BACT000010 (rpsJ) allele sequence: id-331
Contig position
- sequence bin id
- 3651
- contig length
- 215670
- start
- 410
- end
- 721
- length
- 312
- orientation
- forward
- complete
- yes
- method
- Illumina
Sequence
CGTCCCGGGA CATCGTGCCT CGCACCCCGC AGGTGCGCTG TCTTGCGTTC TTTTAGTGTC CGGCGATGCA ATATCGCCTC GCTCTTTTCA AGGAATCGTC ATGCAGCAAC AGAAAATCCG CATTCGCCTG AAGGCTTTCG ACTATCGCCT GATCGATCAA TCGGCTGCCG AGATCGTCGA TACCGCGAAG CGGACTGGTG CAATCGTCCG TGGCCCGGTG CCGCTGCCGA CGCGCATCCA GCGTTTTGAC ATCCTGCGTT CGCCGCACGT CAACAAGACG TCGCGCGACC AGCTCGAGAT CCGTACCCAC CAGCGTCTGA TGGACATCGT CGACCCGACC GACAAGACGG TCGACGCGCT GATGAAGCTC GACCTGCCGG CTGGCGTCGA CGTGGAAATC AAGCTGCAGT AAGGCTTTCG GCGCCTTCCG GGGTTCCGGA GGGTGCTAAG TCTTTGATTG CTTGCAGAAA ACGGGAAGCC TTGCTACAAT GCTAGGCTTT TCGCGCATTC GC
Translation
R P G T S C L A P R R C A V L R S F S V R R C N I A S L F S R N R H F1
V P G H R A S H P A G A L S C V L L V S G D A I S P R S F Q G I V F2
S R D I V P R T P Q V R C L A F F * C P A M Q Y R L A L F K E S S F3
1 CGTCCCGGGACATCGTGCCTCGCACCCCGCAGGTGCGCTGTCTTGCGTTCTTTTAGTGTCCGGCGATGCAATATCGCCTCGCTCTTTTCAAGGAATCGTC 100
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A A T E N P H S P E G F R L S P D R S I G C R D R R Y R E A D W C F1
M Q Q Q K I R I R L K A F D Y R L I D Q S A A E I V D T A K R T G A F2
C S N R K S A F A * R L S T I A * S I N R L P R S S I P R S G L V F3
101 ATGCAGCAACAGAAAATCCGCATTCGCCTGAAGGCTTTCGACTATCGCCTGATCGATCAATCGGCTGCCGAGATCGTCGATACCGCGAAGCGGACTGGTG 200
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N R P W P G A A A D A H P A F * H P A F A A R Q Q D V A R P A R D F1
I V R G P V P L P T R I Q R F D I L R S P H V N K T S R D Q L E I F2
Q S S V A R C R C R R A S S V L T S C V R R T S T R R R A T S S R S F3
201 CAATCGTCCGTGGCCCGGTGCCGCTGCCGACGCGCATCCAGCGTTTTGACATCCTGCGTTCGCCGCACGTCAACAAGACGTCGCGCGACCAGCTCGAGAT 300
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P Y P P A S D G H R R P D R Q D G R R A D E A R P A G W R R R G N Q F1
R T H Q R L M D I V D P T D K T V D A L M K L D L P A G V D V E I F2
V P T S V * W T S S T R P T R R S T R * * S S T C R L A S T W K S F3
301 CCGTACCCACCAGCGTCTGATGGACATCGTCGACCCGACCGACAAGACGGTCGACGCGCTGATGAAGCTCGACCTGCCGGCTGGCGTCGACGTGGAAATC 400
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A A V R L S A P S G V P E G A K S L I A C R K R E A L L Q C * A F F1
K L Q * G F R R L P G F R R V L S L * L L A E N G K P C Y N A R L F F2
S C S K A F G A F R G S G G C * V F D C L Q K T G S L A T M L G F F3
401 AAGCTGCAGTAAGGCTTTCGGCGCCTTCCGGGGTTCCGGAGGGTGCTAAGTCTTTGATTGCTTGCAGAAAACGGGAAGCCTTGCTACAATGCTAGGCTTT 500
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R A F A F1
A H S X F2
S R I R F3
501 TCGCGCATTCGC 512
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