BACT000013 (rpsM) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 11834
- end
- 12199
- length
- 366
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
GCAAAGGCGT CGTTCGCGTG ATCTGCAGCT CGGATCCGCG CCACAAGCAG CGCCAAGGCT GACCGCGCGT TTGTTTGCGC TTTTTGTTTG AGGAAAAACA ATGGCTCGTA TCGCAGGGGT TAACATCCCG AATCACCAGC ATACCGAGAT CGGCCTGACG GCAATCTTCG GTATCGGCCG CACCCGTTCG CGCAGCATCT GCGTGGCAGC TGGCGTCGAT TTTTCGAAGA AGGTCAAGGA TCTGACCGAC GCAGACTTGG AAAAGCTGCG TGAAGAAGTG GGCAAGTTTG TCGTCGAAGG CGATCTGCGC CGTGAAGTGA CGATGAACAT CAAGCGCCTG ATGGATCTCG GTTGCTACCG TGGCGTTCGT CATCGCAAGG GCCTGCCGAT GCGCGGTCAG CGTACGCGTA CGAACGCACG TACCCGCAAG GGTCCGCGTC GTGCAGCGCA AGCGCTGAAG AAGTAAGCGG AACTGACAGT TACAGGAAAA CGTAATGGCT AAGGCTTCGA ACACCGCGGC GCAACGCGTT CGCAAGAAGG TTAAGAAGAA CGTCGCTGAA GGCGTG
Translation
A K A S F A * S A A R I R A T S S A K A D R A F V C A F C L R K N N F1
Q R R R S R D L Q L G S A P Q A A P R L T A R L F A L F V * G K T F2
K G V V R V I C S S D P R H K Q R Q G * P R V C L R F L F E E K Q F3
1 GCAAAGGCGTCGTTCGCGTGATCTGCAGCTCGGATCCGCGCCACAAGCAGCGCCAAGGCTGACCGCGCGTTTGTTTGCGCTTTTTGTTTGAGGAAAAACA 100
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G S Y R R G * H P E S P A Y R D R P D G N L R Y R P H P F A Q H L F1
M A R I A G V N I P N H Q H T E I G L T A I F G I G R T R S R S I C F2
W L V S Q G L T S R I T S I P R S A * R Q S S V S A A P V R A A S F3
101 ATGGCTCGTATCGCAGGGGTTAACATCCCGAATCACCAGCATACCGAGATCGGCCTGACGGCAATCTTCGGTATCGGCCGCACCCGTTCGCGCAGCATCT 200
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R G S W R R F F E E G Q G S D R R R L G K A A * R S G Q V C R R R F1
V A A G V D F S K K V K D L T D A D L E K L R E E V G K F V V E G F2
A W Q L A S I F R R R S R I * P T Q T W K S C V K K W A S L S S K A F3
201 GCGTGGCAGCTGGCGTCGATTTTTCGAAGAAGGTCAAGGATCTGACCGACGCAGACTTGGAAAAGCTGCGTGAAGAAGTGGGCAAGTTTGTCGTCGAAGG 300
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R S A P * S D D E H Q A P D G S R L L P W R S S S Q G P A D A R S A F1
D L R R E V T M N I K R L M D L G C Y R G V R H R K G L P M R G Q F2
I C A V K * R * T S S A * W I S V A T V A F V I A R A C R C A V S F3
301 CGATCTGCGCCGTGAAGTGACGATGAACATCAAGCGCCTGATGGATCTCGGTTGCTACCGTGGCGTTCGTCATCGCAAGGGCCTGCCGATGCGCGGTCAG 400
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Y A Y E R T Y P Q G S A S C S A S A E E V S G T D S Y R K T * W L F1
R T R T N A R T R K G P R R A A Q A L K K * A E L T V T G K R N G * F2
V R V R T H V P A R V R V V Q R K R * R S K R N * Q L Q E N V M A F3
401 CGTACGCGTACGAACGCACGTACCCGCAAGGGTCCGCGTCGTGCAGCGCAAGCGCTGAAGAAGTAAGCGGAACTGACAGTTACAGGAAAACGTAATGGCT 500
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R L R T P R R N A F A R R L R R T S L K A X F1
G F E H R G A T R S Q E G * E E R R * R R X F2
K A S N T A A Q R V R K K V K K N V A E G V F3
501 AAGGCTTCGAACACCGCGGCGCAACGCGTTCGCAAGAAGGTTAAGAAGAACGTCGCTGAAGGCGTG 566
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