BACT000018 (rpsR) allele sequence: id-331

Contig position

sequence bin id
3670
contig length
229761
start
90024
end
90299
length
276
orientation
reverse
complete
yes
method
Illumina
Options

Sequence

TCGAGACGCT GTTCACGGGC TTCCTGGCAA AGAAAAGCCG CAACGCGCGA ACCTTGGTGT TTCACATCAC AGCATTGCAG GACATTGGAA AGGACTGAAC ATGGCCCGCC CCACTGGTAA GAAATTCGAC AAGCGTCGTC AGCAACAAAA CCCGCTCTTC AAGCGCAAGA AGTTCTGCCG CTTCACGGCA GCCGGCGTCG AGCAGATCGA CTACAAGGAC ACGGAAACGC TGAAGGACTT CATCGGCGAA AACGGCAAGA TCACGCCGGC ACGTCTGACG GGTACGAAGG CGCACTATCA GCGTCAGCTG GACACGGCAA TCAAGCGCGC ACGCTTCCTC GCGCTGCTGC CGTACACCGA TCAGCACAAG GCGTAATCAG GCGACGCAAT AAGGAGAATT CGAATGCAAA TCATTCTGTT GGAAAAAGTC GCCAATCTGG GCAACCTCGG CGATATCGTC AAGGTCAAGG ACGGTT

Translation


          S  R  R  C  S  R  A  S  W  Q  R  K  A  A  T  R  E  P  W  C  F  T  S  Q  H  C  R  T  L  E  R  T  E  H   F1
           R  D  A  V  H  G  L  P  G  K  E  K  P  Q  R  A  N  L  G  V  S  H  H  S  I  A  G  H  W  K  G  L  N     F2
            E  T  L  F  T  G  F  L  A  K  K  S  R  N  A  R  T  L  V  F  H  I  T  A  L  Q  D  I  G  K  D  *  T    F3
        1 TCGAGACGCTGTTCACGGGCTTCCTGGCAAAGAAAAGCCGCAACGCGCGAACCTTGGTGTTTCACATCACAGCATTGCAGGACATTGGAAAGGACTGAAC 100
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            G  P  P  H  W  *  E  I  R  Q  A  S  S  A  T  K  P  A  L  Q  A  Q  E  V  L  P  L  H  G  S  R  R  R    F1
          M  A  R  P  T  G  K  K  F  D  K  R  R  Q  Q  Q  N  P  L  F  K  R  K  K  F  C  R  F  T  A  A  G  V  E   F2
           W  P  A  P  L  V  R  N  S  T  S  V  V  S  N  K  T  R  S  S  S  A  R  S  S  A  A  S  R  Q  P  A  S     F3
      101 ATGGCCCGCCCCACTGGTAAGAAATTCGACAAGCGTCGTCAGCAACAAAACCCGCTCTTCAAGCGCAAGAAGTTCTGCCGCTTCACGGCAGCCGGCGTCG 200
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

           A  D  R  L  Q  G  H  G  N  A  E  G  L  H  R  R  K  R  Q  D  H  A  G  T  S  D  G  Y  E  G  A  L  S     F1
            Q  I  D  Y  K  D  T  E  T  L  K  D  F  I  G  E  N  G  K  I  T  P  A  R  L  T  G  T  K  A  H  Y  Q    F2
          S  R  S  T  T  R  T  R  K  R  *  R  T  S  S  A  K  T  A  R  S  R  R  H  V  *  R  V  R  R  R  T  I  S   F3
      201 AGCAGATCGACTACAAGGACACGGAAACGCTGAAGGACTTCATCGGCGAAAACGGCAAGATCACGCCGGCACGTCTGACGGGTACGAAGGCGCACTATCA 300
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

          A  S  A  G  H  G  N  Q  A  R  T  L  P  R  A  A  A  V  H  R  S  A  Q  G  V  I  R  R  R  N  K  E  N  S   F1
           R  Q  L  D  T  A  I  K  R  A  R  F  L  A  L  L  P  Y  T  D  Q  H  K  A  *  S  G  D  A  I  R  R  I     F2
            V  S  W  T  R  Q  S  S  A  H  A  S  S  R  C  C  R  T  P  I  S  T  R  R  N  Q  A  T  Q  *  G  E  F    F3
      301 GCGTCAGCTGGACACGGCAATCAAGCGCGCACGCTTCCTCGCGCTGCTGCCGTACACCGATCAGCACAAGGCGTAATCAGGCGACGCAATAAGGAGAATT 400
          ----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|----:----|

            N  A  N  H  S  V  G  K  S  R  Q  S  G  Q  P  R  R  Y  R  Q  G  Q  G  R  X                            F1
          R  M  Q  I  I  L  L  E  K  V  A  N  L  G  N  L  G  D  I  V  K  V  K  D  G  X                           F2
           E  C  K  S  F  C  W  K  K  S  P  I  W  A  T  S  A  I  S  S  R  S  R  T  V                             F3
      401 CGAATGCAAATCATTCTGTTGGAAAAAGTCGCCAATCTGGGCAACCTCGGCGATATCGTCAAGGTCAAGGACGGTT 476
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