BACT000049 (rplT) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3636
- contig length
- 384200
- start
- 330876
- end
- 331235
- length
- 360
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCTGCGCGGC GCCACGGCAG TTCATGATTC CGATCTGAAC TCCGTCCGCG CGATGCTCCC GTTCGCGTAA CCCCTCAACC GATACTCTAA GGAGAGAAAC ATGCCTCGAG TCAAACGTGG GGTAACCGCA CGGGCCCGTC ACAAGAAGAT CATCAACCTG GCCAAGGGTT ATCGCGGCCG CCGCAATAAC GTCTACCGCA TCGCCAAGCA GGCGGTGATG CGCGCTGGTC AGTACGCGTA CCGCGATCGC CGCAACAAGA AGCGTGTGTT CCGCGCACTG TGGATCACGC GTATCAACGC GGCAGTTCGC CAGCACGACA TGACCTACAG CGTGTTCATC AACGGCCTGA AGAAGGCGTC GATCGAACTC GACCGTAAGG TGCTGGCCGA CATGGCGGTG TTCGACAAGG CTGCTTTTGC TGCGATCGTC AAGCAGGTGA AAGCCGCCGT TGCAGCCTAA TTGCAAAATT AGCACTGCGT GGTGAGTTGC AGCGATGTTC CGGTAGTCTC GGCCGCTGCA GCGAAAACGG GGGCTCTTCC GAGCCCCTTT TTTTATCGGC
Translation
P A R R H G S S * F R S E L R P R D A P V R V T P Q P I L * G E K H F1
L R G A T A V H D S D L N S V R A M L P F A * P L N R Y S K E R N F2
C A A P R Q F M I P I * T P S A R C S R S R N P S T D T L R R E T F3
1 CCTGCGCGGCGCCACGGCAGTTCATGATTCCGATCTGAACTCCGTCCGCGCGATGCTCCCGTTCGCGTAACCCCTCAACCGATACTCTAAGGAGAGAAAC 100
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A S S Q T W G N R T G P S Q E D H Q P G Q G L S R P P Q * R L P H F1
M P R V K R G V T A R A R H K K I I N L A K G Y R G R R N N V Y R I F2
C L E S N V G * P H G P V T R R S S T W P R V I A A A A I T S T A F3
101 ATGCCTCGAGTCAAACGTGGGGTAACCGCACGGGCCCGTCACAAGAAGATCATCAACCTGGCCAAGGGTTATCGCGGCCGCCGCAATAACGTCTACCGCA 200
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R Q A G G D A R W S V R V P R S P Q Q E A C V P R T V D H A Y Q R F1
A K Q A V M R A G Q Y A Y R D R R N K K R V F R A L W I T R I N A F2
S P S R R * C A L V S T R T A I A A T R S V C S A H C G S R V S T R F3
201 TCGCCAAGCAGGCGGTGATGCGCGCTGGTCAGTACGCGTACCGCGATCGCCGCAACAAGAAGCGTGTGTTCCGCGCACTGTGGATCACGCGTATCAACGC 300
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G S S P A R H D L Q R V H Q R P E E G V D R T R P * G A G R H G G V F1
A V R Q H D M T Y S V F I N G L K K A S I E L D R K V L A D M A V F2
Q F A S T T * P T A C S S T A * R R R R S N S T V R C W P T W R C F3
301 GGCAGTTCGCCAGCACGACATGACCTACAGCGTGTTCATCAACGGCCTGAAGAAGGCGTCGATCGAACTCGACCGTAAGGTGCTGGCCGACATGGCGGTG 400
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R Q G C F C C D R Q A G E S R R C S L I A K L A L R G E L Q R C S F1
F D K A A F A A I V K Q V K A A V A A * L Q N * H C V V S C S D V P F2
S T R L L L L R S S S R * K P P L Q P N C K I S T A W * V A A M F F3
401 TTCGACAAGGCTGCTTTTGCTGCGATCGTCAAGCAGGTGAAAGCCGCCGTTGCAGCCTAATTGCAAAATTAGCACTGCGTGGTGAGTTGCAGCGATGTTC 500
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G S L G R C S E N G G S S E P L F L S A F1
V V S A A A A K T G A L P S P F F Y R X F2
R * S R P L Q R K R G L F R A P F F I G F3
501 CGGTAGTCTCGGCCGCTGCAGCGAAAACGGGGGCTCTTCCGAGCCCCTTTTTTTATCGGC 560
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