BACT000056 (rpmA) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3669
- contig length
- 237260
- start
- 195836
- end
- 196099
- length
- 264
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGGAAGCAC TACCAAAAGC ACGGCGGCCA CCGCCAGAAC TACACTGAGC TGCGCATCGA CGCGATCAAC GCGTAAGCGC CTCGGTAAAG GAGCAATCAG ATGGCACACA AAAAGGCAGG CGGCTCGTCC CGTAACGGCC GCGACTCCGA GTCGAAACGT CTCGGCGTGA AAGTGTATGG CGGCCAGGCG ATCAACGCCG GCGGCATCAT CGTGCGTCAG CGCGGCACGC GCATGCACGC AGGCGAGAAC GTCGGCATGG GCAAGGATCA CACCCTGTTC GCGCTGGTCG ACGGTCACGT GAAGTTCGCG ACGAAGGGCG CGGACAAGAA GCATACGGTC ATCGTCGTCC CGGCAGCTGC CTGAGTTCAG GCATCACGGG CTTCGTAGCC GAAAGGCCCC GCAGTCTTCG CGGGGCCTTT TTTATTGGCC GCCGCGCGCA GGTGCGCGCC GGCGGCCGTC GCAA
Translation
P E A L P K A R R P P P E L H * A A H R R D Q R V S A S V K E Q S D F1
R K H Y Q K H G G H R Q N Y T E L R I D A I N A * A P R * R S N Q F2
G S T T K S T A A T A R T T L S C A S T R S T R K R L G K G A I R F3
1 CCGGAAGCACTACCAAAAGCACGGCGGCCACCGCCAGAACTACACTGAGCTGCGCATCGACGCGATCAACGCGTAAGCGCCTCGGTAAAGGAGCAATCAG 100
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G T Q K G R R L V P * R P R L R V E T S R R E S V W R P G D Q R R F1
M A H K K A G G S S R N G R D S E S K R L G V K V Y G G Q A I N A G F2
W H T K R Q A A R P V T A A T P S R N V S A * K C M A A R R S T P F3
101 ATGGCACACAAAAAGGCAGGCGGCTCGTCCCGTAACGGCCGCGACTCCGAGTCGAAACGTCTCGGCGTGAAAGTGTATGGCGGCCAGGCGATCAACGCCG 200
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R H H R A S A R H A H A R R R E R R H G Q G S H P V R A G R R S R F1
G I I V R Q R G T R M H A G E N V G M G K D H T L F A L V D G H V F2
A A S S C V S A A R A C T Q A R T S A W A R I T P C S R W S T V T * F3
201 GCGGCATCATCGTGCGTCAGCGCGGCACGCGCATGCACGCAGGCGAGAACGTCGGCATGGGCAAGGATCACACCCTGTTCGCGCTGGTCGACGGTCACGT 300
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E V R D E G R G Q E A Y G H R R P G S C L S S G I T G F V A E R P R F1
K F A T K G A D K K H T V I V V P A A A * V Q A S R A S * P K G P F2
S S R R R A R T R S I R S S S S R Q L P E F R H H G L R S R K A P F3
301 GAAGTTCGCGACGAAGGGCGCGGACAAGAAGCATACGGTCATCGTCGTCCCGGCAGCTGCCTGAGTTCAGGCATCACGGGCTTCGTAGCCGAAAGGCCCC 400
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S L R G A F F I G R R A Q V R A G G R R X F1
A V F A G P F L L A A A R R C A P A A V A X F2
Q S S R G L F Y W P P R A G A R R R P S Q F3
401 GCAGTCTTCGCGGGGCCTTTTTTATTGGCCGCCGCGCGCAGGTGCGCGCCGGCGGCCGTCGCAA 464
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