BACT000052 (rplW) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 2166
- end
- 2480
- length
- 315
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CAGTTGTCGA GCCGCGCTAC GCTGACCCGC TGTCGCTGAT CTACTTCAAG AAAGTGCTGG TCACGAAGGC TGCGGTCGCC CAGATCGAGG AGTTGCTGTC ATGAGCGAGA TTCGCAAGAA CGATCATCGT TTGATGCAGG TCCTGCTCGC ACCGGTGATT TCCGAAAAGG CGACGCTGGT TGCCGACAAG AACGAGCAAG TCGTGTTCGA AGTCGCACCG GATGCCACGA AGCAGGAAGT GAAGGCGGCT GTCGAGCTGC TGTTCAAGGT TGAAGTTGAT TCCGTCAACG TGCTGGTTCA GAAGGGCAAG CAAAAGCGCT TCGGCCGTTC GATGGGCCGC CGCAAGGACG TGAAGAAGGC ATACGTGTGC CTGAAGCCCG GCCAGGAAAT CAACTTCGAA GCGGAGGCCA AGTAATCATG GCAATCGTGA AAGTTAAACC GACCTCGCCG GGCCGCCGCG CGATGGTCAA GGTGGTCAAC AAGGACCTGC ACAAGGGCAA GCCGCACGCG GCACT
Translation
Q L S S R A T L T R C R * S T S R K C W S R R L R S P R S R S C C H F1
S C R A A L R * P A V A D L L Q E S A G H E G C G R P D R G V A V F2
V V E P R Y A D P L S L I Y F K K V L V T K A A V A Q I E E L L S F3
1 CAGTTGTCGAGCCGCGCTACGCTGACCCGCTGTCGCTGATCTACTTCAAGAAAGTGCTGGTCACGAAGGCTGCGGTCGCCCAGATCGAGGAGTTGCTGTC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E R D S Q E R S S F D A G P A R T G D F R K G D A G C R Q E R A S F1
M S E I R K N D H R L M Q V L L A P V I S E K A T L V A D K N E Q V F2
* A R F A R T I I V * C R S C S H R * F P K R R R W L P T R T S K F3
101 ATGAGCGAGATTCGCAAGAACGATCATCGTTTGATGCAGGTCCTGCTCGCACCGGTGATTTCCGAAAAGGCGACGCTGGTTGCCGACAAGAACGAGCAAG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R V R S R T G C H E A G S E G G C R A A V Q G * S * F R Q R A G S F1
V F E V A P D A T K Q E V K A A V E L L F K V E V D S V N V L V Q F2
S C S K S H R M P R S R K * R R L S S C C S R L K L I P S T C W F R F3
201 TCGTGTTCGAAGTCGCACCGGATGCCACGAAGCAGGAAGTGAAGGCGGCTGTCGAGCTGCTGTTCAAGGTTGAAGTTGATTCCGTCAACGTGCTGGTTCA 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
E G Q A K A L R P F D G P P Q G R E E G I R V P E A R P G N Q L R S F1
K G K Q K R F G R S M G R R K D V K K A Y V C L K P G Q E I N F E F2
R A S K S A S A V R W A A A R T * R R H T C A * S P A R K S T S K F3
301 GAAGGGCAAGCAAAAGCGCTTCGGCCGTTCGATGGGCCGCCGCAAGGACGTGAAGAAGGCATACGTGTGCCTGAAGCCCGGCCAGGAAATCAACTTCGAA 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G G Q V I M A I V K V K P T S P G R R A M V K V V N K D L H K G K F1
A E A K * S W Q S * K L N R P R R A A A R W S R W S T R T C T R A S F2
R R P S N H G N R E S * T D L A G P P R D G Q G G Q Q G P A Q G Q F3
401 GCGGAGGCCAAGTAATCATGGCAATCGTGAAAGTTAAACCGACCTCGCCGGGCCGCCGCGCGATGGTCAAGGTGGTCAACAAGGACCTGCACAAGGGCAA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P H A A L F1
R T R H X F2
A A R G T F3
501 GCCGCACGCGGCACT 515
----:----|----: