BACT000044 (rplO) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
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- 215670
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- 9605
- end
- 10039
- length
- 435
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCGAGCTTCA GGACACGCCG GCGGTCCGCG GCATGATCAA CAAGGTCTCG TACCTCGTTA AGGTCATCGC GTAAGCGGCC CTACGGATCA AGGAGTTGAT ATGGAATTGA ATAACCTGAA GCCGGCCGCT GGCGCCAAGC ACGCCAAGCG TCGCGTCGGC CGCGGCATCG GTTCGGGCCT CGGCAAGACG GCTGGCCGTG GTCACAAGGG TCAGAAATCG CGTTCGGGCG GCTTCCACAA GGTCGGCTTC GAAGGCGGTC AGATGCCGCT GCAACGTCGT CTGCCGAAGC GCGGCTTCAC GTCGCTGACG AAGGAATTCG TCGGCGAAGT GCGCCTGGGC GACCTCGAGA AGCTGCCGGT CGATGAAATC GATCTGCTCG CACTGAAGCA AGCCGGCCTG GTCGGCGAGC TGACGAAGAG CGCGAAGATC ATCGCCACGG GCGAACTGAA GCGCAAGATC GTCGTGAAGG GTCTCGGCGC CACGAAGAGT GCGCGCGCTG CGATCGAAGC GGCTGGCGGT TCGTTCGCCG AGTGACACGC GTAGCGCGTC GTCACTTGCA TTCATCGGAG AAGGTACTTG GCTAACAGCC CGAGTCTTGC AAAACCCGGT CGAAGCACGG CGAAATTCGG CGATC
Translation
A S F R T R R R S A A * S T R S R T S L R S S R K R P Y G S R S * Y F1
R A S G H A G G P R H D Q Q G L V P R * G H R V S G P T D Q G V D F2
E L Q D T P A V R G M I N K V S Y L V K V I A * A A L R I K E L I F3
1 GCGAGCTTCAGGACACGCCGGCGGTCCGCGGCATGATCAACAAGGTCTCGTACCTCGTTAAGGTCATCGCGTAAGCGGCCCTACGGATCAAGGAGTTGAT 100
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G I E * P E A G R W R Q A R Q A S R R P R H R F G P R Q D G W P W F1
M E L N N L K P A A G A K H A K R R V G R G I G S G L G K T A G R G F2
W N * I T * S R P L A P S T P S V A S A A A S V R A S A R R L A V F3
101 ATGGAATTGAATAACCTGAAGCCGGCCGCTGGCGCCAAGCACGCCAAGCGTCGCGTCGGCCGCGGCATCGGTTCGGGCCTCGGCAAGACGGCTGGCCGTG 200
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S Q G S E I A F G R L P Q G R L R R R S D A A A T S S A E A R L H F1
H K G Q K S R S G G F H K V G F E G G Q M P L Q R R L P K R G F T F2
V T R V R N R V R A A S T R S A S K A V R C R C N V V C R S A A S R F3
201 GTCACAAGGGTCAGAAATCGCGTTCGGGCGGCTTCCACAAGGTCGGCTTCGAAGGCGGTCAGATGCCGCTGCAACGTCGTCTGCCGAAGCGCGGCTTCAC 300
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V A D E G I R R R S A P G R P R E A A G R * N R S A R T E A S R P G F1
S L T K E F V G E V R L G D L E K L P V D E I D L L A L K Q A G L F2
R * R R N S S A K C A W A T S R S C R S M K S I C S H * S K P A W F3
301 GTCGCTGACGAAGGAATTCGTCGGCGAAGTGCGCCTGGGCGACCTCGAGAAGCTGCCGGTCGATGAAATCGATCTGCTCGCACTGAAGCAAGCCGGCCTG 400
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R R A D E E R E D H R H G R T E A Q D R R E G S R R H E E C A R C F1
V G E L T K S A K I I A T G E L K R K I V V K G L G A T K S A R A A F2
S A S * R R A R R S S P R A N * S A R S S * R V S A P R R V R A L F3
401 GTCGGCGAGCTGACGAAGAGCGCGAAGATCATCGCCACGGGCGAACTGAAGCGCAAGATCGTCGTGAAGGGTCTCGGCGCCACGAAGAGTGCGCGCGCTG 500
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D R S G W R F V R R V T R V A R R H L H S S E K V L G * Q P E S C F1
I E A A G G S F A E * H A * R V V T C I H R R R Y L A N S P S L A F2
R S K R L A V R S P S D T R S A S S L A F I G E G T W L T A R V L Q F3
501 CGATCGAAGCGGCTGGCGGTTCGTTCGCCGAGTGACACGCGTAGCGCGTCGTCACTTGCATTCATCGGAGAAGGTACTTGGCTAACAGCCCGAGTCTTGC 600
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K T R S K H G E I R R S F1
K P G R S T A K F G D X F2
N P V E A R R N S A I F3
601 AAAACCCGGTCGAAGCACGGCGAAATTCGGCGATC 635
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