recA allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3634
contig length
222168
start
10255
end
10647
length
393
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

GAAAGCGGGC GCGCCTGTTA CAGACGCTGC TCATCATAGC AAAGGACGAT TCATGGAAGA AAGCAAGAAG GGCTCCGGGA TGACCGCCGA GAAGAGCAAG GCGCTGGCTG CCGCACTCGC GCAGATCGAG AAGCAGTTCG GCAAAGGGTC GATCATGCGC ATGGGCGACG GCGAGGCGGC CGAGGACATC CAGGTCGTGT CCACGGGCTC GCTCGGGCTC GACATCGCAC TGGGCGTCGG CGGCCTGCCG CGCGGCCGCG TGGTCGAGAT CTACGGGCCG GAATCGTCCG GCAAGACCAC GCTCACGCTG CAGGTCATCG CCGAGCTGCA GAAGCTGGGC GGCACCGCAG CGTTCATCGA CGCCGAGCAC GCGCTCGACG TCCAGTACGC GGCGAAGCTC GGCGTCAACG TGCCGGATCT GCTGATCTCG CAGCCGGATA CCGGCGAGCA GGCGCTCGAA ATCACCGACG CGCTGGTGCG CTCGGGCTCG ATCGACATGA TCGTCATCGA CTCGGTCGCG GCGCTCGTGC CGAAGGCCGA AATCGAAGGC GAGATGGGCG ATTCGCTGCC GGGCCTGCAG GCGCGCCTGA TGT

Translation


          E  S  G  R  A  C  Y  R  R  C  S  S  *  Q  R  T  I  H  G  R  K  Q  E  G  L  R  D  D  R  R  E  E  Q  G   F1
           K  A  G  A  P  V  T  D  A  A  H  H  S  K  G  R  F  M  E  E  S  K  K  G  S  G  M  T  A  E  K  S  K     F2
            K  R  A  R  L  L  Q  T  L  L  I  I  A  K  D  D  S  W  K  K  A  R  R  A  P  G  *  P  P  R  R  A  R    F3
        1 GAAAGCGGGCGCGCCTGTTACAGACGCTGCTCATCATAGCAAAGGACGATTCATGGAAGAAAGCAAGAAGGGCTCCGGGATGACCGCCGAGAAGAGCAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  G  C  R  T  R  A  D  R  E  A  V  R  Q  R  V  D  H  A  H  G  R  R  R  G  G  R  G  H  P  G  R  V    F1
          A  L  A  A  A  L  A  Q  I  E  K  Q  F  G  K  G  S  I  M  R  M  G  D  G  E  A  A  E  D  I  Q  V  V  S   F2
           R  W  L  P  H  S  R  R  S  R  S  S  S  A  K  G  R  S  C  A  W  A  T  A  R  R  P  R  T  S  R  S  C     F3
      101 GCGCTGGCTGCCGCACTCGCGCAGATCGAGAAGCAGTTCGGCAAAGGGTCGATCATGCGCATGGGCGACGGCGAGGCGGCCGAGGACATCCAGGTCGTGT 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           H  G  L  A  R  A  R  H  R  T  G  R  R  R  P  A  A  R  P  R  G  R  D  L  R  A  G  I  V  R  Q  D  H     F1
            T  G  S  L  G  L  D  I  A  L  G  V  G  G  L  P  R  G  R  V  V  E  I  Y  G  P  E  S  S  G  K  T  T    F2
          P  R  A  R  S  G  S  T  S  H  W  A  S  A  A  C  R  A  A  A  W  S  R  S  T  G  R  N  R  P  A  R  P  R   F3
      201 CCACGGGCTCGCTCGGGCTCGACATCGCACTGGGCGTCGGCGGCCTGCCGCGCGGCCGCGTGGTCGAGATCTACGGGCCGGAATCGTCCGGCAAGACCAC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  H  A  A  G  H  R  R  A  A  E  A  G  R  H  R  S  V  H  R  R  R  A  R  A  R  R  P  V  R  G  E  A  R   F1
           L  T  L  Q  V  I  A  E  L  Q  K  L  G  G  T  A  A  F  I  D  A  E  H  A  L  D  V  Q  Y  A  A  K  L     F2
            S  R  C  R  S  S  P  S  C  R  S  W  A  A  P  Q  R  S  S  T  P  S  T  R  S  T  S  S  T  R  R  S  S    F3
      301 GCTCACGCTGCAGGTCATCGCCGAGCTGCAGAAGCTGGGCGGCACCGCAGCGTTCATCGACGCCGAGCACGCGCTCGACGTCCAGTACGCGGCGAAGCTC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  Q  R  A  G  S  A  D  L  A  A  G  Y  R  R  A  G  A  R  N  H  R  R  A  G  A  L  G  L  D  R  H  D    F1
          G  V  N  V  P  D  L  L  I  S  Q  P  D  T  G  E  Q  A  L  E  I  T  D  A  L  V  R  S  G  S  I  D  M  I   F2
           A  S  T  C  R  I  C  *  S  R  S  R  I  P  A  S  R  R  S  K  S  P  T  R  W  C  A  R  A  R  S  T  *     F3
      401 GGCGTCAACGTGCCGGATCTGCTGATCTCGCAGCCGGATACCGGCGAGCAGGCGCTCGAAATCACCGACGCGCTGGTGCGCTCGGGCTCGATCGACATGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  R  L  G  R  G  A  R  A  E  G  R  N  R  R  R  D  G  R  F  A  A  G  P  A  G  A  P  D  V           F1
            V  I  D  S  V  A  A  L  V  P  K  A  E  I  E  G  E  M  G  D  S  L  P  G  L  Q  A  R  L  M  X          F2
          S  S  S  T  R  S  R  R  S  C  R  R  P  K  S  K  A  R  W  A  I  R  C  R  A  C  R  R  A  *  C            F3
      501 TCGTCATCGACTCGGTCGCGGCGCTCGTGCCGAAGGCCGAAATCGAAGGCGAGATGGGCGATTCGCTGCCGGGCCTGCAGGCGCGCCTGATGT 593
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