BACT000046 (rplQ) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 14650
- end
- 15045
- length
- 396
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CTTTAAAATC CGCATCTTGC TTTTTTTCGT TACCGGCCCG TGCGCCCGTT CGGGGTGCGA TAGAAGAGCT GGATCAAAAC TTTGAATCAA GGAAACTGAA ATGCGCCATC GTCATGGTCT GCGGAAACTG AACCGCACGA GCAGCCACCG TCTGGCTATG CTCCGCAACA TGTCCAACTC GCTGATCGAG CACGAAGTCA TCAAGACGAC GCTGCCGAAG GCGAAGGAAC TCCGTAAAGT CGTCGAGCCG CTGATCACGC TCGGCAAGAA GCCGTCGCTC GCGAACCGTC GCCTGGCGTT CAATCGCCTG CGCGATCGCG ATTCAGTCGC GAAGCTGTTC GACGTGCTCG GTCCGCGTTT CGCGAATCGT CCGGGCGGCT ACCTGCGTAT CCTGAAGTTC GGCTTCCGCG TCGGCGACAA CGCACCGATG GCACTGGTCG AACTGCTGGA TCGTCCGGAA GTCGACGAAA CGGAAAACGT GCAAGAAGCG GAATAAGCTT CGGTACGAAG CAGTAACCGA AAGGGCTGAG CGATTGCTTG GCCCTTTTTG TTTTTCGGGC GCCGGCTGCG ATCGATTGTC GCAGTGTGCT GCCGGC
Translation
L * N P H L A F F R Y R P V R P F G V R * K S W I K T L N Q G N * N F1
F K I R I L L F F V T G P C A R S G C D R R A G S K L * I K E T E F2
L K S A S C F F S L P A R A P V R G A I E E L D Q N F E S R K L K F3
1 CTTTAAAATCCGCATCTTGCTTTTTTTCGTTACCGGCCCGTGCGCCCGTTCGGGGTGCGATAGAAGAGCTGGATCAAAACTTTGAATCAAGGAAACTGAA 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
A P S S W S A E T E P H E Q P P S G Y A P Q H V Q L A D R A R S H F1
M R H R H G L R K L N R T S S H R L A M L R N M S N S L I E H E V I F2
C A I V M V C G N * T A R A A T V W L C S A T C P T R * S S T K S F3
101 ATGCGCCATCGTCATGGTCTGCGGAAACTGAACCGCACGAGCAGCCACCGTCTGGCTATGCTCCGCAACATGTCCAACTCGCTGATCGAGCACGAAGTCA 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Q D D A A E G E G T P * S R R A A D H A R Q E A V A R E P S P G V F1
K T T L P K A K E L R K V V E P L I T L G K K P S L A N R R L A F F2
S R R R C R R R R N S V K S S S R * S R S A R S R R S R T V A W R S F3
201 TCAAGACGACGCTGCCGAAGGCGAAGGAACTCCGTAAAGTCGTCGAGCCGCTGATCACGCTCGGCAAGAAGCCGTCGCTCGCGAACCGTCGCCTGGCGTT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
Q S P A R S R F S R E A V R R A R S A F R E S S G R L P A Y P E V R F1
N R L R D R D S V A K L F D V L G P R F A N R P G G Y L R I L K F F2
I A C A I A I Q S R S C S T C S V R V S R I V R A A T C V S * S S F3
301 CAATCGCCTGCGCGATCGCGATTCAGTCGCGAAGCTGTTCGACGTGCTCGGTCCGCGTTTCGCGAATCGTCCGGGCGGCTACCTGCGTATCCTGAAGTTC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
L P R R R Q R T D G T G R T A G S S G S R R N G K R A R S G I S F F1
G F R V G D N A P M A L V E L L D R P E V D E T E N V Q E A E * A S F2
A S A S A T T H R W H W S N C W I V R K S T K R K T C K K R N K L F3
401 GGCTTCCGCGTCGGCGACAACGCACCGATGGCACTGGTCGAACTGCTGGATCGTCCGGAAGTCGACGAAACGGAAAACGTGCAAGAAGCGGAATAAGCTT 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G T K Q * P K G L S D C L A L F V F R A P A A I D C R S V L P A F1
V R S S N R K G * A I A W P F L F F G R R L R S I V A V C C R X F2
R Y E A V T E R A E R L L G P F C F S G A G C D R L S Q C A A G F3
501 CGGTACGAAGCAGTAACCGAAAGGGCTGAGCGATTGCTTGGCCCTTTTTGTTTTTCGGGCGCCGGCTGCGATCGATTGTCGCAGTGTGCTGCCGGC 596
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:-