BACT000020 (rpsT) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3634
- contig length
- 222168
- start
- 113591
- end
- 113863
- length
- 273
- orientation
- reverse
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
TTATGCGCCC CTGGGCAATC GTTCTCAGGG GACGGATCGA AAAGCAGCGC TTGGCCGTCA GGCTCCAAGC TCTGGAAACA GGACAGGATA AGGAACCGTC ATGGCTAACT CCGCACAAGC ACGCAAGCGC GCCCGCCAGG CCGCGAAGGC AAACTCGCAC AACTCGGCGC TGCGCTCGAA ATTCCGTACC GCGATCAAGG CTGTTCGCAA GGCCGTCGAC GCCGGCGACC AGGCAAAGGC TGCCGAGCTG TTCAAGGCTG CCGTCAAGAC GATCGACACG ATCGCCGACA AGAAGATCGT TCACAAGAAC AAGGCCGCTC GCAGCAAGAG CCGCCTCGCC GCAGCCGTCA AGGGCCTGCA GGCAGCAGCG TAAATTCCGG CGTGCCCGCC TCGTGCGGGC ACTCCTGTTT CCTGCGATCG CAAAAAAGCC CGCTTCGGCG GGCTTTTTTG CGTGGGCGCT GCATGCCTGC GCG
Translation
L C A P G Q S F S G D G S K S S A W P S G S K L W K Q D R I R N R H F1
Y A P L G N R S Q G T D R K A A L G R Q A P S S G N R T G * G T V F2
M R P W A I V L R G R I E K Q R L A V R L Q A L E T G Q D K E P S F3
1 TTATGCGCCCCTGGGCAATCGTTCTCAGGGGACGGATCGAAAAGCAGCGCTTGGCCGTCAGGCTCCAAGCTCTGGAAACAGGACAGGATAAGGAACCGTC 100
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
G * L R T S T Q A R P P G R E G K L A Q L G A A L E I P Y R D Q G F1
M A N S A Q A R K R A R Q A A K A N S H N S A L R S K F R T A I K A F2
W L T P H K H A S A P A R P R R Q T R T T R R C A R N S V P R S R F3
101 ATGGCTAACTCCGCACAAGCACGCAAGCGCGCCCGCCAGGCCGCGAAGGCAAACTCGCACAACTCGGCGCTGCGCTCGAAATTCCGTACCGCGATCAAGG 200
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
C S Q G R R R R R P G K G C R A V Q G C R Q D D R H D R R Q E D R F1
V R K A V D A G D Q A K A A E L F K A A V K T I D T I A D K K I V F2
L F A R P S T P A T R Q R L P S C S R L P S R R S T R S P T R R S F F3
201 CTGTTCGCAAGGCCGTCGACGCCGGCGACCAGGCAAAGGCTGCCGAGCTGTTCAAGGCTGCCGTCAAGACGATCGACACGATCGCCGACAAGAAGATCGT 300
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S Q E Q G R S Q Q E P P R R S R Q G P A G S S V N S G V P A S C G H F1
H K N K A A R S K S R L A A A V K G L Q A A A * I P A C P P R A G F2
T R T R P L A A R A A S P Q P S R A C R Q Q R K F R R A R L V R A F3
301 TCACAAGAACAAGGCCGCTCGCAGCAAGAGCCGCCTCGCCGCAGCCGTCAAGGGCCTGCAGGCAGCAGCGTAAATTCCGGCGTGCCCGCCTCGTGCGGGC 400
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|
S C F L R S Q K S P L R R A F L R G R C M P A R F1
T P V S C D R K K A R F G G L F C V G A A C L R X F2
L L F P A I A K K P A S A G F F A W A L H A C A F3
401 ACTCCTGTTTCCTGCGATCGCAAAAAAGCCCGCTTCGGCGGGCTTTTTTGCGTGGGCGCTGCATGCCTGCGCG 473
----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|---