BACT000061 (rpmF) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3631
- contig length
- 188069
- start
- 52451
- end
- 52630
- length
- 180
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTGAGCAGTG TGGCGCGGGA AGGCGTAAGG GCCGTGGGCC AGGGTAGTTA AGCGCCGGAT CGGGCTGTGT TAGAATCCGG AAAATTTTTA GGAGTTAGTC ATGGCAGTCC AGCAAAACAA GAAGTCGCCG TCGAAGCGCG GCATGCATCG TTCGCACGAT TTCCTGACGG CAGCGCCGCT GGCAGTCGAG CCGAGCACGG GTGAAGTGCA TCTGCGTCAC CACATCAGCC CGAACGGCTA CTATCGCGGC AAGAAAGTCG TCAAGACGAA GAACGACTAA GCGTCTCCTC GTGCGTTGCG CGTTACGATG GCCATTCGCG TGACAACTGG TTCGCTTGAC ACTTTCCTGG CTCAACAAAA AGGCGGCATT CAATTGCCGC
Translation
L S S V A R E G V R A V G Q G S * A P D R A V L E S G K F L G V S H F1
* A V W R G K A * G P W A R V V K R R I G L C * N P E N F * E L V F2
E Q C G A G R R K G R G P G * L S A G S G C V R I R K I F R S * S F3
1 CTGAGCAGTGTGGCGCGGGAAGGCGTAAGGGCCGTGGGCCAGGGTAGTTAAGCGCCGGATCGGGCTGTGTTAGAATCCGGAAAATTTTTAGGAGTTAGTC 100
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G S P A K Q E V A V E A R H A S F A R F P D G S A A G S R A E H G F1
M A V Q Q N K K S P S K R G M H R S H D F L T A A P L A V E P S T G F2
W Q S S K T R S R R R S A A C I V R T I S * R Q R R W Q S S R A R F3
101 ATGGCAGTCCAGCAAAACAAGAAGTCGCCGTCGAAGCGCGGCATGCATCGTTCGCACGATTTCCTGACGGCAGCGCCGCTGGCAGTCGAGCCGAGCACGG 200
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* S A S A S P H Q P E R L L S R Q E S R Q D E E R L S V S S C V A F1
E V H L R H H I S P N G Y Y R G K K V V K T K N D * A S P R A L R F2
V K C I C V T T S A R T A T I A A R K S S R R R T T K R L L V R C A F3
201 GTGAAGTGCATCTGCGTCACCACATCAGCCCGAACGGCTACTATCGCGGCAAGAAAGTCGTCAAGACGAAGAACGACTAAGCGTCTCCTCGTGCGTTGCG 300
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R Y D G H S R D N W F A * H F P G S T K R R H S I A A F1
V T M A I R V T T G S L D T F L A Q Q K G G I Q L P X F2
L R W P F A * Q L V R L T L S W L N K K A A F N C R F3
301 CGTTACGATGGCCATTCGCGTGACAACTGGTTCGCTTGACACTTTCCTGGCTCAACAAAAAGGCGGCATTCAATTGCCGC 380
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