BACT000065 (rpmJ) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 11679
- end
- 11795
- length
- 117
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCTGCCGGGC GACAAGGTGA CGGTTGAATT GACGCCTTAC GATCTGTCTC GTGCGCGGAT CGTGTTCCGG GCGAAGTGAT TTGGAAAAAA GGGTATTATC ATGAAAGTGA TGGCATCGGT TAAGCGCATT TGCCGCAATT GCAAGATCAT CAAGCGCAAA GGCGTCGTTC GCGTGATCTG CAGCTCGGAT CCGCGCCACA AGCAGCGCCA AGGCTGACCG CGCGTTTGTT TGCGCTTTTT GTTTGAGGAA AAACAATGGC TCGTATCGCA GGGGTTAACA TCCCGAATCA CCAGCATACC GAGATCGGCC TGACGGC
Translation
P A G R Q G D G * I D A L R S V S C A D R V P G E V I W K K G Y Y H F1
L P G D K V T V E L T P Y D L S R A R I V F R A K * F G K K G I I F2
C R A T R * R L N * R L T I C L V R G S C S G R S D L E K R V L S F3
1 CCTGCCGGGCGACAAGGTGACGGTTGAATTGACGCCTTACGATCTGTCTCGTGCGCGGATCGTGTTCCGGGCGAAGTGATTTGGAAAAAAGGGTATTATC 100
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E S D G I G * A H L P Q L Q D H Q A Q R R R S R D L Q L G S A P Q F1
M K V M A S V K R I C R N C K I I K R K G V V R V I C S S D P R H K F2
* K * W H R L S A F A A I A R S S S A K A S F A * S A A R I R A T F3
101 ATGAAAGTGATGGCATCGGTTAAGCGCATTTGCCGCAATTGCAAGATCATCAAGCGCAAAGGCGTCGTTCGCGTGATCTGCAGCTCGGATCCGCGCCACA 200
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A A P R L T A R L F A L F V * G K T M A R I A G V N I P N H Q H T F1
Q R Q G * P R V C L R F L F E E K Q W L V S Q G L T S R I T S I P F2
S S A K A D R A F V C A F C L R K N N G S Y R R G * H P E S P A Y R F3
201 AGCAGCGCCAAGGCTGACCGCGCGTTTGTTTGCGCTTTTTGTTTGAGGAAAAACAATGGCTCGTATCGCAGGGGTTAACATCCCGAATCACCAGCATACC 300
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E I G L T A F1
R S A * R X F2
D R P D G F3
301 GAGATCGGCCTGACGGC 317
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