trpB allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3660
- contig length
- 965703
- start
- 191827
- end
- 192127
- length
- 301
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGACCGTCG TGCCGGTCGA ATCGGGTTCG CGCACGCTGA AGGACGCGCT GAACGAGGCG ATGCGCGACT GGGTCACGAA CATCGAGAAT ACGTTCTACA TCATCGGCAC GGTCGCGGGC CCGCATCCGT ATCCGATGAT GGTGCGCGAC TTCCAGCGCG TGATCGGCGA CGAATGCAAG GTGCAGATGC CCGAACTCGC CGGGCGCCAG CCCGACGCGG TGATCGCCTG CGTCGGCGGC GGCTCGAACG CGATGGGGAT CTTCTATCCG TACATCGACG ACGCGTCGGT GCAGCTGATC GGCGTCGAAG CCGCGGGCGA CGGCCTCGAC ACCGGCCATC ACGCGGCCTC GCTGATCGCC GGCAGCCCGG GCGTGCTGCA CGGCAACCGC ACCTATCTGC TGCAGGACGA CAACGGCCAG ATCATCGAGA CGCATTCGGT GTCGGCCGGC CTCGACTATC CGGGCGTCGG TCCCGAGCAC GCATGGCTGA AGGATAGCGG C
Translation
A T V V P V E S G S R T L K D A L N E A M R D W V T N I E N T F Y I F1
R P S C R S N R V R A R * R T R * T R R C A T G S R T S R I R S T F2
D R R A G R I G F A H A E G R A E R G D A R L G H E H R E Y V L H F3
1 GCGACCGTCGTGCCGGTCGAATCGGGTTCGCGCACGCTGAAGGACGCGCTGAACGAGGCGATGCGCGACTGGGTCACGAACATCGAGAATACGTTCTACA 100
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I G T V A G P H P Y P M M V R D F Q R V I G D E C K V Q M P E L A F1
S S A R S R A R I R I R * W C A T S S A * S A T N A R C R C P N S P F2
H R H G R G P A S V S D D G A R L P A R D R R R M Q G A D A R T R F3
101 TCATCGGCACGGTCGCGGGCCCGCATCCGTATCCGATGATGGTGCGCGACTTCCAGCGCGTGATCGGCGACGAATGCAAGGTGCAGATGCCCGAACTCGC 200
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G R Q P D A V I A C V G G G S N A M G I F Y P Y I D D A S V Q L I F1
G A S P T R * S P A S A A A R T R W G S S I R T S T T R R C S * S F2
R A P A R R G D R L R R R R L E R D G D L L S V H R R R V G A A D R F3
201 CGGGCGCCAGCCCGACGCGGTGATCGCCTGCGTCGGCGGCGGCTCGAACGCGATGGGGATCTTCTATCCGTACATCGACGACGCGTCGGTGCAGCTGATC 300
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G V E A A G D G L D T G H H A A S L I A G S P G V L H G N R T Y L L F1
A S K P R A T A S T P A I T R P R * S P A A R A C C T A T A P I C F2
R R S R G R R P R H R P S R G L A D R R Q P G R A A R Q P H L S A F3
301 GGCGTCGAAGCCGCGGGCGACGGCCTCGACACCGGCCATCACGCGGCCTCGCTGATCGCCGGCAGCCCGGGCGTGCTGCACGGCAACCGCACCTATCTGC 400
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Q D D N G Q I I E T H S V S A G L D Y P G V G P E H A W L K D S G F1
C R T T T A R S S R R I R C R P A S T I R A S V P S T H G * R I A A F2
A G R Q R P D H R D A F G V G R P R L S G R R S R A R M A E G * R F3
401 TGCAGGACGACAACGGCCAGATCATCGAGACGCATTCGGTGTCGGCCGGCCTCGACTATCCGGGCGTCGGTCCCGAGCACGCATGGCTGAAGGATAGCGG 500
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F1
F2
X F3
501 C 501
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