BACT000017 (rpsQ) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 5370
- end
- 5642
- length
- 273
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
AACTCGCGAC CCAGCAGCTC ACGAACACGA GCCAGCTGAA GAAGGTTCGT CGCGACATCG CACGTGTGCG GACCGTCATG ACTCAGAAGG CGAACCAGAA ATGAACGATA GCGTGAAAAC CTCGCTGAAG CGGACGCTGA TCGGTCGGGT CGTCAGCAAC AAGATGGACA AGACCGTCAC CGTGCTGGTC GAGCACCGCG TCAAGCACCC GATCTACGGC AAGTATGTCG TGCGTTCGAA GAAGTACCAC GCGCACGATG AAGCGAACAC CTACAACGAA GGCGATCTCG TCGAAATCCA GGAAACCCGT CCTGTTTCGA AGACGAAGGC CTGGGCGGTG GCGCGTCTCG TCGAGGCAGC CCGCGTTATC TGAGCGGGTC AGAGCAGTAG AGCAGTAACG GGCACTTCTC CACGAAGTGC TTGAAATCGC AAAGTTTTTG CTTGCGTGAC CGGGATTATT TGTTATAATC CCG
Translation
N S R P S S S R T R A S * R R F V A T S H V C G P S * L R R R T R N F1
T R D P A A H E H E P A E E G S S R H R T C A D R H D S E G E P E F2
L A T Q Q L T N T S Q L K K V R R D I A R V R T V M T Q K A N Q K F3
1 AACTCGCGACCCAGCAGCTCACGAACACGAGCCAGCTGAAGAAGGTTCGTCGCGACATCGCACGTGTGCGGACCGTCATGACTCAGAAGGCGAACCAGAA 100
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E R * R E N L A E A D A D R S G R Q Q Q D G Q D R H R A G R A P R F1
M N D S V K T S L K R T L I G R V V S N K M D K T V T V L V E H R V F2
* T I A * K P R * S G R * S V G S S A T R W T R P S P C W S S T A F3
101 ATGAACGATAGCGTGAAAACCTCGCTGAAGCGGACGCTGATCGGTCGGGTCGTCAGCAACAAGATGGACAAGACCGTCACCGTGCTGGTCGAGCACCGCG 200
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Q A P D L R Q V C R A F E E V P R A R * S E H L Q R R R S R R N P F1
K H P I Y G K Y V V R S K K Y H A H D E A N T Y N E G D L V E I Q F2
S S T R S T A S M S C V R R S T T R T M K R T P T T K A I S S K S R F3
201 TCAAGCACCCGATCTACGGCAAGTATGTCGTGCGTTCGAAGAAGTACCACGCGCACGATGAAGCGAACACCTACAACGAAGGCGATCTCGTCGAAATCCA 300
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G N P S C F E D E G L G G G A S R R G S P R Y L S G S E Q * S S N G F1
E T R P V S K T K A W A V A R L V E A A R V I * A G Q S S R A V T F2
K P V L F R R R R P G R W R V S S R Q P A L S E R V R A V E Q * R F3
301 GGAAACCCGTCCTGTTTCGAAGACGAAGGCCTGGGCGGTGGCGCGTCTCGTCGAGGCAGCCCGCGTTATCTGAGCGGGTCAGAGCAGTAGAGCAGTAACG 400
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H F S T K C L K S Q S F C L R D R D Y L L * S R F1
G T S P R S A * N R K V F A C V T G I I C Y N P X F2
A L L H E V L E I A K F L L A * P G L F V I I P F3
401 GGCACTTCTCCACGAAGTGCTTGAAATCGCAAAGTTTTTGCTTGCGTGACCGGGATTATTTGTTATAATCCCG 473
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