  R  Q  G  D  A  R  Q  R  G  V  V  R  *  I  R    F3
      901 ACGATGCTGCAACCGAAACGCAGGAAGTATCGCAAAGAGCAGAAGGGTCGTAACACCGGCAAGGCGACGCGCGGCAACGCGGTGTCGTTCGGTGAATTCG 1000
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

                                                                                                                 F1
          X                                                                                                      F2
                                                                                                                 F3
     1001 G 1001
          -