BACT000047 (rplR) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 8482
- end
- 8847
- length
- 366
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGGCTACCGT CCGCCTGAGC CCTACAAGGG CAAGGGCGTG CGCTATGCCG ACGAGGTTGT GATCCTCAAA GAAACGAAGA AGAAGTAAGG GTGCGCAATC ATGGATAAGA CTCAATCTCG CCTGCGCCGC GCTCGCCAGA CGCGTATCAA GATCGCTGAG CTGCAGGTCG CGCGTCTCGC CGTGCATCGC ACGAACACGC ACATCTACGC TCAGGTGTTC TCGCCGTGCG GCACCAAGGT GCTCGCTAGC GCGTCGACGC TGGAAGCTGA AGTGCGCGCC GAGCTCGCAG ACAAGTCGGG CAAGGGTGGC AACGTCGCCG CCGCGACGCT GATCGGCAAG CGTATTGCCG AGAAGGCCAA GGCCGCCGGC ATCGAATCCG TCGCCTTCGA CCGCTCGGGC TTCCGCTACC ACGGCCGCGT GAAGGCGCTG GCTGAGGCAG CTCGTGAAGC TGGGCTCAAG TTCTAAGGAA GGAATTCGTC ATGGCAAAGA TGCAAGCGAA AGTTCAGGCT GACGAGCGCG ACGACGGCCT TCGCGAAAAG ATGATTTCGG TCAACCGCGT GACCAA
Translation
R L P S A * A L Q G Q G R A L C R R G C D P Q R N E E E V R V R N H F1
G Y R P P E P Y K G K G V R Y A D E V V I L K E T K K K * G C A I F2
A T V R L S P T R A R A C A M P T R L * S S K K R R R S K G A Q S F3
1 CGGCTACCGTCCGCCTGAGCCCTACAAGGGCAAGGGCGTGCGCTATGCCGACGAGGTTGTGATCCTCAAAGAAACGAAGAAGAAGTAAGGGTGCGCAATC 100
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G * D S I S P A P R S P D A Y Q D R * A A G R A S R R A S H E H A F1
M D K T Q S R L R R A R Q T R I K I A E L Q V A R L A V H R T N T H F2
W I R L N L A C A A L A R R V S R S L S C R S R V S P C I A R T R F3
101 ATGGATAAGACTCAATCTCGCCTGCGCCGCGCTCGCCAGACGCGTATCAAGATCGCTGAGCTGCAGGTCGCGCGTCTCGCCGTGCATCGCACGAACACGC 200
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H L R S G V L A V R H Q G A R * R V D A G S * S A R R A R R Q V G F1
I Y A Q V F S P C G T K V L A S A S T L E A E V R A E L A D K S G F2
T S T L R C S R R A A P R C S L A R R R W K L K C A P S S Q T S R A F3
201 ACATCTACGCTCAGGTGTTCTCGCCGTGCGGCACCAAGGTGCTCGCTAGCGCGTCGACGCTGGAAGCTGAAGTGCGCGCCGAGCTCGCAGACAAGTCGGG 300
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Q G W Q R R R R D A D R Q A Y C R E G Q G R R H R I R R L R P L G L F1
K G G N V A A A T L I G K R I A E K A K A A G I E S V A F D R S G F2
R V A T S P P R R * S A S V L P R R P R P P A S N P S P S T A R A F3
301 CAAGGGTGGCAACGTCGCCGCCGCGACGCTGATCGGCAAGCGTATTGCCGAGAAGGCCAAGGCCGCCGGCATCGAATCCGTCGCCTTCGACCGCTCGGGC 400
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P L P R P R E G A G * G S S * S W A Q V L R K E F V M A K M Q A K F1
F R Y H G R V K A L A E A A R E A G L K F * G R N S S W Q R C K R K F2
S A T T A A * R R W L R Q L V K L G S S S K E G I R H G K D A S E F3
401 TTCCGCTACCACGGCCGCGTGAAGGCGCTGGCTGAGGCAGCTCGTGAAGCTGGGCTCAAGTTCTAAGGAAGGAATTCGTCATGGCAAAGATGCAAGCGAA 500
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V Q A D E R D D G L R E K M I S V N R V T X F1
F R L T S A T T A F A K R * F R S T A * P X F2
S S G * R A R R R P S R K D D F G Q P R D Q F3
501 AGTTCAGGCTGACGAGCGCGACGACGGCCTTCGCGAAAAGATGATTTCGGTCAACCGCGTGACCAA 566
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