BACT000030 (rplA) allele sequence: id-331
Contig position
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- yes
- method
- Illumina
Sequence
GACCAAGATG CCGGACCTCA CGGCAGCTGA TCTGGACGCA GCCGTTCGCA CCATCGCTGG TAGCGCACGC TCGATGGGCA TCACTGTGGA GGGCGTGTAA ATGGCTAAGA TCTCCAAGCG CCGTCAGGCA TTTGCCGCCA AGGTCGACCG TCAGAAGCTG TACGCGATCG ACGACGCACT GGCACTCGTG AAGGAATGCG CGAGCGCGAA GTTCAACGAG TCGATCGACG TCGCAGTCCA GCTCGGCATC GATGCGAAGA AGTCGGACCA GGTCGTTCGC GGTTCGGTCG TTCTGCCGGC CGGTACGGGC AAGTCGGTTC GCGTCGCCGT GTTCGCGCAA GGCGAGAAGG CCGAGCAGGC ACGTGCAGCA GGTGCGGAAG TCGTCGGTAT GGAAGACCTG GCCGAGCAGA TCAAGGCTGG CCAGATGGAC TTCGACATCG TGATCGCTTC GCCGGACACG ATGCGTATCG TCGGTACGCT CGGTCAGATC CTCGGCCCGC GCGGCCTGAT GCCGAACCCG AAGGTCGGCA CGGTCACGCC GGACGTCGCG ACCGCAGTCA AGAACGCGAA GGCAGGTCAG GTGCAGTTCC GCGTCGACAA GGCCGGTATC ATCCACGCGA CGATCGGCCG TGCATCGTTT GAACCGGCTG CGCTGCGTTC GAACCTGTCG GCGCTGATCG AAGCGCTGCA GAAGGCCAAG CCGGCAACGA GCAAGGGCGT CTACCTGCGC AAGATCGCAC TGTCGAGCAC GATGGGCGTC GGCGTGCGTG TCGACCAGGC TACGCTGGCT GCGCAGTAAG CATGAAATTC AGGCCGCTTC GTTCGCGAAG CGGTCTTCAA GGGCTTTGGG CGGTTGTTCG TGCAGTAGGC GGGCAACCGG TTATCAAAGA CCGTTGGTG
Translation
D Q D A G P H G S * S G R S R S H H R W * R T L D G H H C G G R V N F1
T K M P D L T A A D L D A A V R T I A G S A R S M G I T V E G V * F2
P R C R T S R Q L I W T Q P F A P S L V A H A R W A S L W R A C K F3
1 GACCAAGATGCCGGACCTCACGGCAGCTGATCTGGACGCAGCCGTTCGCACCATCGCTGGTAGCGCACGCTCGATGGGCATCACTGTGGAGGGCGTGTAA 100
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G * D L Q A P S G I C R Q G R P S E A V R D R R R T G T R E G M R F1
M A K I S K R R Q A F A A K V D R Q K L Y A I D D A L A L V K E C A F2
W L R S P S A V R H L P P R S T V R S C T R S T T H W H S * R N A F3
101 ATGGCTAAGATCTCCAAGCGCCGTCAGGCATTTGCCGCCAAGGTCGACCGTCAGAAGCTGTACGCGATCGACGACGCACTGGCACTCGTGAAGGAATGCG 200
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E R E V Q R V D R R R S P A R H R C E E V G P G R S R F G R S A G F1
S A K F N E S I D V A V Q L G I D A K K S D Q V V R G S V V L P A F2
R A R S S T S R S T S Q S S S A S M R R S R T R S F A V R S F C R P F3
201 CGAGCGCGAAGTTCAACGAGTCGATCGACGTCGCAGTCCAGCTCGGCATCGATGCGAAGAAGTCGGACCAGGTCGTTCGCGGTTCGGTCGTTCTGCCGGC 300
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R Y G Q V G S R R R V R A R R E G R A G T C S R C G S R R Y G R P G F1
G T G K S V R V A V F A Q G E K A E Q A R A A G A E V V G M E D L F2
V R A S R F A S P C S R K A R R P S R H V Q Q V R K S S V W K T W F3
301 CGGTACGGGCAAGTCGGTTCGCGTCGCCGTGTTCGCGCAAGGCGAGAAGGCCGAGCAGGCACGTGCAGCAGGTGCGGAAGTCGTCGGTATGGAAGACCTG 400
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R A D Q G W P D G L R H R D R F A G H D A Y R R Y A R S D P R P A F1
A E Q I K A G Q M D F D I V I A S P D T M R I V G T L G Q I L G P R F2
P S R S R L A R W T S T S * S L R R T R C V S S V R S V R S S A R F3
401 GCCGAGCAGATCAAGGCTGGCCAGATGGACTTCGACATCGTGATCGCTTCGCCGGACACGATGCGTATCGTCGGTACGCTCGGTCAGATCCTCGGCCCGC 500
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R P D A E P E G R H G H A G R R D R S Q E R E G R S G A V P R R Q F1
G L M P N P K V G T V T P D V A T A V K N A K A G Q V Q F R V D K F2
A A * C R T R R S A R S R R T S R P Q S R T R R Q V R C S S A S T R F3
501 GCGGCCTGATGCCGAACCCGAAGGTCGGCACGGTCACGCCGGACGTCGCGACCGCAGTCAAGAACGCGAAGGCAGGTCAGGTGCAGTTCCGCGTCGACAA 600
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G R Y H P R D D R P C I V * T G C A A F E P V G A D R S A A E G Q A F1
A G I I H A T I G R A S F E P A A L R S N L S A L I E A L Q K A K F2
P V S S T R R S A V H R L N R L R C V R T C R R * S K R C R R P S F3
601 GGCCGGTATCATCCACGCGACGATCGGCCGTGCATCGTTTGAACCGGCTGCGCTGCGTTCGAACCTGTCGGCGCTGATCGAAGCGCTGCAGAAGGCCAAG 700
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G N E Q G R L P A Q D R T V E H D G R R R A C R P G Y A G C A V S F1
P A T S K G V Y L R K I A L S S T M G V G V R V D Q A T L A A Q * A F2
R Q R A R A S T C A R S H C R A R W A S A C V S T R L R W L R S K F3
701 CCGGCAACGAGCAAGGGCGTCTACCTGCGCAAGATCGCACTGTCGAGCACGATGGGCGTCGGCGTGCGTGTCGACCAGGCTACGCTGGCTGCGCAGTAAG 800
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M K F R P L R S R S G L Q G L W A V V R A V G G Q P V I K D R W X F1
* N S G R F V R E A V F K G F G R L F V Q * A G N R L S K T V G X F2
H E I Q A A S F A K R S S R A L G G C S C S R R A T G Y Q R P L V F3
801 CATGAAATTCAGGCCGCTTCGTTCGCGAAGCGGTCTTCAAGGGCTTTGGGCGGTTGTTCGTGCAGTAGGCGGGCAACCGGTTATCAAAGACCGTTGGTG 899
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