BACT000059 (rpmD) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 9396
- end
- 9578
- length
- 183
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GACGCTGGAC GGCCTGCGCA AGCAGTCGAC CCCGGCAGAC ATCGCGGCGA AGCGCGGCAA GTCCGTCGAA GAAATTTTGG GCTAAGCCCG GGTGGTCACC ATGTCTGAAA AAACTGTCAA GGTTCAGCTC GTCAAGAGCC TGATCGGGAC CCGCGAATCG CACCGCGCGA CCGTGCGTGG CCTGGGCCTG CGCCGACTCA ACTCGGTCAG CGAGCTTCAG GACACGCCGG CGGTCCGCGG CATGATCAAC AAGGTCTCGT ACCTCGTTAA GGTCATCGCG TAAGCGGCCC TACGGATCAA GGAGTTGATA TGGAATTGAA TAACCTGAAG CCGGCCGCTG GCGCCAAGCA CGCCAAGCGT CGCGTCGGCC GCGGCATCGG TTC
Translation
D A G R P A Q A V D P G R H R G E A R Q V R R R N F G L S P G G H H F1
T L D G L R K Q S T P A D I A A K R G K S V E E I L G * A R V V T F2
R W T A C A S S R P R Q T S R R S A A S P S K K F W A K P G W S P F3
1 GACGCTGGACGGCCTGCGCAAGCAGTCGACCCCGGCAGACATCGCGGCGAAGCGCGGCAAGTCCGTCGAAGAAATTTTGGGCTAAGCCCGGGTGGTCACC 100
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V * K N C Q G S A R Q E P D R D P R I A P R D R A W P G P A P T Q F1
M S E K T V K V Q L V K S L I G T R E S H R A T V R G L G L R R L N F2
C L K K L S R F S S S R A * S G P A N R T A R P C V A W A C A D S F3
101 ATGTCTGAAAAAACTGTCAAGGTTCAGCTCGTCAAGAGCCTGATCGGGACCCGCGAATCGCACCGCGCGACCGTGCGTGGCCTGGGCCTGCGCCGACTCA 200
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L G Q R A S G H A G G P R H D Q Q G L V P R * G H R V S G P T D Q F1
S V S E L Q D T P A V R G M I N K V S Y L V K V I A * A A L R I K F2
T R S A S F R T R R R S A A * S T R S R T S L R S S R K R P Y G S R F3
201 ACTCGGTCAGCGAGCTTCAGGACACGCCGGCGGTCCGCGGCATGATCAACAAGGTCTCGTACCTCGTTAAGGTCATCGCGTAAGCGGCCCTACGGATCAA 300
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G V D M E L N N L K P A A G A K H A K R R V G R G I G S F1
E L I W N * I T * S R P L A P S T P S V A S A A A S V X F2
S * Y G I E * P E A G R W R Q A R Q A S R R P R H R F F3
301 GGAGTTGATATGGAATTGAATAACCTGAAGCCGGCCGCTGGCGCCAAGCACGCCAAGCGTCGCGTCGGCCGCGGCATCGGTTC 383
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