BACT000002 (rpsB) allele sequence: id-368

Contig position

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3703
contig length
955088
start
684805
end
685545
length
741
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

AACCAGGGTG CCGGCCGCGC GGAGCAGGCG ACCTTTCGGG GCGCGTTCGC GCGGCGGGTA CGGCAGCCGG CTTAAGACCC AACCCTCGTG GAGAATTTAC ATGGCAGTCA CGATGCGCCA AATGCTGGAA GCGGGTGTCC ACTTCGGTCA CCAGACGCGC TTCTGGAACC CGAAGATGGC TCCGTTCATT TTCGGTCACC GCAACAAGAT TCACATCATC AACCTCGAAA AGACGCTGCC GATGTACAAC GACGCACTGA AGTACGTGCG TCAGCTGGCA GCGAACCGCG GCACGATCCT GTTCGTCGGC ACGAAGCGCC AGTCGCGCGA CACGATCGCG CAGGAAGCGC AGCGCGCGGG CATGCCGTTC GTGAACGCAC GCTGGCTCGG CGGCATGCTG ACCAACTTCA AGACGCTGAA GGTATCGATC AAGCGCCTGA AGGACATGGA AGCGGCAGTC GAGGCGGGCG AGCTCGAGAA GATGAGCAAG AAGGAAGCGC TGCTGTTCGA ACGTGAAATC GCCAAGCTGC AGAAGTCGAT CGGCGGCGTG AAGGACATGG GCGGCATTCC GGACGCGATC TTCGTCGTCG ACGTCGGCTA CCACAAGATC GCCGTCACCG AAGCGAACAA GCTCGGCGTG CCGGTCATCG CCGTGGTCGA CACGAACCAC TCGCCGGAAG GTGTGGACTA CGTGATCCCG GGCAACGACG ACTCGAGCAA GGCAGTCGCG CTGTACGCGC AAGGCGTGGC CGACGCGATC CTCGAAGGCC GTGCGAACGC GGTCAACGAA GTGGTCCAGG CGGTGCGCGG CGACGACGAA TACGTCGAGG AGAACGCGTA ACCGGCCCCG AGCCGGCGCA AAAAGGGGGC TCTCAACAGG CCCCCTTTTT TTAAGCTTGT GCGCCGGACC TGATCGCGCC GTCGCGGCGC GGGTCCGGAA A

