BACT000063 (rpmH) allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3633
contig length
275814
start
9642
end
9776
length
135
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

AAACCAATCC TGTATTTCCG GCGATTGCGT TCGCCCGAAG GCGTCCGGTA AGGGCACGCG GTCCCCTGAA TTTCGACATT CTCGAACAAG TGAGAGCATC ATGAAACGTA CTTACCAACC GTCCGTGACG CGCCGCAAGC GCACCCATGG CTTCCGTGTC CGCATGAAGA CGGCAGGCGG CCGCAAGGTC ATCAACGCTC GCCGCGCGAA GGGCCGCAAG CGTCTCGCCA TCTAAGGCGG GTTGCGCGCT GTGTCCGCCG TCCGCAGCCC TGCGGAGGGT GCCGTCGAAC CGGGTGCGAA TCCGTTGCAG ACGAAAGCCG CCTTCCCGAA AGCTG

Translation


          K  P  I  L  Y  F  R  R  L  R  S  P  E  G  V  R  *  G  H  A  V  P  *  I  S  T  F  S  N  K  *  E  H  H   F1
           N  Q  S  C  I  S  G  D  C  V  R  P  K  A  S  G  K  G  T  R  S  P  E  F  R  H  S  R  T  S  E  S  I     F2
            T  N  P  V  F  P  A  I  A  F  A  R  R  R  P  V  R  A  R  G  P  L  N  F  D  I  L  E  Q  V  R  A  S    F3
        1 AAACCAATCCTGTATTTCCGGCGATTGCGTTCGCCCGAAGGCGTCCGGTAAGGGCACGCGGTCCCCTGAATTTCGACATTCTCGAACAAGTGAGAGCATC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            E  T  Y  L  P  T  V  R  D  A  P  Q  A  H  P  W  L  P  C  P  H  E  D  G  R  R  P  Q  G  H  Q  R  S    F1
          M  K  R  T  Y  Q  P  S  V  T  R  R  K  R  T  H  G  F  R  V  R  M  K  T  A  G  G  R  K  V  I  N  A  R   F2
           *  N  V  L  T  N  R  P  *  R  A  A  S  A  P  M  A  S  V  S  A  *  R  R  Q  A  A  A  R  S  S  T  L     F3
      101 ATGAAACGTACTTACCAACCGTCCGTGACGCGCCGCAAGCGCACCCATGGCTTCCGTGTCCGCATGAAGACGGCAGGCGGCCGCAAGGTCATCAACGCTC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           P  R  E  G  P  Q  A  S  R  H  L  R  R  V  A  R  C  V  R  R  P  Q  P  C  G  G  C  R  R  T  G  C  E     F1
            R  A  K  G  R  K  R  L  A  I  *  G  G  L  R  A  V  S  A  V  R  S  P  A  E  G  A  V  E  P  G  A  N    F2
          A  A  R  R  A  A  S  V  S  P  S  K  A  G  C  A  L  C  P  P  S  A  A  L  R  R  V  P  S  N  R  V  R  I   F3
      201 GCCGCGCGAAGGGCCGCAAGCGTCTCGCCATCTAAGGCGGGTTGCGCGCTGTGTCCGCCGTCCGCAGCCCTGCGGAGGGTGCCGTCGAACCGGGTGCGAA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  A  D  E  S  R  L  P  E  S  X                                                                     F1
           P  L  Q  T  K  A  A  F  P  K  A  X                                                                    F2
            R  C  R  R  K  P  P  S  R  K  L                                                                      F3
      301 TCCGTTGCAGACGAAAGCCGCCTTCCCGAAAGCTG 335
          ----:----|----:----|----:----|----: