BACT000058 (rpmC) allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3651
contig length
215670
start
5179
end
5373
length
195
orientation
forward
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

ATCCGAAGAA CTGGCGCGTG AGGCGTTCCG TCTGGCTGCA GCGAAGCTGC CGATCCAGAC CGCGTTTATC GTTCGCCAGC TCGGCGCCTA AGGAGAAAAC ATGAAGGCTT CCGAACTTCT CCAGAAAGAC CAGGCCGCGC TCAACAAAGA GCTGGCGGAC CTGCTGAAGG CGCAATTCGG CCTGCGCATG CAACTCGCGA CCCAGCAGCT CACGAACACG AGCCAGCTGA AGAAGGTTCG TCGCGACATC GCACGTGTGC GGACCGTCAT GACTCAGAAG GCGAACCAGA AATGAACGAT AGCGTGAAAA CCTCGCTGAA GCGGACGCTG ATCGGTCGGG TCGTCAGCAA CAAGATGGAC AAGACCGTCA CCGTGCTGGT CGAGCACCGC GTCAA

Translation


          I  R  R  T  G  A  *  G  V  P  S  G  C  S  E  A  A  D  P  D  R  V  Y  R  S  P  A  R  R  L  R  R  K  H   F1
           S  E  E  L  A  R  E  A  F  R  L  A  A  A  K  L  P  I  Q  T  A  F  I  V  R  Q  L  G  A  *  G  E  N     F2
            P  K  N  W  R  V  R  R  S  V  W  L  Q  R  S  C  R  S  R  P  R  L  S  F  A  S  S  A  P  K  E  K  T    F3
        1 ATCCGAAGAACTGGCGCGTGAGGCGTTCCGTCTGGCTGCAGCGAAGCTGCCGATCCAGACCGCGTTTATCGTTCGCCAGCTCGGCGCCTAAGGAGAAAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            E  G  F  R  T  S  P  E  R  P  G  R  A  Q  Q  R  A  G  G  P  A  E  G  A  I  R  P  A  H  A  T  R  D    F1
          M  K  A  S  E  L  L  Q  K  D  Q  A  A  L  N  K  E  L  A  D  L  L  K  A  Q  F  G  L  R  M  Q  L  A  T   F2
           *  R  L  P  N  F  S  R  K  T  R  P  R  S  T  K  S  W  R  T  C  *  R  R  N  S  A  C  A  C  N  S  R     F3
      101 ATGAAGGCTTCCGAACTTCTCCAGAAAGACCAGGCCGCGCTCAACAAAGAGCTGGCGGACCTGCTGAAGGCGCAATTCGGCCTGCGCATGCAACTCGCGA 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           P  A  A  H  E  H  E  P  A  E  E  G  S  S  R  H  R  T  C  A  D  R  H  D  S  E  G  E  P  E  M  N  D     F1
            Q  Q  L  T  N  T  S  Q  L  K  K  V  R  R  D  I  A  R  V  R  T  V  M  T  Q  K  A  N  Q  K  *  T  I    F2
          P  S  S  S  R  T  R  A  S  *  R  R  F  V  A  T  S  H  V  C  G  P  S  *  L  R  R  R  T  R  N  E  R  *   F3
      201 CCCAGCAGCTCACGAACACGAGCCAGCTGAAGAAGGTTCGTCGCGACATCGCACGTGTGCGGACCGTCATGACTCAGAAGGCGAACCAGAAATGAACGAT 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  V  K  T  S  L  K  R  T  L  I  G  R  V  V  S  N  K  M  D  K  T  V  T  V  L  V  E  H  R  V  X         F1
           A  *  K  P  R  *  S  G  R  *  S  V  G  S  S  A  T  R  W  T  R  P  S  P  C  W  S  S  T  A  S  X        F2
            R  E  N  L  A  E  A  D  A  D  R  S  G  R  Q  Q  Q  D  G  Q  D  R  H  R  A  G  R  A  P  R  Q          F3
      301 AGCGTGAAAACCTCGCTGAAGCGGACGCTGATCGGTCGGGTCGTCAGCAACAAGATGGACAAGACCGTCACCGTGCTGGTCGAGCACCGCGTCAA 395
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----: