atpD allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3633
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- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GTGGAATTCC CGCGCGACAG CATGCCGAAG ATCTACGACG CGCTCATTCT CGATGGCTCG GAACTGACGC TCGAAGTCCA GCAGCAGCTG GGCGACGGCG TGGTCCGTAC CATCTGTCTG GGTGCATCCG ACGGCCTGCG CCGCGGTCTG ACCGTGAAGA ACACGGGCAA TCCGATTTCG GTGCCGGTCG GCAAGCCGAC CCTCGGCCGC ATCATGGACG TGCTCGGCCG TCCGATCGAC GAAGCGGGCC CGATCGAAAG CGAAACGAAG CGTTCGATCC ACCAGAAGGC GCCGGCGTTC GACGAACTGT CGCCGTCGAC CGAACTGCTC GAAACCGGCA TCAAGGTCAT CGACCTGATC TGCCCGTTCG CAAAGGGCGG CAAGGTCGGT CTGTTCGGCG GTGCAGGCGT GGGCAAGACC GTCAACATGA TGGAGCTCAT CAACAACATC GCGAAGGAGC ACGGCGGTTA CTCCGTGTTC GCGGGCGTGG GCGAGCGTAC CCGTGAAGGG AACGACTTCT ACCACGAAAT GAAGGACTCG AACGTTCTCG ACAAGGTCGC GCTCGTGTAC GGCCAGATGA ACGAGCCGCC GGGCAACCGT CTGCGCGTCG CGCTGACCGG CCTGACGATG GCCGAGTTCT TCC
Translation
V E F P R D S M P K I Y D A L I L D G S E L T L E V Q Q Q L G D G V F1
W N S R A T A C R R S T T R S F S M A R N * R S K S S S S W A T A F2
G I P A R Q H A E D L R R A H S R W L G T D A R S P A A A G R R R F3
1 GTGGAATTCCCGCGCGACAGCATGCCGAAGATCTACGACGCGCTCATTCTCGATGGCTCGGAACTGACGCTCGAAGTCCAGCAGCAGCTGGGCGACGGCG 100
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V R T I C L G A S D G L R R G L T V K N T G N P I S V P V G K P T F1
W S V P S V W V H P T A C A A V * P * R T R A I R F R C R S A S R P F2
G P Y H L S G C I R R P A P R S D R E E H G Q S D F G A G R Q A D F3
101 TGGTCCGTACCATCTGTCTGGGTGCATCCGACGGCCTGCGCCGCGGTCTGACCGTGAAGAACACGGGCAATCCGATTTCGGTGCCGGTCGGCAAGCCGAC 200
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L G R I M D V L G R P I D E A G P I E S E T K R S I H Q K A P A F F1
S A A S W T C S A V R S T K R A R S K A K R S V R S T R R R R R S F2
P R P H H G R A R P S D R R S G P D R K R N E A F D P P E G A G V R F3
201 CCTCGGCCGCATCATGGACGTGCTCGGCCGTCCGATCGACGAAGCGGGCCCGATCGAAAGCGAAACGAAGCGTTCGATCCACCAGAAGGCGCCGGCGTTC 300
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D E L S P S T E L L E T G I K V I D L I C P F A K G G K V G L F G G F1
T N C R R R P N C S K P A S R S S T * S A R S Q R A A R S V C S A F2
R T V A V D R T A R N R H Q G H R P D L P V R K G R Q G R S V R R F3
301 GACGAACTGTCGCCGTCGACCGAACTGCTCGAAACCGGCATCAAGGTCATCGACCTGATCTGCCCGTTCGCAAAGGGCGGCAAGGTCGGTCTGTTCGGCG 400
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A G V G K T V N M M E L I N N I A K E H G G Y S V F A G V G E R T F1
V Q A W A R P S T * W S S S T T S R R S T A V T P C S R A W A S V P F2
C R R G Q D R Q H D G A H Q Q H R E G A R R L L R V R G R G R A Y F3
401 GTGCAGGCGTGGGCAAGACCGTCAACATGATGGAGCTCATCAACAACATCGCGAAGGAGCACGGCGGTTACTCCGTGTTCGCGGGCGTGGGCGAGCGTAC 500
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R E G N D F Y H E M K D S N V L D K V A L V Y G Q M N E P P G N R F1
V K G T T S T T K * R T R T F S T R S R S C T A R * T S R R A T V F2
P * R E R L L P R N E G L E R S R Q G R A R V R P D E R A A G Q P S F3
501 CCGTGAAGGGAACGACTTCTACCACGAAATGAAGGACTCGAACGTTCTCGACAAGGTCGCGCTCGTGTACGGCCAGATGAACGAGCCGCCGGGCAACCGT 600
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L R V A L T G L T M A E F F X F1
C A S R * P A * R W P S S S F2
A R R A D R P D D G R V L P F3
601 CTGCGCGTCGCGCTGACCGGCCTGACGATGGCCGAGTTCTTCC 643
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