Translation


          N  Q  G  A  G  R  A  E  Q  A  T  F  R  G  A  F  A  R  R  V  R  Q  P  A  *  D  P  T  L  V  E  N  L  H   F1
           T  R  V  P  A  A  R  S  R  R  P  F  G  A  R  S  R  G  G  Y  G  S  R  L  K  T  Q  P  S  W  R  I  Y     F2
            P  G  C  R  P  R  G  A  G  D  L  S  G  R  V  R  A  A  G  T  A  A  G  L  R  P  N  P  R  G  E  F  T    F3
        1 AACCAGGGTGCCGGCCGCGCGGAGCAGGCGACCTTTCGGGGCGCGTTCGCGCGGCGGGTACGGCAGCCGGCTTAAGACCCAACCCTCGTGGAGAATTTAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  S  H  D  A  P  N  A  G  S  G  C  P  L  R  S  P  D  A  L  L  E  P  E  D  G  S  V  H  F  R  S  P    F1
          M  A  V  T  M  R  Q  M  L  E  A  G  V  H  F  G  H  Q  T  R  F  W  N  P  K  M  A  P  F  I  F  G  H  R   F2
           W  Q  S  R  C  A  K  C  W  K  R  V  S  T  S  V  T  R  R  A  S  G  T  R  R  W  L  R  S  F  S  V  T     F3
      101 ATGGCAGTCACGATGCGCCAAATGCTGGAAGCGGGTGTCCACTTCGGTCACCAGACGCGCTTCTGGAACCCGAAGATGGCTCCGTTCATTTTCGGTCACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  Q  D  S  H  H  Q  P  R  K  D  A  A  D  V  Q  R  R  T  E  V  R  A  S  A  G  S  E  P  R  H  D  P     F1
            N  K  I  H  I  I  N  L  E  K  T  L  P  M  Y  N  D  A  L  K  Y  V  R  Q  L  A  A  N  R  G  T  I  L    F2
          A  T  R  F  T  S  S  T  S  K  R  R  C  R  C  T  T  T  H  *  S  T  C  V  S  W  Q  R  T  A  A  R  S  C   F3
      201 GCAACAAGATTCACATCATCAACCTCGAAAAGACGCTGCCGATGTACAACGACGCACTGAAGTACGTGCGTCAGCTGGCAGCGAACCGCGGCACGATCCT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          V  R  R  H  E  A  P  V  A  R  H  D  R  A  G  S  A  A  R  G  H  A  V  R  E  R  T  L  A  R  R  H  A  D   F1
           F  V  G  T  K  R  Q  S  R  D  T  I  A  Q  E  A  Q  R  A  G  M  P  F  V  N  A  R  W  L  G  G  M  L     F2
            S  S  A  R  S  A  S  R  A  T  R  S  R  R  K  R  S  A  R  A  C  R  S  *  T  H  A  G  S  A  A  C  *    F3
      301 GTTCGTCGGCACGAAGCGCCAGTCGCGCGACACGATCGCGCAGGAAGCGCAGCGCGCGGGCATGCCGTTCGTGAACGCACGCTGGCTCGGCGGCATGCTG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Q  L  Q  D  A  E  G  I  D  Q  A  P  E  G  H  G  S  G  S  R  G  G  R  A  R  E  D  E  Q  E  G  S  A    F1
          T  N  F  K  T  L  K  V  S  I  K  R  L  K  D  M  E  A  A  V  E  A  G  E  L  E  K  M  S  K  K  E  A  L   F2
           P  T  S  R  R  *  R  Y  R  S  S  A  *  R  T  W  K  R  Q  S  R  R  A  S  S  R  R  *  A  R  R  K  R     F3
      401 ACCAACTTCAAGACGCTGAAGGTATCGATCAAGCGCCTGAAGGACATGGAAGCGGCAGTCGAGGCGGGCGAGCTCGAGAAGATGAGCAAGAAGGAAGCGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  V  R  T  *  N  R  Q  A  A  E  V  D  R  R  R  E  G  H  G  R  H  S  G  R  D  L  R  R  R  R  R  L     F1
            L  F  E  R  E  I  A  K  L  Q  K  S  I  G  G  V  K  D  M  G  G  I  P  D  A  I  F  V  V  D  V  G  Y    F2
          C  C  S  N  V  K  S  P  S  C  R  S  R  S  A  A  *  R  T  W  A  A  F  R  T  R  S  S  S  S  T  S  A  T   F3
      501 TGCTGTTCGAACGTGAAATCGCCAAGCTGCAGAAGTCGATCGGCGGCGTGAAGGACATGGGCGGCATTCCGGACGCGATCTTCGTCGTCGACGTCGGCTA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          P  Q  D  R  R  H  R  S  E  Q  A  R  R  A  G  H  R  R  G  R  H  E  P  L  A  G  R  C  G  L  R  D  P  G   F1
           H  K  I  A  V  T  E  A  N  K  L  G  V  P  V  I  A  V  V  D  T  N  H  S  P  E  G  V  D  Y  V  I  P     F2
            T  R  S  P  S  P  K  R  T  S  S  A  C  R  S  S  P  W  S  T  R  T  T  R  R  K  V  W  T  T  *  S  R    F3
      601 CCACAAGATCGCCGTCACCGAAGCGAACAAGCTCGGCGTGCCGGTCATCGCCGTGGTCGACACGAACCACTCGCCGGAAGGTGTGGACTACGTGATCCCG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            Q  R  R  L  E  Q  G  S  R  A  V  R  A  R  R  G  R  R  D  P  R  R  P  C  E  R  G  Q  R  S  G  P  G    F1
          G  N  D  D  S  S  K  A  V  A  L  Y  A  Q  G  V  A  D  A  I  L  E  G  R  A  N  A  V  N  E  V  V  Q  A   F2
           A  T  T  T  R  A  R  Q  S  R  C  T  R  K  A  W  P  T  R  S  S  K  A  V  R  T  R  S  T  K  W  S  R     F3
      701 GGCAACGACGACTCGAGCAAGGCAGTCGCGCTGTACGCGCAAGGCGTGGCCGACGCGATCCTCGAAGGCCGTGCGAACGCGGTCAACGAAGTGGTCCAGG 800
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  A  R  R  R  R  I  R  R  G  E  R  V  T  G  P  E  P  A  Q  K  G  G  S  Q  Q  A  P  F  F  *  A  C     F1
            V  R  G  D  D  E  Y  V  E  E  N  A  *  P  A  P  S  R  R  K  K  G  A  L  N  R  P  P  F  F  K  L  V    F2
          R  C  A  A  T  T  N  T  S  R  R  T  R  N  R  P  R  A  G  A  K  R  G  L  S  T  G  P  L  F  L  S  L  C   F3
      801 CGGTGCGCGGCGACGACGAATACGTCGAGGAGAACGCGTAACCGGCCCCGAGCCGGCGCAAAAAGGGGGCTCTCAACAGGCCCCCTTTTTTTAAGCTTGT 900
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  P  D  L  I  A  P  S  R  R  G  S  G  X                                                               F1
           R  R  T  *  S  R  R  R  G  A  G  P  E  X                                                              F2
            A  G  P  D  R  A  V  A  A  R  V  R  K                                                                F3
      901 GCGCCGGACCTGATCGCGCCGTCGCGGCGCGGGTCCGGAAA 941
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