BACT000014 (rpsN) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 7205
- end
- 7510
- length
- 306
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGTGGGCTGA ACATCAGCAT CACGACGACC GCGAAGACCG ACGACGAAGC AAAGGCGCTG CTCGCCAGCT TCAAGTTCCC GTTCAGAAAC TGAGGTTACC GTGGCTAAAC TGGCACTGAT CGAACGTGAA AAGAAGCGCG CCCGCCTGGT CGCGAAGTTC GCAGCAAAGC GCGAAGCGCT GAAGGCGATC ATCGAAGACC AAAGCAAGTC GGAAGAAGAG CGCTACGAAG CACGCCTTGA GCTGCAGCAA CTGCCCCGCA ACGCAAACCC GACCCGCCAG CGCAACCGCT GCGCGATCAC GGGCCGTCCG CGTGGCACGT TCCGCAAATT CGGCCTCGCG CGCAACAAGA TTCGTGAAAT CGCATTCCGT GGCGAGATTC CTGGCCTGAC CAAGGCGAGC TGGTAATAGG AGAAACGTAA ATGAGCATGA GTGATCCTAT CGCCGATATG CTGACTCGCA TCCGCAACGC GCAGATGGTC GAGAAGGTAT CGGTCGCGAT GCCCTC
Translation
R G L N I S I T T T A K T D D E A K A L L A S F K F P F R N * G Y R F1
V G * T S A S R R P R R P T T K Q R R C S P A S S S R S E T E V T F2
W A E H Q H H D D R E D R R R S K G A A R Q L Q V P V Q K L R L P F3
1 CGTGGGCTGAACATCAGCATCACGACGACCGCGAAGACCGACGACGAAGCAAAGGCGCTGCTCGCCAGCTTCAAGTTCCCGTTCAGAAACTGAGGTTACC 100
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G * T G T D R T * K E A R P P G R E V R S K A R S A E G D H R R P F1
V A K L A L I E R E K K R A R L V A K F A A K R E A L K A I I E D Q F2
W L N W H * S N V K R S A P A W S R S S Q Q S A K R * R R S S K T F3
101 GTGGCTAAACTGGCACTGATCGAACGTGAAAAGAAGCGCGCCCGCCTGGTCGCGAAGTTCGCAGCAAAGCGCGAAGCGCTGAAGGCGATCATCGAAGACC 200
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K Q V G R R A L R S T P * A A A T A P Q R K P D P P A Q P L R D H F1
S K S E E E R Y E A R L E L Q Q L P R N A N P T R Q R N R C A I T F2
K A S R K K S A T K H A L S C S N C P A T Q T R P A S A T A A R S R F3
201 AAAGCAAGTCGGAAGAAGAGCGCTACGAAGCACGCCTTGAGCTGCAGCAACTGCCCCGCAACGCAAACCCGACCCGCCAGCGCAACCGCTGCGCGATCAC 300
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G P S A W H V P Q I R P R A Q Q D S * N R I P W R D S W P D Q G E L F1
G R P R G T F R K F G L A R N K I R E I A F R G E I P G L T K A S F2
A V R V A R S A N S A S R A T R F V K S H S V A R F L A * P R R A F3
301 GGGCCGTCCGCGTGGCACGTTCCGCAAATTCGGCCTCGCGCGCAACAAGATTCGTGAAATCGCATTCCGTGGCGAGATTCCTGGCCTGACCAAGGCGAGC 400
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V I G E T * M S M S D P I A D M L T R I R N A Q M V E K V S V A M F1
W * * E K R K * A * V I L S P I C * L A S A T R R W S R R Y R S R C F2
G N R R N V N E H E * S Y R R Y A D S H P Q R A D G R E G I G R D F3
401 TGGTAATAGGAGAAACGTAAATGAGCATGAGTGATCCTATCGCCGATATGCTGACTCGCATCCGCAACGCGCAGATGGTCGAGAAGGTATCGGTCGCGAT 500
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P S F1
P X F2
A L F3
501 GCCCTC 506
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