BACT000039 (rplJ) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3629
- contig length
- 18216
- start
- 2825
- end
- 3322
- length
- 498
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GGTGGAAATA CTCCTAACGA GGTCGGACGC CGTTGTTGAA CGAGGTACGT GAGGTCGAGC CATACCGGCT AGCCGAGCGT ATCGTTTCTG GAGGCTAACC GTGCCGCTTA ATAGAGAAGA CAAGCAAGCC GTCGTTGCTG AGGTCGCCGC ACAAGTTGCG AAGGCCCAGA CCGTTGTGCT GGCTGAGTAT CGTGGAATTG CGGTTGGCGA TCTGACCACG CTGCGCGCGA AAGCGCGCGA GCAGAAGGTT TACCTGCGCG TTCTGAAGAA CACGCTGGCG CGTCGCGCTG TTGAAGGTAC GCCCTTTGCT CCGCTGGCAG AGCAGATGAC TGGTCCGCTG ATCTACGGCA TCTCGGAAGA TGCAATTGCC GCTGCTAAGG TCGTCAACGA CTTCAGCAAG AGCAATGACA AGTTGGTCAT CAAGGCTGGT TCGTTCGATG GCAAGGTGAT GGATAAGGCT GGCGTGCAAG CGCTGGCAAG CATCCCGAGC CGTGAAGAAC TGCTCTCGAA GCTGCTGTTC GTCATGCAAG CGCCTGTTTC GGGCTTCGCG CGTGCTCTCG CCGCGCTGGC CGAGAAGAAG CAAGCAGAAG CTGCGTAATC GAACACGCAT CAGCGTCACT GATCGCTGGC TGTATCCGAA TTCAATTTAG GAGTATTTCA AATGGCAATC GCAAAAGAAG ACATCCTGGC AGCAGTCG
Translation
G G N T P N E V G R R C * T R Y V R S S H T G * P S V S F L E A N R F1
V E I L L T R S D A V V E R G T * G R A I P A S R A Y R F W R L T F2
W K Y S * R G R T P L L N E V R E V E P Y R L A E R I V S G G * P F3
1 GGTGGAAATACTCCTAACGAGGTCGGACGCCGTTGTTGAACGAGGTACGTGAGGTCGAGCCATACCGGCTAGCCGAGCGTATCGTTTCTGGAGGCTAACC 100
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A A * * R R Q A S R R C * G R R T S C E G P D R C A G * V S W N C F1
V P L N R E D K Q A V V A E V A A Q V A K A Q T V V L A E Y R G I A F2
C R L I E K T S K P S L L R S P H K L R R P R P L C W L S I V E L F3
101 GTGCCGCTTAATAGAGAAGACAAGCAAGCCGTCGTTGCTGAGGTCGCCGCACAAGTTGCGAAGGCCCAGACCGTTGTGCTGGCTGAGTATCGTGGAATTG 200
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G W R S D H A A R E S A R A E G L P A R S E E H A G A S R C * R Y F1
V G D L T T L R A K A R E Q K V Y L R V L K N T L A R R A V E G T F2
R L A I * P R C A R K R A S R R F T C A F * R T R W R V A L L K V R F3
201 CGGTTGGCGATCTGACCACGCTGCGCGCGAAAGCGCGCGAGCAGAAGGTTTACCTGCGCGTTCTGAAGAACACGCTGGCGCGTCGCGCTGTTGAAGGTAC 300
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A L C S A G R A D D W S A D L R H L G R C N C R C * G R Q R L Q Q E F1
P F A P L A E Q M T G P L I Y G I S E D A I A A A K V V N D F S K F2
P L L R W Q S R * L V R * S T A S R K M Q L P L L R S S T T S A R F3
301 GCCCTTTGCTCCGCTGGCAGAGCAGATGACTGGTCCGCTGATCTACGGCATCTCGGAAGATGCAATTGCCGCTGCTAAGGTCGTCAACGACTTCAGCAAG 400
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Q * Q V G H Q G W F V R W Q G D G * G W R A S A G K H P E P * R T F1
S N D K L V I K A G S F D G K V M D K A G V Q A L A S I P S R E E L F2
A M T S W S S R L V R S M A R * W I R L A C K R W Q A S R A V K N F3
401 AGCAATGACAAGTTGGTCATCAAGGCTGGTTCGTTCGATGGCAAGGTGATGGATAAGGCTGGCGTGCAAGCGCTGGCAAGCATCCCGAGCCGTGAAGAAC 500
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A L E A A V R H A S A C F G L R A C S R R A G R E E A S R S C V I F1
L S K L L F V M Q A P V S G F A R A L A A L A E K K Q A E A A * S F2
C S R S C C S S C K R L F R A S R V L S P R W P R R S K Q K L R N R F3
501 TGCTCTCGAAGCTGCTGTTCGTCATGCAAGCGCCTGTTTCGGGCTTCGCGCGTGCTCTCGCCGCGCTGGCCGAGAAGAAGCAAGCAGAAGCTGCGTAATC 600
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E H A S A S L I A G C I R I Q F R S I S N G N R K R R H P G S S R F1
N T H Q R H * S L A V S E F N L G V F Q M A I A K E D I L A A V X F2
T R I S V T D R W L Y P N S I * E Y F K W Q S Q K K T S W Q Q S F3
601 GAACACGCATCAGCGTCACTGATCGCTGGCTGTATCCGAATTCAATTTAGGAGTATTTCAAATGGCAATCGCAAAAGAAGACATCCTGGCAGCAGTCG 698
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