lepA allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3631
contig length
188069
start
64141
end
64537
length
397
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

CATCGGCGTG TTCACGCCGA AGTCGCGCAA TCTGGAATCG CTGTCGGCGG GGCAGGTGGG CTTCATCATC GCCGGCATCA AGGAACTGAC GGCCGCGAAG GTCGGCGATA CGGTCACGCA TGCGACGAAG GCCGCGGCCG AGCCGCTGCC GGGCTTCAAG GAAGTGAAGC CGCAGGTGTT CGCGGGCCTC TATCCGGTCG AGGCGAACCA GTACGACGCG CTGCGCGAAT CGCTCGAGAA GCTGAAGCTC AACGACGCAT CGCTGCAGTA CGAGCCGGAA GTGTCGCAGG CGCTCGGCTT CGGTTTCCGC TGCGGCTTCC TCGGGCTGCT GCACATGGAA ATCGTGCAAG AGCGGCTCGA GCGCGAATTC GACATGGACC TCATCACGAC CGCACCGACG GTCGTCTACG AGGTCGTGCA GAGCGACGGC TCGACGATCA TGGTCGAGAA CCCGGCGAAG ATGCCGGAGC CCGCGCGCAT CGCCGAGATC CGCGAGCCGA TCGTCACCGT GAACCTGTAC ATGCCGCAGG ACTACGTCGG CTCCGTGATC ACGCTGTGCG AGCAGAAGCG CGGCTCGCAG ATCAACATGC AGTACCA

Translation


          H  R  R  V  H  A  E  V  A  Q  S  G  I  A  V  G  G  A  G  G  L  H  H  R  R  H  Q  G  T  D  G  R  E  G   F1
           I  G  V  F  T  P  K  S  R  N  L  E  S  L  S  A  G  Q  V  G  F  I  I  A  G  I  K  E  L  T  A  A  K     F2
            S  A  C  S  R  R  S  R  A  I  W  N  R  C  R  R  G  R  W  A  S  S  S  P  A  S  R  N  *  R  P  R  R    F3
        1 CATCGGCGTGTTCACGCCGAAGTCGCGCAATCTGGAATCGCTGTCGGCGGGGCAGGTGGGCTTCATCATCGCCGGCATCAAGGAACTGACGGCCGCGAAG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  R  Y  G  H  A  C  D  E  G  R  G  R  A  A  A  G  L  Q  G  S  E  A  A  G  V  R  G  P  L  S  G  R    F1
          V  G  D  T  V  T  H  A  T  K  A  A  A  E  P  L  P  G  F  K  E  V  K  P  Q  V  F  A  G  L  Y  P  V  E   F2
           S  A  I  R  S  R  M  R  R  R  P  R  P  S  R  C  R  A  S  R  K  *  S  R  R  C  S  R  A  S  I  R  S     F3
      101 GTCGGCGATACGGTCACGCATGCGACGAAGGCCGCGGCCGAGCCGCTGCCGGGCTTCAAGGAAGTGAAGCCGCAGGTGTTCGCGGGCCTCTATCCGGTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           G  E  P  V  R  R  A  A  R  I  A  R  E  A  E  A  Q  R  R  I  A  A  V  R  A  G  S  V  A  G  A  R  L     F1
            A  N  Q  Y  D  A  L  R  E  S  L  E  K  L  K  L  N  D  A  S  L  Q  Y  E  P  E  V  S  Q  A  L  G  F    F2
          R  R  T  S  T  T  R  C  A  N  R  S  R  S  *  S  S  T  T  H  R  C  S  T  S  R  K  C  R  R  R  S  A  S   F3
      201 AGGCGAACCAGTACGACGCGCTGCGCGAATCGCTCGAGAAGCTGAAGCTCAACGACGCATCGCTGCAGTACGAGCCGGAAGTGTCGCAGGCGCTCGGCTT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          R  F  P  L  R  L  P  R  A  A  A  H  G  N  R  A  R  A  A  R  A  R  I  R  H  G  P  H  H  D  R  T  D  G   F1
           G  F  R  C  G  F  L  G  L  L  H  M  E  I  V  Q  E  R  L  E  R  E  F  D  M  D  L  I  T  T  A  P  T     F2
            V  S  A  A  A  S  S  G  C  C  T  W  K  S  C  K  S  G  S  S  A  N  S  T  W  T  S  S  R  P  H  R  R    F3
      301 CGGTTTCCGCTGCGGCTTCCTCGGGCTGCTGCACATGGAAATCGTGCAAGAGCGGCTCGAGCGCGAATTCGACATGGACCTCATCACGACCGCACCGACG 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  L  R  G  R  A  E  R  R  L  D  D  H  G  R  E  P  G  E  D  A  G  A  R  A  H  R  R  D  P  R  A  D    F1
          V  V  Y  E  V  V  Q  S  D  G  S  T  I  M  V  E  N  P  A  K  M  P  E  P  A  R  I  A  E  I  R  E  P  I   F2
           S  S  T  R  S  C  R  A  T  A  R  R  S  W  S  R  T  R  R  R  C  R  S  P  R  A  S  P  R  S  A  S  R     F3
      401 GTCGTCTACGAGGTCGTGCAGAGCGACGGCTCGACGATCATGGTCGAGAACCCGGCGAAGATGCCGGAGCCCGCGCGCATCGCCGAGATCCGCGAGCCGA 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  H  R  E  P  V  H  A  A  G  L  R  R  L  R  D  H  A  V  R  A  E  A  R  L  A  D  Q  H  A  V  P        F1
            V  T  V  N  L  Y  M  P  Q  D  Y  V  G  S  V  I  T  L  C  E  Q  K  R  G  S  Q  I  N  M  Q  Y  X       F2
          S  S  P  *  T  C  T  C  R  R  T  T  S  A  P  *  S  R  C  A  S  R  S  A  A  R  R  S  T  C  S  T  X      F3
      501 TCGTCACCGTGAACCTGTACATGCCGCAGGACTACGTCGGCTCCGTGATCACGCTGTGCGAGCAGAAGCGCGGCTCGCAGATCAACATGCAGTACCA 597
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