BACT000043 (rplN) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 5955
- end
- 6323
- length
- 369
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TCGCTGCTGT TCCAACCCAA GCAGCCGATC GGCTGACGGG ACCAAGACTG ACCGTATGCA TCATGGTGGT GCATCCGGAT TAAGTTGGGA AAGACAAACC ATGATCCAGA CCGAATCTCG GCTTGAAGTA GCCGACAACA CGGGTGCGCG TGAAGTCATG TGCATCAAGG TGCTCGGCGG CTCGAAGCGT CGTTATGCCA GCATTGGCGA CATCATCAAG GTGAGCGTCA AAGAGGCAAC GCCGCGCGGG CGTGTGAAGA AAGGCGAAAT CTACAACGCC GTGGTGGTCC GCACCGCCAA GGGCGTGCGC CGTCAAGACG GCTCGCTGAT CAAGTTCGAC GGCAACGCCG CTGTGCTTTT GAATAACAAG CTCGAGCCGA TCGGCACCCG CATTTTCGGG CCGGTGACGC GTGAGCTGCG TAGCGAACGA TTCATGAAGA TCGTCTCGCT GGCGCCGGAA GTGCTGTAAG GAGTCGCGAT GAACAAGATT CGCAAGGGTG ACGAAGTCAT CGTCATCGCA GGCAAGGACA AGGGCAAGCG CGGTGTCGTG CTGGCAGTCG CCGCCGACC
Translation
S L L F Q P K Q P I G * R D Q D * P Y A S W W C I R I K L G K T N H F1
R C C S N P S S R S A D G T K T D R M H H G G A S G L S W E R Q T F2
A A V P T Q A A D R L T G P R L T V C I M V V H P D * V G K D K P F3
1 TCGCTGCTGTTCCAACCCAAGCAGCCGATCGGCTGACGGGACCAAGACTGACCGTATGCATCATGGTGGTGCATCCGGATTAAGTTGGGAAAGACAAACC 100
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D P D R I S A * S S R Q H G C A * S H V H Q G A R R L E A S L C Q F1
M I Q T E S R L E V A D N T G A R E V M C I K V L G G S K R R Y A S F2
* S R P N L G L K * P T T R V R V K S C A S R C S A A R S V V M P F3
101 ATGATCCAGACCGAATCTCGGCTTGAAGTAGCCGACAACACGGGTGCGCGTGAAGTCATGTGCATCAAGGTGCTCGGCGGCTCGAAGCGTCGTTATGCCA 200
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H W R H H Q G E R Q R G N A A R A C E E R R N L Q R R G G P H R Q F1
I G D I I K V S V K E A T P R G R V K K G E I Y N A V V V R T A K F2
A L A T S S R * A S K R Q R R A G V * R K A K S T T P W W S A P P R F3
201 GCATTGGCGACATCATCAAGGTGAGCGTCAAAGAGGCAACGCCGCGCGGGCGTGTGAAGAAAGGCGAAATCTACAACGCCGTGGTGGTCCGCACCGCCAA 300
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G R A P S R R L A D Q V R R Q R R C A F E * Q A R A D R H P H F R A F1
G V R R Q D G S L I K F D G N A A V L L N N K L E P I G T R I F G F2
A C A V K T A R * S S S T A T P L C F * I T S S S R S A P A F S G F3
301 GGGCGTGCGCCGTCAAGACGGCTCGCTGATCAAGTTCGACGGCAACGCCGCTGTGCTTTTGAATAACAAGCTCGAGCCGATCGGCACCCGCATTTTCGGG 400
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G D A * A A * R T I H E D R L A G A G S A V R S R D E Q D S Q G * F1
P V T R E L R S E R F M K I V S L A P E V L * G V A M N K I R K G D F2
R * R V S C V A N D S * R S S R W R R K C C K E S R * T R F A R V F3
401 CCGGTGACGCGTGAGCTGCGTAGCGAACGATTCATGAAGATCGTCTCGCTGGCGCCGGAAGTGCTGTAAGGAGTCGCGATGAACAAGATTCGCAAGGGTG 500
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R S H R H R R Q G Q G Q A R C R A G S R R R P F1
E V I V I A G K D K G K R G V V L A V A A D X F2
T K S S S S Q A R T R A S A V S C W Q S P P T F3
501 ACGAAGTCATCGTCATCGCAGGCAAGGACAAGGGCAAGCGCGGTGTCGTGCTGGCAGTCGCCGCCGACC 569
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