gyrB allele sequence: id-331
Contig position
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- forward
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGACCGACG TGAAGATGAA CGACAAGCAC GAACCGAAGC GCAGCGCCGC CGAGATCGTG ATGACCGAGC TCCACGCCGG CGGCAAGTTC GACCAGAACA GCTACAAGGT GTCGGGCGGG TTGCACGGCG TCGGCGTGTC GTGCGTGAAC GCGCTGTCGA GCTGGCTGCG CCTCACCGTG CGCCGCAACG GCAAGAAGCA CTTCATGGAG TTCCATCGCG GCGTCGCGCA GGATCGCGTG ATCGAAGTCG TCGACGGCGA GGAAGTGTCG CCGATGCAGG TGATCGGCGA TACCGAAAAC CGCGGCACCG AAGTGCACTT CATGGCCGAT CCGACGATCT TCGGCACCGT CGAGTACCAC TACGACATCC TCGCGAAGCG GATGCGCGAG CTCTCGTTCC TGAACAACGG CGTGCGGATC CGCCTGACCG ACCTGCGTTC GGGCAAGGAA GACGATTTCG CGTTCGCCGG CGGCGTGAAG GGCTTCGTCG AGTACATCAA CAAGACGAAG AGCAACCTGC ACCCGACGAT CTTCCATGTG ATCGGCGAGA AGGACGGCGT GGGCGTCGAA GTCGCGATGC AGTGGAACGA CAGCTACAAC GAGAACGTGC TGTGCTTCAC GAACAACATT CCGCAGCGCG ACGGCGGCAC GCAC
Translation
P T D V K M N D K H E P K R S A A E I V M T E L H A G G K F D Q N S F1
R P T * R * T T S T N R S A A P P R S * * P S S T P A A S S T R T F2
D R R E D E R Q A R T E A Q R R R D R D D R A P R R R Q V R P E Q F3
1 CCGACCGACGTGAAGATGAACGACAAGCACGAACCGAAGCGCAGCGCCGCCGAGATCGTGATGACCGAGCTCCACGCCGGCGGCAAGTTCGACCAGAACA 100
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Y K V S G G L H G V G V S C V N A L S S W L R L T V R R N G K K H F1
A T R C R A G C T A S A C R A * T R C R A G C A S P C A A T A R S T F2
L Q G V G R V A R R R R V V R E R A V E L A A P H R A P Q R Q E A F3
101 GCTACAAGGTGTCGGGCGGGTTGCACGGCGTCGGCGTGTCGTGCGTGAACGCGCTGTCGAGCTGGCTGCGCCTCACCGTGCGCCGCAACGGCAAGAAGCA 200
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F M E F H R G V A Q D R V I E V V D G E E V S P M Q V I G D T E N F1
S W S S I A A S R R I A * S K S S T A R K C R R C R * S A I P K T F2
L H G V P S R R R A G S R D R S R R R R G S V A D A G D R R Y R K P F3
201 CTTCATGGAGTTCCATCGCGGCGTCGCGCAGGATCGCGTGATCGAAGTCGTCGACGGCGAGGAAGTGTCGCCGATGCAGGTGATCGGCGATACCGAAAAC 300
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R G T E V H F M A D P T I F G T V E Y H Y D I L A K R M R E L S F L F1
A A P K C T S W P I R R S S A P S S T T T T S S R S G C A S S R S F2
R H R S A L H G R S D D L R H R R V P L R H P R E A D A R A L V P F3
301 CGCGGCACCGAAGTGCACTTCATGGCCGATCCGACGATCTTCGGCACCGTCGAGTACCACTACGACATCCTCGCGAAGCGGATGCGCGAGCTCTCGTTCC 400
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N N G V R I R L T D L R S G K E D D F A F A G G V K G F V E Y I N F1
* T T A C G S A * P T C V R A R K T I S R S P A A * R A S S S T S T F2
E Q R R A D P P D R P A F G Q G R R F R V R R R R E G L R R V H Q F3
401 TGAACAACGGCGTGCGGATCCGCCTGACCGACCTGCGTTCGGGCAAGGAAGACGATTTCGCGTTCGCCGGCGGCGTGAAGGGCTTCGTCGAGTACATCAA 500
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K T K S N L H P T I F H V I G E K D G V G V E V A M Q W N D S Y N F1
R R R A T C T R R S S M * S A R R T A W A S K S R C S G T T A T T F2
Q D E E Q P A P D D L P C D R R E G R R G R R S R D A V E R Q L Q R F3
501 CAAGACGAAGAGCAACCTGCACCCGACGATCTTCCATGTGATCGGCGAGAAGGACGGCGTGGGCGTCGAAGTCGCGATGCAGTGGAACGACAGCTACAAC 600
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E N V L C F T N N I P Q R D G G T H F1
R T C C A S R T T F R S A T A A R T F2
E R A V L H E Q H S A A R R R H A X F3
601 GAGAACGTGCTGTGCTTCACGAACAACATTCCGCAGCGCGACGGCGGCACGCAC 654
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