BACT000019 (rpsS) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 3321
- end
- 3596
- length
- 276
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AGCCCGTGGG GCACGCCGAC GAAGGGCTTC CGTACGCGTC GCAACAAGCG CACGACGACG ATGATCGTCC AGCGCCGTCA CAAGCGTTAA GGAGTAGGCA ATGGCACGTT CTGTTAAAAA AGGTCCGTTC TGCGACGCCC ATTTGCTGAA GAAAGTTGAG GCGGCTGCAG CTTCGCGCGA CAAGAAGCCG ATCAAGACCT GGTCGCGTCG CTCGACGATC CTCCCGGATT TCATCGGCCT GACGATCGCC GTTCACAACG GCCGTCAACA CGTTCCGGTG TACATCTCGG AAAACATGGT CGGCCACAAG CTTGGCGAGT TCGCACTGAC CCGTACGTTC AAGGGTCACG CGGCCGACAA GAAGGCCAAG AAATAAGGGG CTATCAAGAT GGAAGTGAAA GCAATTCATC GCGGTGCCCG CATCTCGGCG CAAAAGACGC GCCTTGTGGC TGACCAGATC CGCGGTTTGC CGGTCG
Translation
S P W G T P T K G F R T R R N K R T T T M I V Q R R H K R * G V G N F1
A R G A R R R R A S V R V A T S A R R R * S S S A V T S V K E * A F2
P V G H A D E G L P Y A S Q Q A H D D D D R P A P S Q A L R S R Q F3
1 AGCCCGTGGGGCACGCCGACGAAGGGCTTCCGTACGCGTCGCAACAAGCGCACGACGACGATGATCGTCCAGCGCCGTCACAAGCGTTAAGGAGTAGGCA 100
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G T F C * K R S V L R R P F A E E S * G G C S F A R Q E A D Q D L F1
M A R S V K K G P F C D A H L L K K V E A A A A S R D K K P I K T W F2
W H V L L K K V R S A T P I C * R K L R R L Q L R A T R S R S R P F3
101 ATGGCACGTTCTGTTAAAAAAGGTCCGTTCTGCGACGCCCATTTGCTGAAGAAAGTTGAGGCGGCTGCAGCTTCGCGCGACAAGAAGCCGATCAAGACCT 200
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V A S L D D P P G F H R P D D R R S Q R P S T R S G V H L G K H G F1
S R R S T I L P D F I G L T I A V H N G R Q H V P V Y I S E N M V F2
G R V A R R S S R I S S A * R S P F T T A V N T F R C T S R K T W S F3
201 GGTCGCGTCGCTCGACGATCCTCCCGGATTTCATCGGCCTGACGATCGCCGTTCACAACGGCCGTCAACACGTTCCGGTGTACATCTCGGAAAACATGGT 300
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R P Q A W R V R T D P Y V Q G S R G R Q E G Q E I R G Y Q D G S E S F1
G H K L G E F A L T R T F K G H A A D K K A K K * G A I K M E V K F2
A T S L A S S H * P V R S R V T R P T R R P R N K G L S R W K * K F3
301 CGGCCACAAGCTTGGCGAGTTCGCACTGACCCGTACGTTCAAGGGTCACGCGGCCGACAAGAAGGCCAAGAAATAAGGGGCTATCAAGATGGAAGTGAAA 400
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N S S R C P H L G A K D A P C G * P D P R F A G R F1
A I H R G A R I S A Q K T R L V A D Q I R G L P V X F2
Q F I A V P A S R R K R R A L W L T R S A V C R S F3
401 GCAATTCATCGCGGTGCCCGCATCTCGGCGCAAAAGACGCGCCTTGTGGCTGACCAGATCCGCGGTTTGCCGGTCG 476
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