BACT000050 (rplU) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3669
- contig length
- 237260
- start
- 196124
- end
- 196435
- length
- 312
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCAATCGTCG ATCGGCTTTG ACTTCGATGC TAACTCTCTG TATAATCACG CCTTTTCCGC GCGTGGTGTG CGGAAAAATG GATCCAGAGT GAGGTTCTCA ATGTACGCGG TCATAAAAAC CGGCGGCAAG CAGTACAAGG TTGCCGTTGG CGAAAAACTG AAAGTAGAAC AGATACCGGC TGACATTGAC GCTGAAATCA CGCTCGACCA GGTTCTCGCA GTGGGCGAAG GCGAATCGAT TAAGTTCGGT ACGCCGCTGG TCAGTGGGGC TTCCGTCAAG GCCACCGTCG TGTCGCACGG TCGTCACGCC AAGGTCACCA TCTTCAAGAT GCGTCGCCGG AAGCACTACC AAAAGCACGG CGGCCACCGC CAGAACTACA CTGAGCTGCG CATCGACGCG ATCAACGCGT AAGCGCCTCG GTAAAGGAGC AATCAGATGG CACACAAAAA GGCAGGCGGC TCGTCCCGTA ACGGCCGCGA CTCCGAGTCG AAACGTCTCG GCGTGAAAGT GT
Translation
A I V D R L * L R C * L S V * S R L F R A W C A E K W I Q S E V L N F1
Q S S I G F D F D A N S L Y N H A F S A R G V R K N G S R V R F S F2
N R R S A L T S M L T L C I I T P F P R V V C G K M D P E * G S Q F3
1 GCAATCGTCGATCGGCTTTGACTTCGATGCTAACTCTCTGTATAATCACGCCTTTTCCGCGCGTGGTGTGCGGAAAAATGGATCCAGAGTGAGGTTCTCA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
V R G H K N R R Q A V Q G C R W R K T E S R T D T G * H * R * N H F1
M Y A V I K T G G K Q Y K V A V G E K L K V E Q I P A D I D A E I T F2
C T R S * K P A A S S T R L P L A K N * K * N R Y R L T L T L K S F3
101 ATGTACGCGGTCATAAAAACCGGCGGCAAGCAGTACAAGGTTGCCGTTGGCGAAAAACTGAAAGTAGAACAGATACCGGCTGACATTGACGCTGAAATCA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A R P G S R S G R R R I D * V R Y A A G Q W G F R Q G H R R V A R F1
L D Q V L A V G E G E S I K F G T P L V S G A S V K A T V V S H G F2
R S T R F S Q W A K A N R L S S V R R W S V G L P S R P P S C R T V F3
201 CGCTCGACCAGGTTCTCGCAGTGGGCGAAGGCGAATCGATTAAGTTCGGTACGCCGCTGGTCAGTGGGGCTTCCGTCAAGGCCACCGTCGTGTCGCACGG 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S S R Q G H H L Q D A S P E A L P K A R R P P P E L H * A A H R R D F1
R H A K V T I F K M R R R K H Y Q K H G G H R Q N Y T E L R I D A F2
V T P R S P S S R C V A G S T T K S T A A T A R T T L S C A S T R F3
301 TCGTCACGCCAAGGTCACCATCTTCAAGATGCGTCGCCGGAAGCACTACCAAAAGCACGGCGGCCACCGCCAGAACTACACTGAGCTGCGCATCGACGCG 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Q R V S A S V K E Q S D G T Q K G R R L V P * R P R L R V E T S R F1
I N A * A P R * R S N Q M A H K K A G G S S R N G R D S E S K R L G F2
S T R K R L G K G A I R W H T K R Q A A R P V T A A T P S R N V S F3
401 ATCAACGCGTAAGCGCCTCGGTAAAGGAGCAATCAGATGGCACACAAAAAGGCAGGCGGCTCGTCCCGTAACGGCCGCGACTCCGAGTCGAAACGTCTCG 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R E S V F1
V K V X F2
A * K C F3
501 GCGTGAAAGTGT 512
----:----|--