BACT000032 (rplC) allele sequence: id-331

Contig position

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1549
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forward
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yes
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Illumina
Options

Sequence

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Translation


          C  *  A  F  R  A  F  A  *  K  S  R  V  L  R  T  R  H  F  V  N  Q  P  R  P  I  A  V  G  N  G  E  N  D   F1
           A  R  L  F  A  H  S  R  K  K  V  G  S  C  V  P  G  I  L  *  I  S  P  D  Q  S  Q  S  G  M  E  K  T     F2
            L  G  F  S  R  I  R  V  K  K  S  G  L  A  Y  P  A  F  C  K  S  A  P  T  N  R  S  R  E  W  R  K  R    F3
        1 TGCTAGGCTTTTCGCGCATTCGCGTAAAAAAGTCGGGTCTTGCGTACCCGGCATTTTGTAAATCAGCCCCGACCAATCGCAGTCGGGAATGGAGAAAACG 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            E  P  W  T  R  R  S  Q  G  W  H  D  P  Y  L  H  G  *  R  G  F  D  S  R  H  R  G  G  R  V  G  Q  P    F1
          M  S  L  G  L  V  G  R  K  V  G  M  T  R  I  F  T  A  E  G  D  S  I  P  V  T  V  V  D  V  S  D  N  R   F2
           *  A  L  D  S  *  V  A  R  L  A  *  P  V  S  S  R  L  K  G  I  R  F  P  S  P  W  W  T  C  R  T  T     F3
      101 ATGAGCCTTGGACTCGTAGGTCGCAAGGTTGGCATGACCCGTATCTTCACGGCTGAAGGGGATTCGATTCCCGTCACCGTGGTGGACGTGTCGGACAACC 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           R  D  A  D  Q  D  C  *  N  R  R  L  H  G  R  S  G  C  I  R  L  P  P  R  I  A  R  D  E  A  A  G  R     F1
            V  T  Q  I  K  T  V  E  T  D  G  Y  T  A  V  Q  V  A  F  G  S  R  R  A  S  R  V  T  K  P  L  A  G    F2
          A  *  R  R  S  R  L  L  K  P  T  A  T  R  P  F  R  L  H  S  A  P  A  A  H  R  A  *  R  S  R  W  Q  V   F3
      201 GCGTGACGCAGATCAAGACTGTTGAAACCGACGGCTACACGGCCGTTCAGGTTGCATTCGGCTCCCGCCGCGCATCGCGCGTGACGAAGCCGCTGGCAGG 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          S  S  R  Q  S  R  R  *  S  R  *  N  P  Q  G  I  P  H  R  C  G  Q  G  S  R  A  V  E  W  R  H  R  W  P   F1
           H  L  A  K  A  G  V  E  A  G  E  I  L  K  E  F  R  I  D  A  A  K  A  A  E  L  S  N  G  A  I  V  G     F2
            I  S  P  K  P  A  L  K  P  V  K  S  S  R  N  S  A  S  M  R  P  R  Q  P  S  C  R  M  A  P  S  L  A    F3
      301 TCATCTCGCCAAAGCCGGCGTTGAAGCCGGTGAAATCCTCAAGGAATTCCGCATCGATGCGGCCAAGGCAGCCGAGCTGTCGAATGGCGCCATCGTTGGC 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  S  V  R  S  G  P  E  G  R  R  A  R  R  V  D  R  *  G  L  R  R  Y  H  Q  A  L  Q  L  R  F  G  S    F1
          P  D  L  F  E  V  G  Q  K  V  D  V  Q  G  V  S  I  G  K  G  Y  A  G  T  I  K  R  Y  N  F  G  S  G  R   F2
           R  I  C  S  K  W  A  R  R  S  T  C  K  A  C  R  S  V  R  A  T  P  V  P  S  S  V  T  T  S  V  R  V     F3
      401 CCGGATCTGTTCGAAGTGGGCCAGAAGGTCGACGTGCAAGGCGTGTCGATCGGTAAGGGCTACGCCGGTACCATCAAGCGTTACAACTTCGGTTCGGGTC 500
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           C  F  P  R  *  L  A  L  A  Q  R  A  G  L  D  R  Y  G  A  G  S  G  S  R  V  P  G  *  A  H  D  G  S     F1
            A  S  H  G  N  S  R  S  H  N  V  P  G  S  I  G  M  A  Q  D  P  G  R  V  F  P  G  K  R  M  T  G  H    F2
          V  L  P  T  V  T  R  A  R  T  T  C  R  A  R  S  V  W  R  R  I  R  V  A  C  S  R  V  S  A  *  R  V  T   F3
      501 GTGCTTCCCACGGTAACTCGCGCTCGCACAACGTGCCGGGCTCGATCGGTATGGCGCAGGATCCGGGTCGCGTGTTCCCGGGTAAGCGCATGACGGGTCA 600
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          H  G  *  R  D  G  D  G  A  K  P  R  N  R  S  Y  R  R  R  A  Q  A  A  A  R  Q  G  R  D  S  G  C  E  G   F1
           M  G  D  V  T  V  T  V  Q  N  L  E  I  A  R  I  D  A  E  R  K  L  L  L  V  K  G  A  I  P  G  A  K     F2
            W  V  T  *  R  *  R  C  K  T  S  K  S  L  V  S  T  Q  S  A  S  C  C  S  S  R  A  R  F  R  V  R  R    F3
      601 CATGGGTGACGTGACGGTGACGGTGCAAAACCTCGAAATCGCTCGTATCGACGCAGAGCGCAAGCTGCTGCTCGTCAAGGGCGCGATTCCGGGTGCGAAG 700
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            R  Q  G  F  R  D  A  G  R  E  D  Q  G  G  E  I  M  E  L  K  L  L  N  E  N  G  Q  E  G  A  V  V  N    F1
          G  G  K  V  F  V  T  P  A  V  K  T  K  G  A  K  *  W  N  S  S  S  *  T  K  M  V  R  K  V  Q  W  S  T   F2
           A  A  R  F  S  *  R  R  P  *  R  P  R  G  R  N  N  G  T  Q  A  P  E  R  K  W  S  G  R  C  S  G  Q     F3
      701 GGCGGCAAGGTTTTCGTGACGCCGGCCGTGAAGACCAAGGGGGCGAAATAATGGAACTCAAGCTCCTGAACGAAAATGGTCAGGAAGGTGCAGTGGTCAA 800
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  S  D  V  V  F  G  R  D  Y  N  E  A  L  I  H  X                                                     F1
            H  R  T  S  C  S  V  V  T  T  T  K  R  *  S  T  X                                                    F2
          R  I  G  R  R  V  R  S  *  L  Q  R  S  A  D  P  P                                                      F3
      801 CGCATCGGACGTCGTGTTCGGTCGTGACTACAACGAAGCGCTGATCCACCA 851
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