BACT000031 (rplB) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 2483
- end
- 3310
- length
- 828
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCTTCGGCCG TTCGATGGGC CGCCGCAAGG ACGTGAAGAA GGCATACGTG TGCCTGAAGC CCGGCCAGGA AATCAACTTC GAAGCGGAGG CCAAGTAATC ATGGCAATCG TGAAAGTTAA ACCGACCTCG CCGGGCCGCC GCGCGATGGT CAAGGTGGTC AACAAGGACC TGCACAAGGG CAAGCCGCAC GCGGCACTGC TCGACACGCA GAGCTCCAAG GCTGGCCGCA ACAACAACGG TCGCATCACG ACGCGTCACC AGGGCGGTGG TCACAAGCAC CACTACCGCG TGATCGATTT CCGTCGCACG AAGGACGGCA TTCCGGCGAA GGTCGAGCGT CTCGAGTACG ACCCGAACCG CAGCGCGAAC ATCGCGCTGG TGCTGTACGC CGACGGCGAG CGCCGCTACA TCATCGCGCC GAAGGGCGTG ACGGTTGGCC AGCAGCTCAT GTCGGGTTCG GAAGCGCCGA TCCGTGCAGG CAACACGCTG CCGATCCGCA ACATTCCGGT CGGTACGACG ATCCACTGCA TCGAGATGCT GCCGGGCAAG GGCGCGCAAA TGGCGCGTTC GGCCGGTACG TCGGCCATGC TGCTCGCACG TGAAGGCGTG TACGCGCAGG TCCGTCTGCG TTCGGGCGAA ATCCGCCGCG TGCACATCGA GTGCCGTGCG ACGATCGGTG AAGTCGGCAA CGAAGAGCAC AGCCTGCGCC AGATCGGCAA GGCCGGTGCG AACCGCTGGC GCGGTATCCG CCCGACGGTG CGTGGCGTGG CAATGAACCC GATCGACCAC CCGCACGGTG GTGGTGAAGG CCGTACCGCT GCGGGCCGCG ACCCGGTGAG CCCGTGGGGC ACGCCGACGA AGGGCTTCCG TACGCGTCGC AACAAGCGCA CGACGACGAT GATCGTCCAG CGCCGTCACA AGCGTTAAGG AGTAGGCAAT GGCACGTTCT GTTAAAAAAG GTCCGTTCTG CGACGCCCAT TTGCTGAAGA AAGTTGAGGC GGCTGCAGCT TCGCGCGACA AGAAGCCG
Translation
A S A V R W A A A R T * R R H T C A * S P A R K S T S K R R P S N H F1
L R P F D G P P Q G R E E G I R V P E A R P G N Q L R S G G Q V I F2
F G R S M G R R K D V K K A Y V C L K P G Q E I N F E A E A K * S F3
1 GCTTCGGCCGTTCGATGGGCCGCCGCAAGGACGTGAAGAAGGCATACGTGTGCCTGAAGCCCGGCCAGGAAATCAACTTCGAAGCGGAGGCCAAGTAATC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G N R E S * T D L A G P P R D G Q G G Q Q G P A Q G Q A A R G T A F1
M A I V K V K P T S P G R R A M V K V V N K D L H K G K P H A A L L F2
W Q S * K L N R P R R A A A R W S R W S T R T C T R A S R T R H C F3
101 ATGGCAATCGTGAAAGTTAAACCGACCTCGCCGGGCCGCCGCGCGATGGTCAAGGTGGTCAACAAGGACCTGCACAAGGGCAAGCCGCACGCGGCACTGC 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
R H A E L Q G W P Q Q Q R S H H D A S P G R W S Q A P L P R D R F F1
D T Q S S K A G R N N N G R I T T R H Q G G G H K H H Y R V I D F F2
S T R R A P R L A A T T T V A S R R V T R A V V T S T T T A * S I S F3
201 TCGACACGCAGAGCTCCAAGGCTGGCCGCAACAACAACGGTCGCATCACGACGCGTCACCAGGGCGGTGGTCACAAGCACCACTACCGCGTGATCGATTT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P S H E G R H S G E G R A S R V R P E P Q R E H R A G A V R R R R A F1
R R T K D G I P A K V E R L E Y D P N R S A N I A L V L Y A D G E F2
