BACT000038 (rplI) allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3670
contig length
229761
start
89544
end
89996
length
453
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCAGCTGGAC ACGGCAATCA AGCGCGCACG CTTCCTCGCG CTGCTGCCGT ACACCGATCA GCACAAGGCG TAATCAGGCG ACGCAATAAG GAGAATTCGA ATGCAAATCA TTCTGTTGGA AAAAGTCGCC AATCTGGGCA ACCTCGGCGA TATCGTCAAG GTCAAGGACG GTTACGCTCG CAACTTCCTG ATCCCGAACC GCAAGGCTCG CCGTGCGACG AAGGAAGCGA TCGCCGAATT CGAAGTGCGC CGTGCAGAGC TCGAGAAGAT CGCCGCTGAA AAGCTGGCGG CTTCGCAGGC TGTCGGCGAG AAGCTGAACG GCCAGTCGTT CGAAATCACG CAGAAGTCGG GCGTGGACGG CCGTCTGTTC GGCTCGGTCA CGAACGCGGA CGTCGCGGAA CTGCTGAAGA AGGCCGGCTT CGATGTCGAG AAGTCGCAGG TTCGCATGCC GGAAGGCCCG CTGAAGATGA TCGGCGAGCA CGGCGTTCAG GTCGCGCTGC ATACGGACGT CGTCGTCGAC GTCACGATCA ACGTGATCGG CGACCACGCG TAAGCGTACG CAACACTTGC CGGGCGGCAC ACGCCGCCCG GACAGGGGCA GGCGCCCGGG CAACCGGGGC CTGCCTTTTT TGTTGGCCGA TCGCCGGCGA CGA

Translation


          S  A  G  H  G  N  Q  A  R  T  L  P  R  A  A  A  V  H  R  S  A  Q  G  V  I  R  R  R  N  K  E  N  S  N   F1
           Q  L  D  T  A  I  K  R  A  R  F  L  A  L  L  P  Y  T  D  Q  H  K  A  *  S  G  D  A  I  R  R  I  R     F2
            S  W  T  R  Q  S  S  A  H  A  S  S  R  C  C  R  T  P  I  S  T  R  R  N  Q  A  T  Q  *  G  E  F  E    F3
        1 TCAGCTGGACACGGCAATCAAGCGCGCACGCTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATTCGA 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  N  H  S  V  G  K  S  R  Q  S  G  Q  P  R  R  Y  R  Q  G  Q  G  R  L  R  S  Q  L  P  D  P  E  P    F1
          M  Q  I  I  L  L  E  K  V  A  N  L  G  N  L  G  D  I  V  K  V  K  D  G  Y  A  R  N  F  L  I  P  N  R   F2
           C  K  S  F  C  W  K  K  S  P  I  W  A  T  S  A  I  S  S  R  S  R  T  V  T  L  A  T  S  *  S  R  T     F3
      101 ATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTTACGCTCGCAACTTCCTGATCCCGAACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Q  G  S  P  C  D  E  G  S  D  R  R  I  R  S  A  P  C  R  A  R  E  D  R  R  *  K  A  G  G  F  A  G     F1
            K  A  R  R  A  T  K  E  A  I  A  E  F  E  V  R  R  A  E  L  E  K  I  A  A  E  K  L  A  A  S  Q  A    F2
          A  R  L  A  V  R  R  R  K  R  S  P  N  S  K  C  A  V  Q  S  S  R  R  S  P  L  K  S  W  R  L  R  R  L   F3
      201 GCAAGGCTCGCCGTGCGACGAAGGAAGCGATCGCCGAATTCGAAGTGCGCCGTGCAGAGCTCGAGAAGATCGCCGCTGAAAAGCTGGCGGCTTCGCAGGC 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          C  R  R  E  A  E  R  P  V  V  R  N  H  A  E  V  G  R  G  R  P  S  V  R  L  G  H  E  R  G  R  R  G  T   F1
           V  G  E  K  L  N  G  Q  S  F  E  I  T  Q  K  S  G  V  D  G  R  L  F  G  S  V  T  N  A  D  V  A  E     F2
            S  A  R  S  *  T  A  S  R  S  K  S  R  R  S  R  A  W  T  A  V  C  S  A  R  S  R  T  R  T  S  R  N    F3
      301 TGTCGGCGAGAAGCTGAACGGCCAGTCGTTCGAAATCACGCAGAAGTCGGGCGTGGACGGCCGTCTGTTCGGCTCGGTCACGAACGCGGACGTCGCGGAA 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            A  E  E  G  R  L  R  C  R  E  V  A  G  S  H  A  G  R  P  A  E  D  D  R  R  A  R  R  S  G  R  A  A    F1
          L  L  K  K  A  G  F  D  V  E  K  S  Q  V  R  M  P  E  G  P  L  K  M  I  G  E  H  G  V  Q  V  A  L  H   F2
           C  *  R  R  P  A  S  M  S  R  S  R  R  F  A  C  R  K  A  R  *  R  *  S  A  S  T  A  F  R  S  R  C     F3
      401 CTGCTGAAGAAGGCCGGCTTCGATGTCGAGAAGTCGCAGGTTCGCATGCCGGAAGGCCCGCTGAAGATGATCGGCGAGCACGGCGTTCAGGTCGCGCTGC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           Y  G  R  R  R  R  R  H  D  Q  R  D  R  R  P  R  V  S  V  R  N  T  C  R  A  A  H  A  A  R  T  G  A     F1
            T  D  V  V  V  D  V  T  I  N  V  I  G  D  H  A  *  A  Y  A  T  L  A  G  R  H  T  P  P  G  Q  G  Q    F2
          I  R  T  S  S  S  T  S  R  S  T  *  S  A  T  T  R  K  R  T  Q  H  L  P  G  G  T  R  R  P  D  R  G  R   F3
      501 ATACGGACGTCGTCGTCGACGTCACGATCAACGTGATCGGCGACCACGCGTAAGCGTACGCAACACTTGCCGGGCGGCACACGCCGCCCGGACAGGGGCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          G  A  R  A  T  G  A  C  L  F  C  W  P  I  A  G  D  X                                                   F1
           A  P  G  Q  P  G  P  A  F  F  V  G  R  S  P  A  T  X                                                  F2
            R  P  G  N  R  G  L  P  F  L  L  A  D  R  R  R  R                                                    F3
      601 GGCGCCCGGGCAACCGGGGCCTGCCTTTTTTGTTGGCCGATCGCCGGCGACGA 653
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