BACT000016 (rpsP) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3631
- contig length
- 188069
- start
- 5413
- end
- 5667
- length
- 255
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CCGCGGATTT TTTGCGCGTA AGTGTTTGTT GTACCTCCAG TTTCCGGCTA TAATCGCGTG TTTCAGTAGT TTCGAACCCG GTTTTCCCGA AGGATTTCAT ATGGTTATCA TCCGTCTGGC TCGCGGCGGC TCGAAGAAGC GCCCGTTCTA CAACATCGTT GCTACCGATT CGCGCAACCG TCGTGACGGC CGCTTCATCG AGCGCGTCGG CTTCTACAAC CCGGTCGCGA CGAAGGGCGA AGCGCTGCGT ATCGCTCAAG ATCGTCTGAC GTACTGGCAA GGCGTTGGCG CGCAACTGTC GCCGACCGTC CAGCGTCTCG TGAAGGAAGC GCAAAAGGCG CAGCCGGCTG CCTGACATGG CGCGGTGTGC CGGTCGTGCC GGCTGTGAGG TGTATTGATG TCGGATCACG ATTCCGGTAA TGCAAGGCGC GGGCGGGCGT CGTTCGGCGC ATTCG
Translation
P R I F C A * V F V V P P V S G Y N R V F Q * F R T R F S R R I S Y F1
R G F F A R K C L L Y L Q F P A I I A C F S S F E P G F P E G F H F2
A D F L R V S V C C T S S F R L * S R V S V V S N P V F P K D F I F3
1 CCGCGGATTTTTTGCGCGTAAGTGTTTGTTGTACCTCCAGTTTCCGGCTATAATCGCGTGTTTCAGTAGTTTCGAACCCGGTTTTCCCGAAGGATTTCAT 100
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G Y H P S G S R R L E E A P V L Q H R C Y R F A Q P S * R P L H R F1
M V I I R L A R G G S K K R P F Y N I V A T D S R N R R D G R F I E F2
W L S S V W L A A A R R S A R S T T S L L P I R A T V V T A A S S F3
101 ATGGTTATCATCCGTCTGGCTCGCGGCGGCTCGAAGAAGCGCCCGTTCTACAACATCGTTGCTACCGATTCGCGCAACCGTCGTGACGGCCGCTTCATCG 200
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A R R L L Q P G R D E G R S A A Y R S R S S D V L A R R W R A T V F1
R V G F Y N P V A T K G E A L R I A Q D R L T Y W Q G V G A Q L S F2
S A S A S T T R S R R R A K R C V S L K I V * R T G K A L A R N C R F3
201 AGCGCGTCGGCTTCTACAACCCGGTCGCGACGAAGGGCGAAGCGCTGCGTATCGCTCAAGATCGTCTGACGTACTGGCAAGGCGTTGGCGCGCAACTGTC 300
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A D R P A S R E G S A K G A A G C L T W R G V P V V P A V R C I D V F1
P T V Q R L V K E A Q K A Q P A A * H G A V C R S C R L * G V L M F2
R P S S V S * R K R K R R S R L P D M A R C A G R A G C E V Y * C F3
301 GCCGACCGTCCAGCGTCTCGTGAAGGAAGCGCAAAAGGCGCAGCCGGCTGCCTGACATGGCGCGGTGTGCCGGTCGTGCCGGCTGTGAGGTGTATTGATG 400
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G S R F R * C K A R A G V V R R I R F1
S D H D S G N A R R G R A S F G A F X F2
R I T I P V M Q G A G G R R S A H S F3
401 TCGGATCACGATTCCGGTAATGCAAGGCGCGGGCGGGCGTCGTTCGGCGCATTCG 455
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