V A R R T A F R R R S S V S S T T R T A A R T S R W C C T P T A S F3
301 CCGTCGCACGAAGGACGGCATTCCGGCGAAGGTCGAGCGTCTCGAGTACGACCCGAACCGCAGCGCGAACATCGCGCTGGTGCTGTACGCCGACGGCGAG 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P L H H R A E G R D G W P A A H V G F G S A D P C R Q H A A D P Q F1
R R Y I I A P K G V T V G Q Q L M S G S E A P I R A G N T L P I R N F2
A A T S S R R R A * R L A S S S C R V R K R R S V Q A T R C R S A F3
401 CGCCGCTACATCATCGCGCCGAAGGGCGTGACGGTTGGCCAGCAGCTCATGTCGGGTTCGGAAGCGCCGATCCGTGCAGGCAACACGCTGCCGATCCGCA 500
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
H S G R Y D D P L H R D A A G Q G R A N G A F G R Y V G H A A R T F1
I P V G T T I H C I E M L P G K G A Q M A R S A G T S A M L L A R F2
T F R S V R R S T A S R C C R A R A R K W R V R P V R R P C C S H V F3
501 ACATTCCGGTCGGTACGACGATCCACTGCATCGAGATGCTGCCGGGCAAGGGCGCGCAAATGGCGCGTTCGGCCGGTACGTCGGCCATGCTGCTCGCACG 600
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
* R R V R A G P S A F G R N P P R A H R V P C D D R * S R Q R R A Q F1
E G V Y A Q V R L R S G E I R R V H I E C R A T I G E V G N E E H F2
K A C T R R S V C V R A K S A A C T S S A V R R S V K S A T K S T F3
601 TGAAGGCGTGTACGCGCAGGTCCGTCTGCGTTCGGGCGAAATCCGCCGCGTGCACATCGAGTGCCGTGCGACGATCGGTGAAGTCGGCAACGAAGAGCAC 700
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
P A P D R Q G R C E P L A R Y P P D G A W R G N E P D R P P A R W F1
S L R Q I G K A G A N R W R G I R P T V R G V A M N P I D H P H G G F2
A C A R S A R P V R T A G A V S A R R C V A W Q * T R S T T R T V F3
701 AGCCTGCGCCAGATCGGCAAGGCCGGTGCGAACCGCTGGCGCGGTATCCGCCCGACGGTGCGTGGCGTGGCAATGAACCCGATCGACCACCCGCACGGTG 800
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
W * R P Y R C G P R P G E P V G H A D E G L P Y A S Q Q A H D D D F1
G E G R T A A G R D P V S P W G T P T K G F R T R R N K R T T T M F2
V V K A V P L R A A T R * A R G A R R R R A S V R V A T S A R R R * F3
801 GTGGTGAAGGCCGTACCGCTGCGGGCCGCGACCCGGTGAGCCCGTGGGGCACGCCGACGAAGGGCTTCCGTACGCGTCGCAACAAGCGCACGACGACGAT 900
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
D R P A P S Q A L R S R Q W H V L L K K V R S A T P I C * R K L R R F1
I V Q R R H K R * G V G N G T F C * K R S V L R R P F A E E S * G F2
S S S A V T S V K E * A M A R S V K K G P F C D A H L L K K V E A F3
901 GATCGTCCAGCGCCGTCACAAGCGTTAAGGAGTAGGCAATGGCACGTTCTGTTAAAAAAGGTCCGTTCTGCGACGCCCATTTGCTGAAGAAAGTTGAGGC 1000
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
L Q L R A T R S R F1
G C S F A R Q E A X F2
A A A S R D K K P F3
1001 GGCTGCAGCTTCGCGCGACAAGAAGCCG 1028
----:----|----:----|----:---